MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Buchnera aphidicola str. Ua (Uroleucon ambrosiae) plasmid pLeu

Total Repeats: 49

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017261	ATA	2	6	11	16	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017261	T	6	6	24	29	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017261	A	6	6	30	35	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017261	T	9	9	45	53	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017261	TA	3	6	59	64	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017261	T	7	7	65	71	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017261	ATTT	2	8	72	79	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017261	TTA	2	6	102	107	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017261	TAA	2	6	120	125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017261	A	7	7	124	130	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017261	T	6	6	152	157	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017261	A	6	6	160	165	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017261	TAA	2	6	167	172	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017261	A	9	9	177	185	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017261	TAAAAA	2	12	193	204	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017261	A	11	11	200	210	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017261	ATATA	2	10	228	237	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017261	A	6	6	256	261	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017261	A	6	6	278	283	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017261	A	7	7	290	296	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017261	T	6	6	297	302	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017261	A	9	9	303	311	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017261	TAG	2	6	1180	1185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017261	ATTA	2	8	1186	1193	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017261	TTG	2	6	1196	1201	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017261	AAAT	2	8	1202	1209	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017261	AT	3	6	1233	1238	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017261	ACTTT	2	10	1240	1249	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_017261	T	9	9	1252	1260	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017261	AATA	2	8	1264	1271	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017261	ATT	2	6	1302	1307	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017261	AAT	2	6	1311	1316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017261	ATT	2	6	1319	1324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017261	TGA	2	6	1332	1337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017261	AAAT	2	8	1339	1346	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017261	A	9	9	1368	1376	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017261	A	8	8	1392	1399	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017261	A	6	6	1927	1932	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017261	T	8	8	1937	1944	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017261	TGTT	2	8	1954	1961	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017261	TATT	2	8	1998	2005	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017261	ATTTT	2	10	2038	2047	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017261	A	7	7	2851	2857	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017261	T	7	7	2861	2867	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017261	TATAA	2	10	2898	2907	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017261	TAA	2	6	2915	2920	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017261	TTTAT	2	10	2924	2933	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017261	AG	3	6	4528	4533	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017261	T	6	6	4540	4545	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.