MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Borrelia crocidurae str. Achema plasmid unnamed

Total Repeats: 160

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017813	ATGTT	2	10	7	16	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017813	TA	3	6	26	31	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017813	ATT	2	6	53	58	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017813	AATA	2	8	201	208	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017813	TTA	2	6	254	259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017813	TATT	2	8	293	300	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017813	TAT	2	6	302	307	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017813	T	6	6	326	331	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017813	AAG	2	6	375	380	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017813	TCT	2	6	391	396	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_017813	TTA	2	6	419	424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017813	CTT	2	6	448	453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_017813	TAT	3	9	494	502	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017813	TCT	2	6	505	510	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_017813	TCA	2	6	520	525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_017813	AACC	2	8	583	590	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_017813	ATAA	2	8	838	845	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017813	TC	3	6	898	903	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_017813	TGTA	2	8	907	914	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017813	ATA	3	9	973	981	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017813	TC	3	6	1082	1087	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_017813	T	8	8	1091	1098	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017813	TTTA	2	8	1137	1144	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017813	T	7	7	1149	1155	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017813	TTTA	2	8	1163	1170	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017813	CTTT	2	8	1201	1208	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_017813	T	6	6	1206	1211	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017813	T	9	9	1237	1245	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017813	CTA	2	6	1340	1345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_017813	T	8	8	1360	1367	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017813	CTT	2	6	1425	1430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_017813	A	6	6	1454	1459	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017813	CTT	2	6	1488	1493	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_017813	A	6	6	1496	1501	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017813	N	1484	1484	1527	3010	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017813	T	6	6	3011	3016	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017813	AT	3	6	3018	3023	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017813	TAT	2	6	3033	3038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017813	ATT	3	9	3051	3059	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017813	AATT	2	8	3085	3092	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017813	AGT	2	6	3363	3368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017813	TTTA	2	8	3433	3440	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017813	GAAT	2	8	3507	3514	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017813	GAT	2	6	3525	3530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017813	A	7	7	3578	3584	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017813	A	7	7	3588	3594	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017813	TTAAA	2	10	3619	3628	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017813	TTAAA	2	10	3652	3661	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017813	TGT	2	6	3675	3680	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017813	AT	4	8	3683	3690	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017813	T	6	6	3754	3759	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017813	AAACCA	2	12	3763	3774	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_017813	GTT	2	6	3778	3783	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017813	GTT	2	6	3807	3812	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017813	A	6	6	3817	3822	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017813	N	1229	1229	3850	5078	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017813	A	7	7	5087	5093	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017813	TA	3	6	5920	5925	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017813	ATT	2	6	5941	5946	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017813	CT	3	6	5979	5984	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_017813	T	7	7	5984	5990	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017813	T	7	7	6024	6030	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017813	TGT	2	6	6036	6041	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017813	TAAA	2	8	6054	6061	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017813	A	6	6	6081	6086	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017813	N	477	477	6089	6565	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017813	AT	3	6	7438	7443	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017813	ATTA	3	12	7468	7479	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017813	CT	3	6	7496	7501	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_017813	T	8	8	7501	7508	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017813	GTATT	2	10	7516	7525	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017813	TA	3	6	7529	7534	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017813	TAA	2	6	7555	7560	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017813	A	7	7	7581	7587	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017813	AGG	2	6	7595	7600	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017813	GAA	2	6	7602	7607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017813	GCTACT	2	12	7804	7815	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_017813	TTAA	2	8	8528	8535	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017813	TAAA	2	8	8550	8557	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017813	ATT	2	6	8558	8563	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017813	TAT	2	6	8706	8711	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017813	T	7	7	8723	8729	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017813	AAC	2	6	8730	8735	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_017813	TAA	2	6	8743	8748	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017813	AGT	2	6	8768	8773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017813	GAT	2	6	8787	8792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017813	ATC	2	6	8860	8865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_017813	TTTA	2	8	8866	8873	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017813	TCAT	2	8	8898	8905	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
90	NC_017813	T	7	7	8922	8928	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017813	AAAG	2	8	8956	8963	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017813	A	7	7	8965	8971	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017813	AGG	2	6	8974	8979	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017813	A	7	7	8982	8988	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017813	AAAG	2	8	9002	9009	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017813	ATT	2	6	9017	9022	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017813	AG	4	8	9030	9037	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017813	GA	4	8	9038	9045	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017813	TAG	2	6	9046	9051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017813	AG	3	6	9050	9055	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017813	AGA	2	6	9735	9740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017813	AATA	2	8	9750	9757	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017813	TA	3	6	9790	9795	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017813	GTA	2	6	9833	9838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017813	AT	3	6	9865	9870	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017813	T	6	6	9870	9875	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017813	CTG	2	6	9902	9907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_017813	TTG	2	6	9908	9913	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017813	TAAAT	2	10	9930	9939	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017813	TAAT	2	8	9945	9952	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017813	ATT	2	6	9963	9968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017813	C	8	8	10013	10020	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
113	NC_017813	T	6	6	10052	10057	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017813	T	6	6	10062	10067	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017813	ATG	2	6	10077	10082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017813	TTA	2	6	10119	10124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017813	TAT	2	6	10144	10149	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017813	AAC	2	6	10159	10164	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_017813	ATA	2	6	10238	10243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017813	AGA	2	6	10244	10249	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017813	AAT	2	6	10269	10274	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017813	AGA	2	6	10382	10387	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017813	AGA	2	6	10421	10426	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017813	TAAG	2	8	10441	10448	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017813	GAA	2	6	10452	10457	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017813	AAG	2	6	10464	10469	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017813	TGG	2	6	10502	10507	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017813	AG	3	6	10547	10552	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017813	A	6	6	10556	10561	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017813	TTG	2	6	10564	10569	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017813	TTG	2	6	10585	10590	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017813	N	205	205	10609	10813	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017813	AG	3	6	10853	10858	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017813	A	6	6	10862	10867	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017813	TTG	2	6	10870	10875	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017813	TTG	2	6	10891	10896	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017813	TA	3	6	11472	11477	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017813	ATT	2	6	11493	11498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017813	AG	3	6	11517	11522	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017813	CT	3	6	11535	11540	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_017813	TTAT	2	8	11541	11548	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017813	TA	3	6	11567	11572	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017813	ATTT	2	8	11580	11587	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017813	T	6	6	11589	11594	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017813	AGAA	2	8	11626	11633	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017813	A	6	6	11632	11637	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017813	AGG	2	6	11640	11645	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017813	GAA	2	6	11647	11652	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017813	TAAG	2	8	12794	12801	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017813	TTTTA	2	10	12851	12860	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_017813	GT	3	6	12863	12868	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
152	NC_017813	TAT	2	6	12903	12908	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_017813	T	8	8	12915	12922	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_017813	TAT	2	6	12951	12956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_017813	ACAA	2	8	12967	12974	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
156	NC_017813	TA	4	8	13966	13973	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_017813	TAA	2	6	13982	13987	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_017813	TTA	2	6	13988	13993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_017813	TAG	2	6	14005	14010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
160	NC_017813	AG	3	6	14009	14014	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.