MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Borrelia crocidurae str. Achema plasmid unnamed

Total Repeats: 103

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017782	AT	3	6	1892	1897	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017782	AGG	2	6	1916	1921	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017782	ATTTT	2	10	2668	2677	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017782	TAT	2	6	2683	2688	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017782	ACT	2	6	2691	2696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_017782	TAG	2	6	2700	2705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017782	TTC	2	6	2708	2713	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_017782	TAC	2	6	2719	2724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_017782	AGAA	2	8	2773	2780	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017782	TAT	2	6	2806	2811	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017782	T	7	7	2831	2837	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017782	AT	3	6	2874	2879	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017782	T	7	7	2906	2912	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017782	AT	3	6	2913	2918	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017782	TAA	2	6	2933	2938	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017782	TATTTA	2	12	3578	3589	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017782	TAT	2	6	3593	3598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017782	TTTGTT	2	12	3606	3617	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017782	T	6	6	3616	3621	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017782	TGTCTT	2	12	3643	3654	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_017782	ATG	2	6	3671	3676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017782	ATA	2	6	3684	3689	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017782	TAC	2	6	3713	3718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_017782	N	712	712	3742	4453	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017782	T	6	6	4484	4489	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017782	ATA	2	6	4540	4545	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017782	TCTT	2	8	4546	4553	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_017782	TCTT	2	8	4557	4564	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_017782	TAT	2	6	4634	4639	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017782	TCT	2	6	5046	5051	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_017782	T	7	7	5077	5083	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017782	TCT	2	6	5109	5114	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_017782	T	8	8	5118	5125	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017782	TCT	2	6	5130	5135	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_017782	T	8	8	5139	5146	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017782	T	7	7	5160	5166	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017782	AAT	2	6	5201	5206	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017782	TTC	2	6	5225	5230	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_017782	N	1617	1617	5335	6951	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017782	TCT	2	6	6955	6960	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_017782	T	7	7	6980	6986	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017782	T	6	6	6991	6996	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017782	TAT	2	6	7008	7013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017782	T	6	6	7013	7018	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017782	ATAA	2	8	7026	7033	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017782	ATT	2	6	7044	7049	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017782	TCT	2	6	8370	8375	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_017782	TGA	2	6	8389	8394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017782	TAA	2	6	8404	8409	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017782	CT	3	6	8414	8419	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_017782	T	7	7	8419	8425	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017782	A	6	6	8446	8451	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017782	TGA	2	6	8452	8457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017782	AAG	2	6	8463	8468	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017782	AG	3	6	8479	8484	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017782	AG	3	6	8486	8491	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017782	AGA	2	6	8504	8509	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017782	TGA	2	6	8520	8525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017782	TGG	2	6	8526	8531	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017782	TGA	2	6	8532	8537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017782	TGG	2	6	8538	8543	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017782	TGA	2	6	8544	8549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017782	TGAG	2	8	8601	8608	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017782	N	867	867	8686	9552	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017782	AGG	2	6	9576	9581	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017782	AGC	2	6	9609	9614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_017782	ATAA	2	8	9712	9719	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017782	GA	3	6	9728	9733	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017782	AAGG	2	8	9736	9743	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017782	TAAT	2	8	9771	9778	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017782	TA	4	8	9790	9797	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017782	ATT	2	6	9811	9816	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017782	CT	3	6	9849	9854	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_017782	T	9	9	9854	9862	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017782	TAT	2	6	9871	9876	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017782	TA	3	6	9883	9888	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017782	T	7	7	9896	9902	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017782	TAA	2	6	9915	9920	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017782	A	7	7	9942	9948	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017782	ATAA	2	8	9950	9957	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017782	AGG	2	6	9959	9964	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017782	GAA	2	6	9966	9971	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017782	TAG	2	6	11127	11132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017782	TAA	2	6	11139	11144	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017782	AAAAT	2	10	11145	11154	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017782	ACA	2	6	11163	11168	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_017782	TTTA	2	8	11175	11182	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017782	GTT	2	6	11188	11193	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017782	AT	3	6	11207	11212	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017782	TAT	2	6	11255	11260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017782	AAAG	2	8	11273	11280	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017782	ATA	2	6	11281	11286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017782	A	7	7	11291	11297	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017782	TTAC	2	8	11311	11318	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
95	NC_017782	GTT	2	6	11332	11337	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017782	CAT	2	6	11360	11365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_017782	AT	3	6	11380	11385	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017782	ATTT	2	8	11415	11422	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017782	AACA	2	8	11474	11481	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NC_017782	ATTC	2	8	11499	11506	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
101	NC_017782	T	6	6	11546	11551	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017782	GT	3	6	11552	11557	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017782	TTA	2	6	11564	11569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.