MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bifidobacterium animalis subsp. lactis Bi-07 chromosome

Total Repeats: 5339

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_017867	GAC	2	6	1592318	1592323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4002	NC_017867	TCC	2	6	1593128	1593133	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4003	NC_017867	TATC	2	8	1593139	1593146	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4004	NC_017867	GT	3	6	1594922	1594927	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4005	NC_017867	CCGC	2	8	1595019	1595026	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4006	NC_017867	AGC	2	6	1595042	1595047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4007	NC_017867	CGG	2	6	1595106	1595111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4008	NC_017867	GC	3	6	1595120	1595125	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4009	NC_017867	CG	3	6	1595411	1595416	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4010	NC_017867	ATCG	2	8	1595442	1595449	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4011	NC_017867	CGC	2	6	1596533	1596538	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4012	NC_017867	CG	3	6	1596542	1596547	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4013	NC_017867	GTG	2	6	1596610	1596615	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4014	NC_017867	ATT	2	6	1596618	1596623	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4015	NC_017867	CCCT	2	8	1599103	1599110	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
4016	NC_017867	TCT	2	6	1599217	1599222	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4017	NC_017867	TTC	2	6	1599236	1599241	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4018	NC_017867	GTT	2	6	1599248	1599253	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4019	NC_017867	AGG	2	6	1599284	1599289	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4020	NC_017867	TA	3	6	1600840	1600845	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4021	NC_017867	TC	3	6	1601278	1601283	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4022	NC_017867	TCGT	2	8	1601290	1601297	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4023	NC_017867	CG	3	6	1601332	1601337	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4024	NC_017867	TTTCA	2	10	1603394	1603403	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
4025	NC_017867	CCA	2	6	1603442	1603447	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4026	NC_017867	TCA	2	6	1604058	1604063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4027	NC_017867	TAT	2	6	1604083	1604088	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4028	NC_017867	CG	3	6	1604091	1604096	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4029	NC_017867	AACG	2	8	1604102	1604109	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4030	NC_017867	GGCA	2	8	1604116	1604123	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4031	NC_017867	GAAT	2	8	1604176	1604183	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_017867	GCC	2	6	1604691	1604696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4033	NC_017867	GCA	2	6	1604737	1604742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4034	NC_017867	CA	3	6	1604880	1604885	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4035	NC_017867	GGT	2	6	1606039	1606044	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4036	NC_017867	ACC	2	6	1606062	1606067	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4037	NC_017867	TTG	2	6	1606072	1606077	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4038	NC_017867	CAA	2	6	1606081	1606086	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4039	NC_017867	GCC	2	6	1606089	1606094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4040	NC_017867	TAT	2	6	1606159	1606164	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4041	NC_017867	CA	3	6	1606246	1606251	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4042	NC_017867	GAG	2	6	1607897	1607902	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4043	NC_017867	CTC	2	6	1607946	1607951	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4044	NC_017867	GAA	2	6	1608016	1608021	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4045	NC_017867	AT	3	6	1608055	1608060	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4046	NC_017867	CAAA	2	8	1608100	1608107	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4047	NC_017867	ATAG	2	8	1608137	1608144	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4048	NC_017867	ATT	2	6	1608636	1608641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4049	NC_017867	ATT	2	6	1608704	1608709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4050	NC_017867	TGC	2	6	1608818	1608823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4051	NC_017867	AGG	2	6	1608834	1608839	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4052	NC_017867	GCT	2	6	1608986	1608991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4053	NC_017867	GAA	2	6	1609002	1609007	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4054	NC_017867	CTC	2	6	1611399	1611404	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4055	NC_017867	GTC	2	6	1611430	1611435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4056	NC_017867	TCG	2	6	1611449	1611454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4057	NC_017867	GTA	2	6	1611500	1611505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4058	NC_017867	A	6	6	1613216	1613221	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4059	NC_017867	CCA	2	6	1613261	1613266	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4060	NC_017867	GCG	2	6	1613298	1613303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4061	NC_017867	TGCGG	2	10	1613337	1613346	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
4062	NC_017867	TGC	2	6	1613472	1613477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4063	NC_017867	AAG	2	6	1613483	1613488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4064	NC_017867	GAAC	2	8	1613518	1613525	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4065	NC_017867	ATG	2	6	1615953	1615958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4066	NC_017867	CCG	2	6	1615962	1615967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4067	NC_017867	GCG	2	6	1615972	1615977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4068	NC_017867	ATCG	2	8	1617062	1617069	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4069	NC_017867	CAG	2	6	1617074	1617079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4070	NC_017867	AGT	2	6	1617154	1617159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4071	NC_017867	TCC	2	6	1625433	1625438	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4072	NC_017867	ATTC	2	8	1625462	1625469	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4073	NC_017867	TCAGC	2	10	1625518	1625527	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
4074	NC_017867	GCC	2	6	1626510	1626515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4075	NC_017867	AGGA	2	8	1626545	1626552	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4076	NC_017867	T	6	6	1627831	1627836	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4077	NC_017867	TGT	2	6	1627838	1627843	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4078	NC_017867	AT	3	6	1627862	1627867	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4079	NC_017867	ATT	2	6	1627893	1627898	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4080	NC_017867	CACT	2	8	1627900	1627907	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4081	NC_017867	ACAGA	2	10	1629401	1629410	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
4082	NC_017867	T	7	7	1629830	1629836	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4083	NC_017867	TA	3	6	1629841	1629846	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4084	NC_017867	ATT	2	6	1629854	1629859	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4085	NC_017867	TCT	2	6	1629879	1629884	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4086	NC_017867	TTC	2	6	1629890	1629895	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4087	NC_017867	GA	3	6	1629909	1629914	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4088	NC_017867	ATA	2	6	1629959	1629964	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4089	NC_017867	CTTA	2	8	1629980	1629987	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4090	NC_017867	TA	3	6	1629998	1630003	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4091	NC_017867	TA	3	6	1630073	1630078	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4092	NC_017867	ACC	2	6	1630117	1630122	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4093	NC_017867	CTT	2	6	1630229	1630234	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4094	NC_017867	T	6	6	1630241	1630246	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4095	NC_017867	GA	3	6	1630264	1630269	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4096	NC_017867	TTA	2	6	1630281	1630286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4097	NC_017867	ATT	3	9	1630319	1630327	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4098	NC_017867	CCA	2	6	1630362	1630367	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4099	NC_017867	ATT	2	6	1630412	1630417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4100	NC_017867	CATA	2	8	1630445	1630452	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4101	NC_017867	TTA	2	6	1630489	1630494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4102	NC_017867	AGGA	2	8	1630621	1630628	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4103	NC_017867	CCG	2	6	1630707	1630712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4104	NC_017867	TCA	2	6	1630823	1630828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4105	NC_017867	GAG	2	6	1630938	1630943	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4106	NC_017867	AC	3	6	1630944	1630949	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4107	NC_017867	AAT	2	6	1630998	1631003	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4108	NC_017867	GAG	2	6	1631085	1631090	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4109	NC_017867	TC	4	8	1631098	1631105	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4110	NC_017867	TGC	2	6	1631162	1631167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4111	NC_017867	CTT	2	6	1631219	1631224	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4112	NC_017867	AGGA	2	8	1631271	1631278	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4113	NC_017867	GGT	2	6	1631322	1631327	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4114	NC_017867	TAC	2	6	1631382	1631387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4115	NC_017867	AT	3	6	1631400	1631405	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4116	NC_017867	TTAG	2	8	1631419	1631426	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4117	NC_017867	ACT	2	6	1631428	1631433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4118	NC_017867	CCGT	2	8	1632993	1633000	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4119	NC_017867	TA	3	6	1633142	1633147	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4120	NC_017867	AGG	2	6	1633239	1633244	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4121	NC_017867	CCG	2	6	1633593	1633598	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4122	NC_017867	GC	3	6	1633611	1633616	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4123	NC_017867	AC	3	6	1633624	1633629	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4124	NC_017867	AGA	2	6	1633640	1633645	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4125	NC_017867	GAG	2	6	1635436	1635441	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4126	NC_017867	CGC	2	6	1635451	1635456	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4127	NC_017867	GCG	2	6	1635459	1635464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4128	NC_017867	GCA	2	6	1635478	1635483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4129	NC_017867	CAC	2	6	1636891	1636896	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4130	NC_017867	GGC	2	6	1636949	1636954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4131	NC_017867	TTCG	2	8	1636973	1636980	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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4133	NC_017867	GCC	2	6	1637780	1637785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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