MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Buchnera aphidicola str. JF99 (Acyrthosiphon pisum) chromosome

Total Repeats: 3805

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017253	ACT	2	6	1	6	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_017253	TAA	3	9	29	37	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017253	ATT	3	9	43	51	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017253	T	6	6	50	55	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017253	T	7	7	57	63	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017253	T	7	7	65	71	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017253	AAAGA	2	10	85	94	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017253	T	8	8	103	110	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017253	T	6	6	2104	2109	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017253	T	6	6	2123	2128	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017253	AAAATT	2	12	2139	2150	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017253	ATA	2	6	2174	2179	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017253	T	8	8	2230	2237	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017253	T	6	6	2249	2254	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017253	GA	3	6	2271	2276	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017253	T	7	7	3119	3125	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017253	T	7	7	3383	3389	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017253	T	6	6	3397	3402	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017253	A	6	6	3405	3410	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017253	ATT	2	6	3414	3419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017253	ATT	2	6	3424	3429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017253	T	7	7	3446	3452	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017253	AAT	3	9	4523	4531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017253	TAA	2	6	6082	6087	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017253	TAG	2	6	6982	6987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017253	T	7	7	8399	8405	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017253	AT	3	6	8417	8422	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017253	AAT	2	6	8844	8849	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017253	T	6	6	8863	8868	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017253	A	6	6	8884	8889	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017253	A	6	6	8904	8909	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017253	T	7	7	11341	11347	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017253	ATT	2	6	11358	11363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017253	ATT	2	6	11367	11372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017253	ATT	2	6	11375	11380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017253	A	7	7	11388	11394	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017253	ATT	2	6	11405	11410	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017253	ATT	2	6	11415	11420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017253	TAT	2	6	11421	11426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017253	CAAT	2	8	13942	13949	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_017253	A	7	7	13950	13956	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017253	AT	4	8	13997	14004	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017253	TA	3	6	14010	14015	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017253	T	8	8	14017	14024	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017253	T	6	6	14038	14043	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017253	ATATA	2	10	14090	14099	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017253	T	6	6	14111	14116	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017253	AAG	2	6	14122	14127	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017253	A	7	7	14156	14162	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017253	T	7	7	14198	14204	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017253	T	6	6	14254	14259	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017253	TAAA	2	8	14273	14280	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017253	AAT	2	6	14303	14308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017253	TTA	2	6	14314	14319	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017253	CAA	2	6	14344	14349	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_017253	A	6	6	14348	14353	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017253	ATT	2	6	14536	14541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017253	T	7	7	14540	14546	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017253	A	6	6	14547	14552	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017253	T	6	6	14881	14886	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017253	TA	3	6	14891	14896	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017253	AAT	2	6	14931	14936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017253	AGT	2	6	14951	14956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017253	AT	4	8	16629	16636	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017253	ACC	2	6	18051	18056	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_017253	T	7	7	18105	18111	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017253	ATC	2	6	18119	18124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_017253	TGT	2	6	18135	18140	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017253	T	6	6	18146	18151	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017253	T	6	6	18162	18167	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017253	ATATTT	2	12	18168	18179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017253	T	6	6	18185	18190	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017253	A	8	8	18191	18198	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017253	T	6	6	18203	18208	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017253	TAAA	2	8	18235	18242	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017253	A	7	7	18240	18246	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017253	A	7	7	18248	18254	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017253	TAA	2	6	18277	18282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017253	ATTAA	2	10	18313	18322	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017253	A	6	6	18324	18329	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017253	T	6	6	18333	18338	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017253	AAT	2	6	18341	18346	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017253	ATT	2	6	18355	18360	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017253	TTTAT	2	10	20371	20380	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017253	T	6	6	20386	20391	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017253	T	6	6	20440	20445	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017253	ATT	2	6	20465	20470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017253	AAAT	2	8	20480	20487	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017253	TAA	2	6	20504	20509	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017253	AAT	2	6	20518	20523	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017253	AT	3	6	20546	20551	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017253	A	9	9	20568	20576	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017253	T	7	7	20585	20591	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017253	TAT	2	6	20599	20604	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017253	CAAT	2	8	20628	20635	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_017253	T	6	6	20651	20656	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017253	TCA	2	6	20673	20678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_017253	TATTT	2	10	20684	20693	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017253	T	7	7	20691	20697	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017253	CAT	2	6	20707	20712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_017253	TA	4	8	20757	20764	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017253	ATC	2	6	20779	20784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_017253	T	6	6	20794	20799	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017253	T	7	7	20803	20809	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017253	TA	3	6	20854	20859	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017253	T	7	7	20864	20870	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017253	ATT	2	6	20896	20901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017253	TA	3	6	20906	20911	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017253	TACTT	2	10	20920	20929	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
110	NC_017253	TATAT	2	10	20936	20945	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017253	AT	3	6	20958	20963	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017253	TAA	2	6	20983	20988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017253	T	7	7	21605	21611	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017253	T	6	6	22872	22877	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017253	TAT	2	6	22899	22904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017253	ATT	3	9	22925	22933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017253	ATTG	2	8	22937	22944	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017253	ATT	2	6	23532	23537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017253	AAC	2	6	23568	23573	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_017253	ATTTT	2	10	23585	23594	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017253	T	6	6	23591	23596	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017253	ATT	2	6	24799	24804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017253	TAAAAA	2	12	24806	24817	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017253	T	6	6	24825	24830	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017253	ATT	2	6	24846	24851	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017253	T	6	6	24850	24855	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017253	TTAA	2	8	24879	24886	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017253	TA	3	6	24923	24928	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017253	A	8	8	25830	25837	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017253	T	6	6	25838	25843	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017253	ATT	2	6	25851	25856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017253	TA	3	6	25857	25862	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017253	ATTC	2	8	25882	25889	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
134	NC_017253	A	6	6	25890	25895	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017253	T	8	8	25905	25912	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017253	T	6	6	25926	25931	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017253	TAA	2	6	25938	25943	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017253	T	7	7	26001	26007	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017253	ATA	2	6	26016	26021	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017253	AAT	2	6	26026	26031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017253	A	6	6	26048	26053	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017253	TTC	2	6	26067	26072	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_017253	TTC	2	6	26103	26108	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_017253	A	6	6	26129	26134	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017253	TCC	2	6	26145	26150	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
146	NC_017253	T	8	8	26173	26180	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017253	ATA	2	6	26215	26220	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017253	AAGA	2	8	26358	26365	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017253	T	8	8	26371	26378	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017253	T	10	10	26415	26424	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_017253	TTC	2	6	26430	26435	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_017253	TAT	2	6	26483	26488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_017253	T	7	7	26496	26502	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_017253	TAT	2	6	26508	26513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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452	NC_017253	AGG	2	6	74631	74636	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
453	NC_017253	AGAT	2	8	74688	74695	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
454	NC_017253	T	7	7	74711	74717	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
455	NC_017253	A	6	6	74718	74723	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
456	NC_017253	TTTG	2	8	74729	74736	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
457	NC_017253	A	6	6	76291	76296	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
458	NC_017253	A	6	6	76304	76309	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
459	NC_017253	TTAT	2	8	76310	76317	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
460	NC_017253	A	6	6	76318	76323	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
461	NC_017253	GCATG	2	10	76394	76403	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
462	NC_017253	A	6	6	76470	76475	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
463	NC_017253	T	6	6	76478	76483	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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465	NC_017253	A	8	8	76841	76848	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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468	NC_017253	ATTAAA	2	12	76935	76946	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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470	NC_017253	AT	5	10	76958	76967	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
471	NC_017253	TAA	2	6	76971	76976	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
472	NC_017253	AATTAA	2	12	76983	76994	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
473	NC_017253	T	7	7	77007	77013	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
474	NC_017253	TGT	2	6	77033	77038	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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477	NC_017253	TTA	2	6	82543	82548	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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480	NC_017253	A	6	6	83395	83400	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
481	NC_017253	TAA	2	6	83423	83428	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
482	NC_017253	ATG	2	6	83474	83479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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488	NC_017253	A	9	9	83662	83670	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
489	NC_017253	T	6	6	83694	83699	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
490	NC_017253	A	7	7	83755	83761	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
491	NC_017253	TAA	2	6	83793	83798	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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