MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Borrelia burgdorferi N40 plasmid N40_lp25

Total Repeats: 433

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017420	TGAC	2	8	22	29	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_017420	TAA	2	6	42	47	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017420	A	6	6	113	118	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017420	T	7	7	151	157	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017420	T	9	9	205	213	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017420	A	7	7	214	220	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017420	T	9	9	239	247	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017420	AATT	2	8	254	261	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017420	TTCTT	2	10	345	354	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_017420	T	6	6	386	391	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017420	T	6	6	393	398	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017420	CTA	2	6	399	404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_017420	TTAT	2	8	407	414	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017420	A	6	6	4246	4251	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017420	AT	3	6	4281	4286	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017420	TATTAA	2	12	4287	4298	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017420	AT	3	6	4301	4306	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017420	A	7	7	4310	4316	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017420	TTAA	2	8	4325	4332	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017420	TAAA	2	8	4345	4352	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017420	AAT	2	6	4383	4388	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017420	ATA	2	6	4396	4401	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017420	TTA	2	6	4407	4412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017420	TTA	2	6	4447	4452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017420	A	7	7	4487	4493	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017420	ATT	2	6	4546	4551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017420	TCT	2	6	4553	4558	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_017420	AGA	2	6	4566	4571	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017420	TTA	2	6	4577	4582	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017420	A	6	6	4591	4596	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017420	CCA	2	6	4642	4647	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_017420	T	6	6	4686	4691	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017420	ATT	2	6	4697	4702	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017420	AAT	2	6	4704	4709	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017420	ATT	2	6	4716	4721	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017420	TAT	2	6	4729	4734	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017420	ATT	3	9	4746	4754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017420	AATTAA	2	12	4758	4769	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017420	TATT	2	8	4770	4777	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017420	AAG	2	6	4791	4796	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017420	TAAAT	2	10	4814	4823	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017420	ATT	2	6	4839	4844	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017420	T	6	6	4969	4974	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017420	TAA	2	6	5031	5036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017420	TAT	2	6	5089	5094	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017420	TTC	2	6	5110	5115	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_017420	AT	3	6	5127	5132	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017420	TAAT	2	8	5142	5149	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017420	ATT	2	6	5167	5172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017420	CCTA	2	8	5193	5200	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_017420	TAA	2	6	5276	5281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017420	A	7	7	5294	5300	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017420	TAC	2	6	5341	5346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_017420	TAAAAA	2	12	5362	5373	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017420	GGAA	2	8	5465	5472	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017420	GAA	2	6	5520	5525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017420	ACT	2	6	5673	5678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_017420	A	6	6	5680	5685	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017420	AAAC	2	8	5755	5762	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_017420	ATT	2	6	5802	5807	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017420	GTT	2	6	5816	5821	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017420	T	6	6	5839	5844	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017420	T	6	6	5876	5881	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017420	ATTT	2	8	5897	5904	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017420	T	6	6	5902	5907	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017420	AT	3	6	5915	5920	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017420	T	7	7	5920	5926	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017420	A	6	6	5927	5932	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017420	TAT	2	6	5935	5940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017420	TTA	2	6	5949	5954	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017420	CTT	2	6	5956	5961	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_017420	CAA	2	6	6047	6052	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_017420	T	6	6	6070	6075	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017420	AAC	2	6	6165	6170	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_017420	T	7	7	6230	6236	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017420	TAA	2	6	6287	6292	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017420	CTT	2	6	6372	6377	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_017420	TTG	2	6	6425	6430	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017420	ATA	2	6	6452	6457	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017420	T	7	7	6470	6476	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017420	TA	3	6	6513	6518	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017420	ATTGAT	2	12	6567	6578	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017420	A	6	6	6625	6630	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017420	A	7	7	7567	7573	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017420	TA	3	6	7620	7625	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017420	TTG	2	6	7645	7650	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017420	GTATTG	2	12	7659	7670	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017420	TCT	2	6	7688	7693	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_017420	T	6	6	7697	7702	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017420	ATA	2	6	7774	7779	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017420	TTAATT	2	12	7786	7797	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017420	AAATTA	2	12	7804	7815	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017420	TAT	4	12	7830	7841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017420	TAA	2	6	7844	7849	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017420	A	6	6	7899	7904	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017420	A	7	7	7933	7939	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017420	ATTT	2	8	7985	7992	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017420	T	6	6	8001	8006	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017420	TTA	2	6	8020	8025	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017420	T	6	6	8078	8083	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017420	TTC	2	6	8121	8126	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_017420	T	7	7	8151	8157	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017420	TAT	2	6	8165	8170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017420	CA	3	6	8206	8211	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_017420	T	7	7	8235	8241	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017420	A	7	7	8244	8250	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017420	TTC	2	6	8256	8261	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_017420	T	6	6	8262	8267	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017420	AATT	2	8	8276	8283	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017420	T	6	6	8295	8300	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017420	TTTA	2	8	8313	8320	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017420	TA	3	6	8325	8330	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017420	T	7	7	8339	8345	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017420	CAA	2	6	8350	8355	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_017420	ATT	2	6	8375	8380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017420	AAT	2	6	8396	8401	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017420	ATT	2	6	8433	8438	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017420	ACAAA	2	10	8446	8455	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
119	NC_017420	AAAT	2	8	8458	8465	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017420	TTTA	2	8	8472	8479	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017420	ACT	2	6	8508	8513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_017420	A	6	6	8567	8572	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017420	AT	3	6	8608	8613	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017420	T	6	6	8632	8637	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017420	TATT	2	8	8656	8663	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017420	ATA	2	6	8672	8677	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017420	ATTT	2	8	8685	8692	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017420	ATG	2	6	8809	8814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017420	AGA	2	6	8820	8825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017420	AAC	2	6	8865	8870	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_017420	A	6	6	8891	8896	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017420	A	6	6	8904	8909	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017420	A	7	7	8933	8939	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017420	AT	3	6	8945	8950	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017420	TA	3	6	8955	8960	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017420	AAC	2	6	9043	9048	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_017420	ATT	2	6	9050	9055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017420	TAT	2	6	9058	9063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017420	T	6	6	9071	9076	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017420	AAT	2	6	9116	9121	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017420	AGA	2	6	9124	9129	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017420	T	8	8	9162	9169	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017420	ATAA	3	12	9202	9213	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017420	A	6	6	9264	9269	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017420	AC	3	6	9342	9347	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
146	NC_017420	TAA	2	6	9993	9998	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017420	TAT	3	9	10518	10526	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017420	AGA	2	6	10537	10542	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017420	AATA	2	8	10543	10550	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017420	A	6	6	10555	10560	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_017420	T	6	6	10573	10578	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_017420	TAT	2	6	10584	10589	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_017420	TAGAA	2	10	10607	10616	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
154	NC_017420	AGC	2	6	10642	10647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
155	NC_017420	T	6	6	10658	10663	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_017420	ATC	2	6	10675	10680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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161	NC_017420	T	6	6	10853	10858	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.