MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Buchnera aphidicola str. Ua (Uroleucon ambrosiae) plasmid pTrp

Total Repeats: 80

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017260	ATTTA	2	10	122	131	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017260	GAAA	2	8	135	142	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017260	AT	3	6	148	153	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017260	AAT	2	6	167	172	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017260	TAAA	2	8	192	199	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017260	A	7	7	197	203	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017260	TTA	2	6	236	241	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017260	A	8	8	257	264	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017260	CAAAA	2	10	265	274	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_017260	A	9	9	271	279	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017260	ATA	6	18	284	301	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017260	AAAAT	2	10	302	311	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017260	TAT	2	6	312	317	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017260	T	6	6	320	325	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017260	T	7	7	327	333	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017260	ATTAT	2	10	352	361	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017260	TAATAT	2	12	362	373	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017260	TAT	2	6	405	410	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017260	TAAAAA	2	12	416	427	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017260	AATTTT	2	12	428	439	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017260	AT	3	6	2685	2690	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017260	TAA	2	6	2692	2697	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017260	AAT	2	6	2731	2736	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017260	T	6	6	2738	2743	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017260	AAT	2	6	2788	2793	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017260	TAA	2	6	2825	2830	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017260	TATGAA	2	12	2883	2894	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017260	A	7	7	2893	2899	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017260	CTGA	2	8	2955	2962	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_017260	AAAT	2	8	2966	2973	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017260	ATG	2	6	2999	3004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017260	AT	3	6	3077	3082	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017260	TAT	3	9	3080	3088	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017260	TTA	2	6	3132	3137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017260	AAT	2	6	3175	3180	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017260	ATC	2	6	3192	3197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_017260	CA	4	8	3227	3234	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_017260	TTAT	2	8	3242	3249	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017260	T	6	6	3249	3254	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017260	CA	3	6	3318	3323	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_017260	GCAT	2	8	3332	3339	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
42	NC_017260	T	7	7	3418	3424	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017260	A	7	7	3434	3440	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017260	AAACAA	2	12	3453	3464	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_017260	AGA	2	6	3472	3477	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017260	AAAC	2	8	3596	3603	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_017260	ATT	2	6	3608	3613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017260	ACA	2	6	3617	3622	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_017260	A	8	8	3681	3688	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017260	AAC	2	6	3697	3702	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_017260	ATCA	2	8	3790	3797	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_017260	AAT	2	6	3801	3806	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017260	ATTC	2	8	3814	3821	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_017260	A	6	6	3822	3827	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017260	T	6	6	3834	3839	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017260	T	6	6	3865	3870	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017260	T	6	6	3885	3890	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017260	T	8	8	3934	3941	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017260	ATT	2	6	3965	3970	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017260	TCC	2	6	3981	3986	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_017260	T	7	7	3991	3997	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017260	A	6	6	4069	4074	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017260	GTA	2	6	4083	4088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017260	TAG	2	6	4106	4111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017260	A	6	6	4139	4144	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017260	AATT	2	8	4380	4387	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017260	G	10	10	4410	4419	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017260	GGT	2	6	4426	4431	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017260	TA	3	6	4492	4497	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017260	AGCAGG	2	12	4521	4532	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_017260	AGA	2	6	4557	4562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017260	ACA	2	6	4624	4629	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_017260	T	6	6	4634	4639	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017260	ATTTTA	2	12	4653	4664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017260	TGT	2	6	4724	4729	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017260	ATT	2	6	4758	4763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017260	CATG	2	8	4767	4774	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
78	NC_017260	TTAAA	2	10	4778	4787	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017260	TTAA	2	8	4853	4860	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017260	AGA	2	6	4875	4880	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.