MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Borrelia crocidurae str. Achema plasmid unnamed

Total Repeats: 170

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017814	TAA	2	6	24	29	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017814	TAAA	2	8	32	39	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017814	T	6	6	40	45	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017814	CTT	2	6	61	66	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_017814	TAA	2	6	74	79	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017814	ATT	2	6	102	107	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017814	TAA	2	6	111	116	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017814	TA	3	6	117	122	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017814	TTTA	2	8	127	134	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017814	T	7	7	143	149	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017814	T	7	7	165	171	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017814	ATT	2	6	188	193	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017814	TTA	2	6	197	202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017814	AG	3	6	220	225	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017814	A	6	6	291	296	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017814	TA	3	6	344	349	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017814	GTTT	2	8	350	357	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017814	AC	3	6	375	380	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_017814	TAA	2	6	392	397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017814	TTA	2	6	436	441	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017814	AAAT	2	8	469	476	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017814	T	7	7	501	507	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017814	AGT	2	6	530	535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017814	AAG	2	6	548	553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017814	A	7	7	561	567	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017814	ACAAA	2	10	587	596	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_017814	TTATT	2	10	648	657	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017814	CTG	2	6	1006	1011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_017814	TCA	3	9	1026	1034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_017814	CCA	2	6	1049	1054	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_017814	TTATC	2	10	1056	1065	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_017814	TAA	2	6	1078	1083	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017814	TTTA	2	8	1084	1091	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017814	CT	3	6	1097	1102	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_017814	T	7	7	1168	1174	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017814	TTTG	2	8	1189	1196	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017814	TC	3	6	1212	1217	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_017814	ATA	2	6	1264	1269	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017814	A	6	6	1300	1305	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017814	C	7	7	1406	1412	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
41	NC_017814	TAA	2	6	1441	1446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017814	TAA	2	6	1458	1463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017814	TA	3	6	1504	1509	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017814	TTA	2	6	1527	1532	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017814	TAT	2	6	1538	1543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017814	ATA	2	6	1554	1559	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017814	TTTATA	2	12	1577	1588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017814	ATT	2	6	1596	1601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017814	T	6	6	1617	1622	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017814	TA	3	6	1648	1653	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017814	TAT	2	6	1720	1725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017814	TTTG	2	8	1727	1734	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017814	CTTTA	2	10	1795	1804	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
54	NC_017814	TAT	3	9	1817	1825	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017814	TAT	2	6	1828	1833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017814	TAT	2	6	1836	1841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017814	TAT	2	6	1844	1849	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017814	TC	3	6	2082	2087	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_017814	CCT	2	6	2101	2106	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_017814	TCT	2	6	2111	2116	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_017814	TTAT	2	8	2139	2146	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017814	AGA	2	6	2155	2160	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017814	A	7	7	2160	2166	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017814	AAC	2	6	2187	2192	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_017814	ACA	2	6	2199	2204	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_017814	CA	3	6	2203	2208	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_017814	A	7	7	2223	2229	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017814	CT	3	6	2243	2248	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_017814	CTAA	2	8	2261	2268	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_017814	AT	3	6	2279	2284	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017814	CCT	2	6	3386	3391	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_017814	T	6	6	3400	3405	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017814	TTTA	2	8	3423	3430	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017814	A	6	6	3436	3441	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017814	TAAA	2	8	3442	3449	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017814	TA	3	6	3458	3463	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017814	A	7	7	3484	3490	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017814	CT	3	6	3496	3501	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_017814	A	6	6	3528	3533	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017814	CCT	2	6	4621	4626	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_017814	T	7	7	4629	4635	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017814	ATT	2	6	4636	4641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017814	T	8	8	4640	4647	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017814	A	7	7	4675	4681	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017814	TA	3	6	4689	4694	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017814	TA	3	6	4704	4709	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017814	TAAAA	2	10	4724	4733	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017814	A	6	6	4730	4735	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017814	CT	4	8	4749	4756	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_017814	TAA	2	6	4772	4777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017814	TTA	2	6	4778	4783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017814	TA	4	8	4792	4799	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017814	ATTA	2	8	4813	4820	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017814	TTA	2	6	4826	4831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017814	ATT	2	6	5080	5085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017814	CT	3	6	5102	5107	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_017814	CAC	2	6	5810	5815	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_017814	CTT	2	6	5831	5836	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_017814	TC	3	6	5837	5842	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_017814	CT	3	6	5843	5848	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_017814	TTC	2	6	5858	5863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_017814	N	211	211	5872	6082	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017814	TTC	2	6	6094	6099	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_017814	CTT	2	6	6144	6149	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_017814	TCT	2	6	6153	6158	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_017814	CCT	2	6	6162	6167	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_017814	T	6	6	6170	6175	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017814	T	6	6	6181	6186	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017814	CTTTT	2	10	6203	6212	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
110	NC_017814	AGA	2	6	6220	6225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017814	A	7	7	6225	6231	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017814	GAT	2	6	6232	6237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017814	TA	3	6	6239	6244	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017814	AC	3	6	6245	6250	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_017814	TAAAA	2	10	6257	6266	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017814	A	7	7	6263	6269	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017814	TAA	2	6	6307	6312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017814	AT	3	6	6329	6334	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017814	CTC	3	9	6369	6377	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_017814	TC	3	6	6387	6392	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_017814	CTTA	2	8	6400	6407	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
122	NC_017814	TGA	2	6	6439	6444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017814	TTC	2	6	6448	6453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_017814	CAA	2	6	6467	6472	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_017814	ATC	2	6	6477	6482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_017814	CTC	2	6	6509	6514	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_017814	TTC	2	6	6560	6565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_017814	CTT	2	6	6566	6571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_017814	CTG	2	6	6586	6591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_017814	AT	3	6	6655	6660	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017814	CTT	2	6	6726	6731	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_017814	TCT	2	6	6760	6765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_017814	TAG	2	6	6781	6786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017814	TTTA	2	8	6869	6876	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017814	A	6	6	6882	6887	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017814	AT	3	6	6897	6902	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017814	ACA	2	6	6909	6914	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_017814	AAATAA	2	12	6915	6926	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017814	ACA	2	6	6930	6935	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_017814	TTATT	2	10	6979	6988	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017814	AAC	2	6	7015	7020	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_017814	TAT	3	9	7070	7078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017814	TTC	2	6	7081	7086	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_017814	T	7	7	7088	7094	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017814	ATT	2	6	7096	7101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017814	TAA	2	6	7128	7133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017814	ATTAA	2	10	7155	7164	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017814	CTC	2	6	7186	7191	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
149	NC_017814	TC	3	6	7196	7201	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
150	NC_017814	TTTA	2	8	7209	7216	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_017814	TAA	2	6	7253	7258	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_017814	CCT	2	6	7992	7997	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
153	NC_017814	T	6	6	8000	8005	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_017814	T	6	6	8008	8013	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_017814	AGA	2	6	8036	8041	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
156	NC_017814	A	6	6	8041	8046	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_017814	TA	3	6	8054	8059	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_017814	AC	3	6	8060	8065	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
159	NC_017814	A	7	7	8081	8087	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_017814	N	789	789	9107	9895	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_017814	ATTC	2	8	9925	9932	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
162	NC_017814	TTTC	2	8	9954	9961	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
163	NC_017814	CCT	2	6	9963	9968	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
164	NC_017814	T	6	6	9971	9976	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
165	NC_017814	CAAA	3	12	10004	10015	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
166	NC_017814	AAAT	2	8	10016	10023	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
167	NC_017814	GAAT	2	8	10036	10043	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
168	NC_017814	TAA	2	6	10099	10104	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
169	NC_017814	AATAC	2	10	10115	10124	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
170	NC_017814	TTATT	2	10	10181	10190	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.