MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Borrelia crocidurae str. Achema chromosome

Total Repeats: 2044

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017808	TTAC	2	8	25	32	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_017808	CAT	3	9	34	42	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017808	TTA	2	6	58	63	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017808	TGA	2	6	80	85	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017808	TAA	2	6	114	119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017808	TAA	2	6	144	149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017808	ACA	2	6	172	177	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_017808	CTAT	2	8	188	195	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_017808	TA	3	6	198	203	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017808	ATT	2	6	214	219	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017808	TTA	2	6	239	244	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017808	ATA	3	9	248	256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017808	A	7	7	256	262	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017808	A	6	6	271	276	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017808	ACTGT	2	10	307	316	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
16	NC_017808	AATT	2	8	365	372	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017808	AATT	2	8	406	413	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017808	TTA	2	6	420	425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017808	ATA	2	6	432	437	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017808	AAT	2	6	458	463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017808	ATAA	2	8	472	479	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017808	TTC	2	6	988	993	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_017808	T	9	9	1015	1023	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017808	T	6	6	1035	1040	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017808	A	7	7	1110	1116	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017808	TA	3	6	1145	1150	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017808	A	7	7	1152	1158	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017808	CAT	2	6	1166	1171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_017808	CAA	2	6	1180	1185	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_017808	ATT	2	6	1198	1203	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017808	ATC	2	6	1226	1231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_017808	TTA	2	6	1234	1239	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017808	AGCA	2	8	1268	1275	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_017808	TTC	2	6	1453	1458	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_017808	T	6	6	1496	1501	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017808	CAG	2	6	1513	1518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_017808	TCACCA	2	12	1694	1705	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_017808	CAT	2	6	1762	1767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_017808	A	7	7	2109	2115	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017808	ATTA	2	8	2152	2159	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017808	AAT	2	6	2176	2181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017808	CTA	2	6	2196	2201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_017808	A	6	6	2249	2254	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017808	ATTA	2	8	2277	2284	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017808	AC	3	6	2367	2372	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_017808	TAA	2	6	2408	2413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017808	CA	3	6	2440	2445	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_017808	AAT	2	6	2446	2451	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017808	ATT	2	6	2485	2490	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017808	GATTG	2	10	2572	2581	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017808	CAT	2	6	2589	2594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_017808	CA	3	6	2612	2617	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_017808	TAT	2	6	2627	2632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017808	TA	3	6	2665	2670	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017808	ATAAA	2	10	2678	2687	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017808	AT	3	6	2689	2694	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017808	TAT	2	6	2700	2705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017808	TA	3	6	2910	2915	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017808	TCA	2	6	2922	2927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_017808	TAT	2	6	2954	2959	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017808	A	6	6	2960	2965	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017808	TAA	2	6	2974	2979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017808	TAAA	2	8	3007	3014	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017808	A	6	6	3022	3027	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017808	TAAA	2	8	5541	5548	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017808	GTA	2	6	5579	5584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017808	A	6	6	5601	5606	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017808	C	9	9	9625	9633	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
69	NC_017808	ATT	2	6	9640	9645	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017808	AAT	2	6	9652	9657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017808	AAAGT	2	10	9661	9670	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017808	ATTA	2	8	9691	9698	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017808	A	6	6	10592	10597	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017808	ATTTA	2	10	10601	10610	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017808	AT	4	8	10629	10636	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017808	AT	3	6	10647	10652	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017808	ATTAT	2	10	10675	10684	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017808	ACA	2	6	10687	10692	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_017808	AAT	2	6	17996	18001	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017808	A	9	9	18005	18013	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017808	T	6	6	18040	18045	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017808	AAT	2	6	18076	18081	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017808	AGTAA	2	10	18094	18103	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017808	TAA	2	6	20560	20565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017808	ATT	2	6	22260	22265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017808	TAAT	2	8	22284	22291	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017808	TAAAA	2	10	24407	24416	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017808	CTTAT	2	10	25040	25049	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
89	NC_017808	A	7	7	25071	25077	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017808	CCCTC	2	10	26734	26743	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
91	NC_017808	TAA	2	6	26829	26834	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017808	ATA	2	6	26850	26855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017808	AGAA	2	8	26865	26872	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017808	T	6	6	30480	30485	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017808	AT	3	6	30636	30641	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017808	AT	3	6	30699	30704	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017808	TTC	2	6	30705	30710	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_017808	ACA	2	6	32745	32750	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_017808	TAAA	2	8	32772	32779	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017808	ATA	2	6	32785	32790	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017808	AGT	2	6	32800	32805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017808	ATT	2	6	32817	32822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017808	TA	3	6	33437	33442	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017808	AAT	2	6	33462	33467	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017808	TCT	2	6	33473	33478	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_017808	AAATA	2	10	40986	40995	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017808	ATT	2	6	41029	41034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017808	A	7	7	41055	41061	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017808	TAAT	2	8	41089	41096	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017808	TAAT	2	8	41100	41107	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017808	A	7	7	41112	41118	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017808	AAT	2	6	42008	42013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017808	TAAA	3	12	42025	42036	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017808	ACT	2	6	46656	46661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_017808	AATTA	2	10	46665	46674	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017808	TAT	2	6	46707	46712	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017808	AATA	2	8	46713	46720	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017808	ATC	2	6	47315	47320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_017808	TCC	2	6	47636	47641	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_017808	TA	3	6	47656	47661	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017808	TACT	2	8	47690	47697	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
122	NC_017808	A	8	8	47702	47709	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017808	T	7	7	47753	47759	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017808	TTA	2	6	47802	47807	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017808	CTT	2	6	47854	47859	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_017808	TAA	2	6	47867	47872	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017808	A	7	7	47883	47889	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017808	ATA	2	6	47925	47930	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017808	A	7	7	47962	47968	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017808	ACC	2	6	47994	47999	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
131	NC_017808	CAA	2	6	48101	48106	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_017808	CT	3	6	48109	48114	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_017808	AGC	2	6	48124	48129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_017808	TTA	2	6	48155	48160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017808	T	6	6	48161	48166	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017808	TTA	2	6	48171	48176	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017808	AAG	2	6	48177	48182	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017808	CTA	2	6	48215	48220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_017808	AAT	2	6	48255	48260	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017808	AAAT	2	8	48282	48289	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017808	A	7	7	48290	48296	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017808	A	6	6	48298	48303	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017808	ACA	2	6	48320	48325	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_017808	TAA	2	6	49107	49112	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017808	ATT	2	6	50463	50468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017808	TAAA	2	8	50470	50477	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017808	A	6	6	50475	50480	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017808	A	6	6	50497	50502	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017808	TTAAA	2	10	50503	50512	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017808	TA	3	6	50536	50541	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_017808	ATA	2	6	51233	51238	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_017808	TA	3	6	51257	51262	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_017808	TAT	2	6	51278	51283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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162	NC_017808	TA	3	6	57949	57954	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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