MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Borrelia burgdorferi JD1 plasmid JD1 lp38

Total Repeats: 499

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017413	TCAAAT	2	12	111	122	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_017413	T	7	7	178	184	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017413	T	6	6	193	198	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017413	T	6	6	213	218	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017413	T	8	8	220	227	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017413	TTAT	2	8	234	241	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017413	A	6	6	245	250	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017413	TAT	2	6	254	259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017413	AAT	2	6	266	271	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017413	AGA	2	6	291	296	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017413	TCT	2	6	304	309	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_017413	T	9	9	312	320	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017413	T	6	6	322	327	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017413	TAA	2	6	392	397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017413	ATT	2	6	399	404	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017413	TTTTCT	2	12	409	420	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_017413	A	6	6	423	428	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017413	ATTTAG	2	12	441	452	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017413	TTA	2	6	457	462	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017413	AAGTA	2	10	493	502	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017413	T	6	6	550	555	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017413	TTTCTT	2	12	587	598	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_017413	CAA	2	6	650	655	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_017413	TCT	2	6	657	662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_017413	ATA	2	6	700	705	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017413	AAT	2	6	706	711	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017413	T	6	6	711	716	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017413	TA	4	8	747	754	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017413	CA	3	6	762	767	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_017413	TATC	2	8	896	903	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_017413	CTTT	2	8	919	926	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_017413	A	6	6	942	947	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017413	TAT	3	9	1001	1009	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017413	TAA	2	6	1017	1022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017413	T	6	6	1056	1061	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017413	AT	3	6	1069	1074	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017413	TAA	2	6	1112	1117	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017413	TTC	2	6	1125	1130	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_017413	TAT	2	6	1146	1151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017413	AATTC	2	10	1195	1204	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_017413	ACT	2	6	1266	1271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_017413	T	7	7	1370	1376	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017413	AT	3	6	1418	1423	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017413	ATTC	2	8	1448	1455	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_017413	TTA	2	6	1499	1504	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017413	TAAAT	2	10	1509	1518	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017413	CCA	2	6	1549	1554	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_017413	ATT	2	6	1587	1592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017413	T	7	7	1609	1615	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017413	GAT	2	6	1640	1645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017413	A	7	7	1724	1730	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017413	GGA	2	6	1762	1767	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017413	CTT	2	6	1790	1795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_017413	A	6	6	1824	1829	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017413	TAG	2	6	1834	1839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017413	T	6	6	1856	1861	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017413	T	6	6	1865	1870	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017413	TTAA	2	8	1984	1991	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017413	TTC	2	6	2028	2033	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_017413	TCT	2	6	2068	2073	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_017413	TAG	2	6	2075	2080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017413	T	6	6	2099	2104	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017413	GATA	2	8	2105	2112	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017413	T	7	7	2144	2150	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017413	T	6	6	2179	2184	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017413	ATG	2	6	2241	2246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017413	GTG	2	6	2261	2266	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017413	CTT	2	6	2349	2354	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_017413	CAT	2	6	2402	2407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_017413	TTC	2	6	2409	2414	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_017413	CTTT	2	8	2416	2423	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_017413	ATA	2	6	2425	2430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017413	T	7	7	2454	2460	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017413	TTC	2	6	2592	2597	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_017413	TGA	2	6	2601	2606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017413	TTTC	2	8	2655	2662	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_017413	TTTG	2	8	2715	2722	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017413	CTT	2	6	2741	2746	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_017413	CAA	2	6	2774	2779	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_017413	AGT	2	6	2790	2795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017413	TTTC	2	8	2896	2903	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_017413	TTC	2	6	2931	2936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_017413	ATT	2	6	2964	2969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017413	TCT	2	6	2986	2991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_017413	TTA	2	6	3062	3067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017413	T	7	7	3068	3074	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017413	T	6	6	3088	3093	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017413	TCA	2	6	3100	3105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_017413	A	8	8	3107	3114	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017413	AGA	2	6	3129	3134	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017413	AT	3	6	3187	3192	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017413	A	6	6	3198	3203	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017413	TAAAA	2	10	3210	3219	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017413	TTC	2	6	3228	3233	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_017413	GCTA	2	8	3240	3247	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
96	NC_017413	AT	3	6	3294	3299	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017413	GTC	2	6	3327	3332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_017413	TC	3	6	3336	3341	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_017413	T	6	6	3362	3367	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017413	ATTAC	2	10	3412	3421	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
101	NC_017413	TCTT	2	8	3435	3442	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
102	NC_017413	AAAC	2	8	3464	3471	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_017413	TTC	2	6	3489	3494	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_017413	TTC	2	6	3498	3503	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_017413	AT	3	6	3526	3531	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017413	T	6	6	3533	3538	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017413	TA	3	6	3629	3634	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017413	TCT	2	6	3640	3645	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_017413	ATT	2	6	3735	3740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017413	T	8	8	3739	3746	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017413	CTT	2	6	3749	3754	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_017413	TAT	2	6	3761	3766	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017413	CTTTGT	2	12	3776	3787	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_017413	ACTCC	2	10	3818	3827	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
115	NC_017413	TGT	2	6	3847	3852	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017413	AAT	2	6	3860	3865	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017413	TTC	2	6	3870	3875	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_017413	AT	3	6	3878	3883	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017413	ATC	2	6	3921	3926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_017413	A	6	6	3932	3937	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017413	A	6	6	3957	3962	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017413	TTA	2	6	3973	3978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017413	T	6	6	3988	3993	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017413	AT	3	6	4025	4030	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017413	ATT	2	6	4035	4040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017413	A	6	6	4081	4086	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017413	TAT	2	6	4094	4099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017413	AT	3	6	4115	4120	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017413	TATTAA	2	12	4121	4132	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017413	AT	3	6	4135	4140	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017413	A	7	7	4144	4150	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017413	TTAA	2	8	4159	4166	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017413	ATA	2	6	4196	4201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017413	TTA	2	6	4595	4600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017413	TAAAT	2	10	4636	4645	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017413	ATT	2	6	4661	4666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017413	T	6	6	4979	4984	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017413	A	6	6	5028	5033	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017413	TAC	2	6	5074	5079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_017413	TAAAAA	2	12	5095	5106	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017413	AGGAA	2	10	5196	5205	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017413	GAA	2	6	5252	5257	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017413	AAAG	2	8	5358	5365	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017413	A	6	6	5413	5418	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017413	ACAA	2	8	5486	5493	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
146	NC_017413	A	6	6	5724	5729	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017413	ATTT	2	8	5732	5739	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017413	ATG	2	6	5747	5752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017413	A	6	6	5753	5758	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017413	T	6	6	5769	5774	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_017413	T	6	6	5795	5800	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_017413	T	6	6	5807	5812	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_017413	CTT	2	6	5847	5852	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
154	NC_017413	ATTA	2	8	5868	5875	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_017413	CATA	2	8	5886	5893	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
156	NC_017413	TA	3	6	5895	5900	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_017413	ATTT	2	8	5939	5946	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_017413	A	9	9	5966	5974	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_017413	TAT	2	6	5977	5982	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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163	NC_017413	ATA	2	6	6173	6178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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165	NC_017413	ATA	2	6	6226	6231	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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196	NC_017413	A	6	6	8427	8432	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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198	NC_017413	ATA	3	9	8449	8457	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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262	NC_017413	GTTTA	2	10	15198	15207	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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271	NC_017413	AAAT	2	8	15480	15487	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
272	NC_017413	ATAA	2	8	15539	15546	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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282	NC_017413	AAAT	2	8	15919	15926	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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