MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Borrelia burgdorferi N40 plasmid N40_cp32-7

Total Repeats: 137

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017422	ACAGAA	2	12	1634	1645	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_017422	AT	3	6	1729	1734	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017422	TATC	2	8	1758	1765	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_017422	TGA	2	6	1846	1851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017422	TAC	2	6	1902	1907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_017422	TAC	2	6	1962	1967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_017422	ATTT	2	8	1968	1975	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017422	A	6	6	1987	1992	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017422	A	6	6	2004	2009	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017422	AAG	2	6	2026	2031	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017422	A	6	6	2050	2055	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017422	TTA	2	6	2108	2113	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017422	ATT	2	6	2119	2124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017422	TAA	2	6	2148	2153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017422	AAC	2	6	2182	2187	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_017422	AGG	2	6	2190	2195	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017422	TGA	2	6	2205	2210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017422	TGA	2	6	2229	2234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017422	AGA	2	6	2235	2240	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017422	TAAA	2	8	2261	2268	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017422	TGA	2	6	2304	2309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017422	CTT	2	6	2346	2351	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_017422	GAAT	2	8	2496	2503	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017422	ATC	2	6	2559	2564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_017422	ATG	2	6	2582	2587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017422	TCT	2	6	2602	2607	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_017422	A	6	6	2618	2623	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017422	TTG	2	6	2641	2646	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017422	AAT	2	6	2694	2699	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017422	ATG	2	6	2753	2758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017422	T	6	6	2768	2773	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017422	TGA	4	12	2781	2792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017422	TGA	2	6	2865	2870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017422	A	7	7	2876	2882	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017422	TATT	2	8	2886	2893	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017422	AGA	2	6	2914	2919	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017422	TA	3	6	2939	2944	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017422	A	6	6	2960	2965	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017422	TCA	2	6	2974	2979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_017422	TA	3	6	3040	3045	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017422	TAAAAA	2	12	3055	3066	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017422	ATA	2	6	4393	4398	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017422	CTA	2	6	4974	4979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_017422	ATA	2	6	5005	5010	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017422	TAA	2	6	5034	5039	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017422	TAA	3	9	5056	5064	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017422	A	7	7	5063	5069	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017422	TAG	2	6	5518	5523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017422	TAA	2	6	6515	6520	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017422	TA	3	6	6528	6533	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017422	T	6	6	6555	6560	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017422	A	6	6	6575	6580	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017422	TAT	3	9	6635	6643	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017422	T	6	6	6643	6648	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017422	GTA	2	6	6706	6711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017422	TAA	2	6	6783	6788	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017422	ATT	2	6	6854	6859	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017422	A	6	6	6878	6883	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017422	AAG	2	6	9845	9850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017422	T	6	6	10440	10445	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017422	TA	3	6	10461	10466	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017422	T	6	6	10472	10477	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017422	ATTTT	2	10	10521	10530	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017422	CTTT	2	8	10533	10540	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_017422	T	6	6	10562	10567	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017422	TTTTA	2	10	10591	10600	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017422	ACAAAT	2	12	10601	10612	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_017422	TTG	2	6	10644	10649	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017422	TTTA	2	8	10657	10664	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017422	TAA	2	6	10668	10673	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017422	TA	4	8	10708	10715	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017422	A	7	7	10731	10737	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017422	A	7	7	10750	10756	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017422	T	6	6	10817	10822	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017422	T	6	6	10829	10834	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017422	A	6	6	10837	10842	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017422	TA	3	6	10864	10869	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017422	AT	3	6	10871	10876	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017422	TTA	2	6	10877	10882	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017422	AAT	3	9	10920	10928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017422	CAA	2	6	10974	10979	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_017422	TCT	2	6	11013	11018	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_017422	A	6	6	11029	11034	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017422	TAAG	2	8	11041	11048	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017422	AGT	2	6	11073	11078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017422	TTG	2	6	11170	11175	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017422	TA	3	6	11254	11259	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017422	AG	3	6	11295	11300	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017422	ATA	2	6	11320	11325	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017422	TA	3	6	11335	11340	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017422	AAAT	2	8	11342	11349	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017422	ATT	2	6	11374	11379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017422	A	7	7	11382	11388	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017422	CAA	2	6	11416	11421	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_017422	AAT	3	9	11439	11447	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017422	AGT	2	6	11496	11501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017422	T	7	7	11531	11537	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017422	T	6	6	11549	11554	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017422	TA	3	6	11562	11567	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017422	TGC	2	6	11630	11635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_017422	TAA	2	6	11696	11701	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017422	A	6	6	11727	11732	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017422	AG	3	6	11751	11756	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017422	TTG	2	6	11803	11808	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017422	TAG	2	6	11815	11820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017422	GAGTT	2	10	11845	11854	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017422	AATC	2	8	11913	11920	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
108	NC_017422	TAAAA	2	10	11991	12000	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017422	A	7	7	11997	12003	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017422	AGAT	2	8	12137	12144	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017422	ACT	2	6	12152	12157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_017422	CAA	2	6	12160	12165	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_017422	TAGTGT	2	12	12206	12217	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017422	A	6	6	12239	12244	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017422	A	7	7	12247	12253	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017422	AGG	2	6	12266	12271	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017422	ATTA	2	8	12272	12279	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017422	AAGTAA	2	12	13522	13533	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017422	CAAAAA	2	12	13568	13579	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_017422	A	7	7	13575	13581	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017422	TG	3	6	13593	13598	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017422	TGCA	2	8	13608	13615	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
123	NC_017422	AGA	2	6	13647	13652	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017422	AAGA	2	8	13676	13683	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017422	AT	3	6	13700	13705	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017422	AGT	2	6	13757	13762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017422	GA	3	6	13775	13780	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017422	TA	3	6	13847	13852	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017422	ATT	2	6	13875	13880	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017422	TAA	2	6	15194	15199	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017422	T	7	7	15209	15215	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017422	TGT	2	6	15267	15272	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017422	TTAT	2	8	15273	15280	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017422	CT	3	6	15284	15289	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_017422	TAA	2	6	15875	15880	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017422	AATA	2	8	15886	15893	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017422	ATA	2	6	15923	15928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.