MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Borrelia burgdorferi N40 plasmid N40_cp32-4

Total Repeats: 95

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017400	TAA	2	6	46	51	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017400	CTA	2	6	2771	2776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017400	ATA	2	6	2802	2807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017400	TAA	2	6	2831	2836	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017400	TAA	3	9	2853	2861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017400	A	7	7	2860	2866	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017400	TCAA	2	8	3527	3534	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_017400	ATT	2	6	3549	3554	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017400	AGC	2	6	3563	3568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_017400	TCC	2	6	4547	4552	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_017400	TA	3	6	4574	4579	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017400	A	6	6	4621	4626	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017400	TAT	3	9	4681	4689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017400	T	6	6	4689	4694	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017400	TAG	2	6	4706	4711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017400	TGTAG	2	10	4751	4760	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017400	ATCA	2	8	4778	4785	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_017400	TAA	2	6	4829	4834	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017400	T	7	7	4848	4854	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017400	TAA	2	6	4892	4897	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017400	ATT	2	6	4901	4906	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017400	TAG	2	6	4915	4920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017400	AAAT	2	8	7359	7366	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017400	AGG	2	6	7376	7381	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017400	TAA	2	6	8484	8489	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017400	TA	3	6	8495	8500	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017400	T	6	6	8525	8530	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017400	TTTTA	2	10	8554	8563	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017400	AAT	2	6	8574	8579	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017400	TAAGC	2	10	8635	8644	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
31	NC_017400	TTA	2	6	8653	8658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017400	TAA	2	6	8679	8684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017400	TATT	2	8	8691	8698	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017400	ATA	2	6	8699	8704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017400	ATATGT	2	12	8745	8756	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017400	A	7	7	8763	8769	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017400	A	7	7	8782	8788	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017400	T	7	7	8848	8854	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017400	T	6	6	8861	8866	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017400	A	6	6	8869	8874	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017400	AAT	2	6	8884	8889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017400	TA	3	6	8896	8901	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017400	TATT	2	8	8906	8913	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017400	GGA	2	6	8927	8932	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017400	AAT	3	9	8956	8964	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017400	CAA	2	6	9010	9015	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_017400	TCT	2	6	9049	9054	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_017400	A	6	6	9065	9070	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017400	TAAG	2	8	9077	9084	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017400	AGT	2	6	9109	9114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017400	TTG	2	6	9206	9211	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017400	TA	3	6	9290	9295	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017400	ATA	2	6	9356	9361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017400	ATT	2	6	9410	9415	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017400	A	7	7	9418	9424	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017400	CAA	2	6	9452	9457	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_017400	TAA	3	9	9474	9482	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017400	AGT	2	6	9532	9537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017400	T	6	6	9567	9572	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017400	T	6	6	9585	9590	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017400	TGC	2	6	9666	9671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_017400	TAA	2	6	9732	9737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017400	A	7	7	9762	9768	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017400	AG	3	6	9787	9792	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017400	TTG	2	6	9839	9844	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017400	TAG	2	6	9851	9856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017400	GAGTT	2	10	9881	9890	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017400	AATC	2	8	9949	9956	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_017400	A	8	8	10033	10040	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017400	AGAT	2	8	10174	10181	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017400	ACT	2	6	10189	10194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_017400	CAA	2	6	10197	10202	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_017400	TAGTGT	2	12	10243	10254	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017400	A	6	6	10276	10281	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017400	A	7	7	10284	10290	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017400	AGG	2	6	10303	10308	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017400	ATTA	2	8	10309	10316	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017400	AAGTAA	2	12	11559	11570	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017400	TAA	2	6	11579	11584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017400	T	6	6	11694	11699	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017400	AAGA	2	8	11713	11720	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017400	AT	3	6	11737	11742	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017400	AATTT	2	10	11757	11766	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017400	GTG	2	6	11795	11800	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017400	GA	3	6	11812	11817	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017400	TA	3	6	11884	11889	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017400	ATT	2	6	11912	11917	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017400	ATT	2	6	11927	11932	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017400	TAAT	2	8	13768	13775	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017400	GTT	2	6	13816	13821	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017400	T	7	7	13823	13829	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017400	TAT	2	6	13838	13843	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017400	ATTT	2	8	13871	13878	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017400	TAA	2	6	13929	13934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017400	TTA	2	6	13936	13941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.