MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bifidobacterium animalis subsp. lactis B420 chromosome

Total Repeats: 5523

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017866	AGC	2	6	1931	1936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_017866	T	6	6	1965	1970	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017866	GGC	3	9	1982	1990	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_017866	CGG	2	6	1999	2004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_017866	GAG	2	6	2064	2069	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017866	TG	3	6	2127	2132	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017866	CGC	2	6	2136	2141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_017866	CGG	2	6	2195	2200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_017866	TGT	2	6	2226	2231	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017866	CA	3	6	2251	2256	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_017866	TAC	2	6	2322	2327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_017866	TCG	2	6	2350	2355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_017866	TCA	2	6	2356	2361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_017866	CGG	2	6	2367	2372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_017866	GCA	2	6	3625	3630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_017866	AGGA	2	8	3645	3652	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017866	GCG	2	6	5606	5611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_017866	GC	3	6	5635	5640	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19	NC_017866	C	6	6	5654	5659	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
20	NC_017866	TAG	2	6	5676	5681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017866	TG	3	6	5734	5739	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017866	GCC	2	6	7900	7905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_017866	GT	3	6	7925	7930	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017866	CTC	2	6	11411	11416	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_017866	TGA	2	6	11456	11461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017866	CTGC	2	8	11473	11480	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
27	NC_017866	CGCA	2	8	11481	11488	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
28	NC_017866	ACG	2	6	11509	11514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_017866	AC	3	6	12705	12710	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_017866	TGC	2	6	12729	12734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_017866	GCC	2	6	13641	13646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_017866	TGCA	2	8	13668	13675	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_017866	TGC	2	6	13768	13773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_017866	GTTG	2	8	13879	13886	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017866	CTC	2	6	13920	13925	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_017866	TCC	2	6	13930	13935	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_017866	CCTC	2	8	15392	15399	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
38	NC_017866	AT	3	6	15418	15423	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017866	ATT	2	6	15441	15446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017866	GC	4	8	15459	15466	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_017866	TGCA	2	8	18222	18229	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
42	NC_017866	GCG	2	6	18278	18283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_017866	TAT	2	6	18331	18336	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017866	GCT	2	6	18370	18375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_017866	GA	4	8	18409	18416	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017866	ATGGGC	2	12	18926	18937	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_017866	GTG	2	6	19061	19066	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017866	TGA	2	6	19114	19119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017866	TGT	2	6	19462	19467	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017866	ATGT	2	8	19468	19475	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017866	GTT	2	6	19559	19564	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017866	TTG	2	6	19565	19570	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017866	TG	4	8	19581	19588	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017866	GGA	2	6	19761	19766	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017866	ACC	2	6	19807	19812	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_017866	GTT	2	6	19837	19842	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017866	AGAA	2	8	19856	19863	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017866	GGTG	2	8	19923	19930	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017866	ATTC	2	8	19931	19938	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_017866	TAA	2	6	21325	21330	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017866	TCTGT	2	10	21384	21393	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
62	NC_017866	TGC	2	6	21651	21656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_017866	TCT	2	6	21674	21679	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_017866	GC	3	6	21703	21708	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
65	NC_017866	TGAC	2	8	21710	21717	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
66	NC_017866	GTA	2	6	22653	22658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017866	GAA	2	6	22863	22868	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017866	CTG	2	6	22869	22874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_017866	AGT	2	6	22894	22899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017866	TG	3	6	22964	22969	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017866	CGC	2	6	22988	22993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_017866	GCAT	2	8	23016	23023	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
73	NC_017866	TTTC	2	8	23043	23050	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_017866	TG	3	6	23078	23083	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017866	ATG	2	6	23124	23129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017866	ATG	2	6	23157	23162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017866	CAC	2	6	23189	23194	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_017866	CCAA	2	8	23236	23243	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_017866	GCA	2	6	23255	23260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_017866	AC	3	6	23310	23315	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_017866	GGC	2	6	23329	23334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_017866	TCG	2	6	23425	23430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_017866	GC	3	6	23444	23449	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
84	NC_017866	CGG	2	6	23462	23467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_017866	CG	3	6	23474	23479	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
86	NC_017866	GGC	2	6	23532	23537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_017866	GCCGT	2	10	26067	26076	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
88	NC_017866	GTT	2	6	26136	26141	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017866	AG	3	6	26181	26186	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017866	GGT	2	6	26194	26199	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017866	GGT	2	6	26246	26251	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017866	CCGA	2	8	26277	26284	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
93	NC_017866	GGT	2	6	26291	26296	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017866	ATGC	2	8	26318	26325	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
95	NC_017866	ATG	2	6	26335	26340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017866	CGG	2	6	26365	26370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_017866	GAA	2	6	26378	26383	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017866	AAGG	2	8	28125	28132	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017866	AGAGA	2	10	28163	28172	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017866	GAA	3	9	28175	28183	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017866	CGGTT	2	10	28212	28221	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
102	NC_017866	CGC	2	6	28227	28232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_017866	CG	3	6	28262	28267	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
104	NC_017866	ACTG	2	8	28379	28386	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
105	NC_017866	ACA	2	6	28396	28401	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_017866	AGG	2	6	28428	28433	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017866	GCTT	2	8	29053	29060	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
108	NC_017866	TTC	2	6	29151	29156	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_017866	TA	5	10	29303	29312	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017866	GTTT	2	8	29994	30001	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017866	ATT	2	6	30026	30031	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017866	AGG	2	6	30052	30057	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017866	GGC	2	6	30194	30199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_017866	GTC	2	6	30302	30307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_017866	TGC	2	6	30383	30388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_017866	GAC	2	6	30402	30407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_017866	TGG	2	6	30453	30458	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017866	CTT	2	6	30511	30516	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_017866	GAC	2	6	30525	30530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_017866	AG	3	6	30568	30573	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017866	GAG	2	6	30662	30667	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017866	CGA	2	6	30670	30675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_017866	CGG	2	6	30946	30951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_017866	CTT	2	6	31015	31020	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_017866	GAAGA	2	10	31023	31032	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017866	ACA	2	6	31374	31379	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_017866	TTCAC	2	10	31435	31444	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
128	NC_017866	CGG	2	6	31936	31941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_017866	GCT	2	6	32304	32309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_017866	TGGC	2	8	32674	32681	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
131	NC_017866	GGT	2	6	33790	33795	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017866	GTT	2	6	33828	33833	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017866	GTG	2	6	33838	33843	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017866	GGT	2	6	34151	34156	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017866	TGC	2	6	34175	34180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_017866	GTTT	2	8	34200	34207	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017866	T	6	6	34264	34269	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017866	GCC	2	6	34276	34281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
139	NC_017866	AATT	2	8	34339	34346	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017866	GGT	2	6	34371	34376	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017866	CGA	2	6	34448	34453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_017866	GT	3	6	34460	34465	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017866	TGAGT	2	10	34473	34482	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017866	TAG	2	6	35963	35968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017866	GC	3	6	36001	36006	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
146	NC_017866	AAATC	2	10	36007	36016	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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420	NC_017866	TGG	2	6	128644	128649	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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426	NC_017866	TGCA	2	8	131348	131355	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
427	NC_017866	ATG	2	6	131360	131365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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429	NC_017866	TGA	2	6	132442	132447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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