MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Borrelia burgdorferi JD1 plasmid JD1 cp32-10

Total Repeats: 111

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017428	TAA	2	6	46	51	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017428	GGA	2	6	3958	3963	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017428	CTA	2	6	10915	10920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_017428	A	7	7	10962	10968	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017428	A	8	8	10992	10999	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017428	CAAT	2	8	11012	11019	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_017428	TCA	2	6	11065	11070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_017428	AT	3	6	11167	11172	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017428	A	7	7	11192	11198	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017428	GGCA	2	8	11214	11221	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11	NC_017428	A	7	7	11475	11481	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017428	TAA	2	6	11501	11506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017428	ACAA	2	8	11561	11568	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_017428	TAC	2	6	11584	11589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_017428	AGA	2	6	11598	11603	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017428	CAA	2	6	11626	11631	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_017428	TA	3	6	11667	11672	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017428	CA	3	6	11694	11699	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_017428	TTTC	2	8	11723	11730	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_017428	GTA	2	6	11856	11861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017428	ACA	2	6	12004	12009	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_017428	AAG	2	6	12015	12020	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017428	CA	3	6	12059	12064	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_017428	A	6	6	12064	12069	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017428	TAC	2	6	12114	12119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_017428	TCAA	2	8	12121	12128	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_017428	TA	3	6	12182	12187	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017428	AATCT	2	10	12215	12224	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_017428	AAC	2	6	12274	12279	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_017428	A	7	7	12342	12348	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017428	CCAG	2	8	12364	12371	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
32	NC_017428	AATT	2	8	12393	12400	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017428	TAAT	2	8	12445	12452	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017428	TA	3	6	15125	15130	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017428	ATA	2	6	16478	16483	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017428	ACC	2	6	17094	17099	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_017428	ATA	2	6	17123	17128	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017428	TAA	2	6	17152	17157	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017428	TTA	2	6	17163	17168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017428	ATT	2	6	17172	17177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017428	A	7	7	17181	17187	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017428	TA	3	6	17626	17631	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017428	TCC	2	6	18681	18686	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_017428	AATA	2	8	18694	18701	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017428	TA	3	6	18704	18709	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017428	T	6	6	18731	18736	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017428	A	6	6	18751	18756	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017428	TAT	2	6	18809	18814	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017428	T	6	6	18814	18819	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017428	GTA	2	6	18874	18879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017428	TAA	2	6	18951	18956	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017428	T	6	6	18970	18975	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017428	TAA	2	6	19014	19019	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017428	ATT	2	6	19023	19028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017428	A	6	6	19048	19053	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017428	T	6	6	22687	22692	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017428	ATA	3	9	22703	22711	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017428	TGA	2	6	22713	22718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017428	T	6	6	22777	22782	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017428	TTTTA	2	10	22806	22815	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017428	ACAAAT	2	12	22816	22827	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_017428	TTG	2	6	22859	22864	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017428	TTTA	2	8	22872	22879	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017428	TAA	2	6	22883	22888	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017428	TA	4	8	22923	22930	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017428	A	7	7	22965	22971	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017428	T	6	6	23032	23037	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017428	T	6	6	23044	23049	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017428	A	7	7	23052	23058	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017428	TA	3	6	23079	23084	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017428	TTAT	2	8	23086	23093	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017428	AGG	2	6	23101	23106	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017428	A	6	6	24450	24455	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017428	A	7	7	24458	24464	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017428	ATTA	2	8	25749	25756	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017428	CAAAAA	2	12	25778	25789	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_017428	TG	3	6	25805	25810	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017428	AAGA	2	8	25886	25893	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017428	TA	3	6	25895	25900	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017428	AT	3	6	25910	25915	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017428	AATTT	2	10	25930	25939	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017428	GTG	2	6	25968	25973	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017428	GA	3	6	25985	25990	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017428	TA	3	6	26057	26062	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017428	AATTGT	2	12	26078	26089	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017428	A	6	6	26753	26758	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017428	ACA	2	6	26784	26789	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_017428	CAA	2	6	26794	26799	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_017428	TTG	2	6	26806	26811	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017428	AGG	2	6	26853	26858	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017428	A	6	6	27384	27389	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017428	A	6	6	27421	27426	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017428	AAATA	2	10	27434	27443	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017428	TTA	2	6	27501	27506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017428	A	6	6	28223	28228	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017428	T	6	6	28251	28256	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017428	TAA	2	6	28269	28274	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017428	AGAT	2	8	28284	28291	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017428	CAA	2	6	28309	28314	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_017428	T	7	7	28394	28400	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017428	A	7	7	28402	28408	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017428	TGA	2	6	28422	28427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017428	TG	3	6	28503	28508	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017428	TAAA	2	8	28769	28776	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017428	AGT	2	6	28780	28785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017428	A	8	8	28786	28793	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017428	CAAG	2	8	28794	28801	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
108	NC_017428	AATT	2	8	28815	28822	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017428	TGA	2	6	28839	28844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017428	AT	3	6	28845	28850	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017428	A	6	6	28897	28902	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.