MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Borrelia burgdorferi N40 plasmid N40_lp38

Total Repeats: 626

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017421	ATTA	2	8	32436	32443	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
502	NC_017421	TTGTAT	2	12	32447	32458	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
503	NC_017421	GAT	2	6	32460	32465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
504	NC_017421	AAT	2	6	32522	32527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_017421	CAC	2	6	32532	32537	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
506	NC_017421	TAG	2	6	32547	32552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
507	NC_017421	T	7	7	32582	32588	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
508	NC_017421	TTA	2	6	32623	32628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
509	NC_017421	TAAA	2	8	32666	32673	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_017421	TAAA	2	8	32676	32683	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
511	NC_017421	A	6	6	32681	32686	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
512	NC_017421	A	7	7	32691	32697	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
513	NC_017421	ACAA	2	8	32733	32740	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
514	NC_017421	AAT	2	6	32752	32757	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_017421	AGT	2	6	32769	32774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
516	NC_017421	CT	3	6	32789	32794	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
517	NC_017421	AAT	2	6	32801	32806	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_017421	CTATTA	2	12	32826	32837	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
519	NC_017421	GAA	2	6	32865	32870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
520	NC_017421	CCT	2	6	32891	32896	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
521	NC_017421	CTT	2	6	32929	32934	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
522	NC_017421	AT	5	10	32991	33000	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_017421	TA	3	6	33015	33020	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
524	NC_017421	T	6	6	33028	33033	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_017421	TC	3	6	33042	33047	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
526	NC_017421	T	7	7	33088	33094	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_017421	A	8	8	33105	33112	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_017421	AAAT	2	8	33114	33121	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_017421	GTA	2	6	33136	33141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
530	NC_017421	T	7	7	33149	33155	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
531	NC_017421	A	6	6	33242	33247	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_017421	TAA	2	6	33330	33335	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_017421	T	9	9	33337	33345	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
534	NC_017421	T	8	8	33385	33392	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
535	NC_017421	TTG	2	6	33424	33429	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
536	NC_017421	TAA	2	6	33439	33444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_017421	TGCCT	6	30	33452	33481	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
538	NC_017421	TGTA	2	8	33499	33506	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
539	NC_017421	ATT	2	6	33507	33512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
540	NC_017421	ATT	2	6	33518	33523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_017421	ATT	2	6	33531	33536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_017421	TTA	2	6	33539	33544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_017421	A	7	7	33549	33555	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_017421	AAT	2	6	33560	33565	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_017421	T	6	6	33880	33885	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_017421	TA	3	6	33900	33905	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
547	NC_017421	ATA	2	6	33908	33913	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_017421	AAT	2	6	33929	33934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
549	NC_017421	T	7	7	33947	33953	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
550	NC_017421	TATT	2	8	33979	33986	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
551	NC_017421	TA	3	6	33997	34002	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_017421	AAT	2	6	34020	34025	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
553	NC_017421	ATT	2	6	34082	34087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_017421	TAAAA	2	10	34093	34102	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
555	NC_017421	T	7	7	34819	34825	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_017421	TGT	2	6	35462	35467	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
557	NC_017421	AAAT	2	8	35468	35475	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NC_017421	A	6	6	35483	35488	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
559	NC_017421	TA	5	10	35494	35503	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
560	NC_017421	GACTT	2	10	35526	35535	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
561	NC_017421	T	6	6	35594	35599	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_017421	AGCT	2	8	35618	35625	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
563	NC_017421	AAAT	2	8	35627	35634	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_017421	TAA	3	9	35639	35647	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
565	NC_017421	A	6	6	35682	35687	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
566	NC_017421	T	7	7	35721	35727	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_017421	AT	3	6	35735	35740	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NC_017421	ATT	2	6	35784	35789	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_017421	A	6	6	35804	35809	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
570	NC_017421	ATT	2	6	36200	36205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NC_017421	T	7	7	36212	36218	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_017421	ATT	2	6	36231	36236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_017421	ATTTA	2	10	36243	36252	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
574	NC_017421	T	8	8	36256	36263	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
575	NC_017421	A	6	6	36280	36285	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
576	NC_017421	TTA	2	6	36320	36325	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
577	NC_017421	TTG	2	6	36353	36358	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
578	NC_017421	AT	3	6	36415	36420	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
579	NC_017421	A	6	6	36453	36458	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
580	NC_017421	A	6	6	36460	36465	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
581	NC_017421	GAT	2	6	36476	36481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
582	NC_017421	TGT	3	9	36500	36508	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
583	NC_017421	ATT	2	6	36518	36523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_017421	TAA	2	6	36572	36577	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
585	NC_017421	ATA	2	6	36578	36583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
586	NC_017421	TTAT	2	8	36584	36591	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
587	NC_017421	T	6	6	36615	36620	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
588	NC_017421	AGC	2	6	36704	36709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
589	NC_017421	ATT	2	6	36710	36715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
590	NC_017421	ATCACC	2	12	36734	36745	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
591	NC_017421	AGC	3	9	36809	36817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
592	NC_017421	TCC	2	6	36875	36880	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
593	NC_017421	TTC	2	6	36918	36923	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
594	NC_017421	CTC	2	6	36932	36937	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
595	NC_017421	ACC	2	6	36938	36943	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
596	NC_017421	CAA	2	6	36967	36972	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
597	NC_017421	TAG	2	6	37015	37020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
598	NC_017421	CTC	3	9	37045	37053	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
599	NC_017421	ACC	2	6	37088	37093	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
600	NC_017421	TTG	2	6	37134	37139	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
601	NC_017421	TTC	2	6	37145	37150	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
602	NC_017421	CAG	2	6	37204	37209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
603	NC_017421	CAA	2	6	37213	37218	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
604	NC_017421	TCT	2	6	37219	37224	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
605	NC_017421	AAC	2	6	37244	37249	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
606	NC_017421	CAA	2	6	37342	37347	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
607	NC_017421	AGC	2	6	37355	37360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
608	NC_017421	CAT	2	6	37376	37381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
609	NC_017421	TCA	3	9	37401	37409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
610	NC_017421	TAT	2	6	37426	37431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_017421	CTT	2	6	37432	37437	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
612	NC_017421	CAGTAT	2	12	37441	37452	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
613	NC_017421	T	6	6	37564	37569	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
614	NC_017421	ATCA	2	8	37597	37604	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
615	NC_017421	T	7	7	37716	37722	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
616	NC_017421	TAA	2	6	37737	37742	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
617	NC_017421	A	6	6	37741	37746	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
618	NC_017421	CCT	2	6	37776	37781	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
619	NC_017421	TA	3	6	37793	37798	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
620	NC_017421	AT	3	6	37811	37816	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
621	NC_017421	TAT	2	6	37822	37827	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
622	NC_017421	ATG	2	6	37828	37833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
623	NC_017421	AAAT	2	8	37837	37844	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
624	NC_017421	ATT	2	6	37867	37872	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
625	NC_017421	TAT	3	9	37875	37883	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
626	NC_017421	A	6	6	37892	37897	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

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