MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bradyrhizobium japonicum USDA 6

Total Repeats: 28481

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
24501	NC_017249	G	6	6	8186041	8186046	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
24502	NC_017249	TCG	2	6	8186559	8186564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24503	NC_017249	ACCC	2	8	8186578	8186585	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
24504	NC_017249	TCCCT	2	10	8186601	8186610	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
24505	NC_017249	CGG	2	6	8186669	8186674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
24506	NC_017249	GCT	2	6	8186675	8186680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24507	NC_017249	ATCC	2	8	8186773	8186780	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
24508	NC_017249	TCC	2	6	8187081	8187086	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24509	NC_017249	ATC	2	6	8187096	8187101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24510	NC_017249	AGC	2	6	8187107	8187112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24511	NC_017249	GCAA	2	8	8187114	8187121	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
24512	NC_017249	CCG	3	9	8187185	8187193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
24513	NC_017249	CCG	2	6	8189174	8189179	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
24514	NC_017249	CAG	3	9	8189184	8189192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24515	NC_017249	CTC	2	6	8189847	8189852	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24516	NC_017249	GCCC	2	8	8189854	8189861	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
24517	NC_017249	TGAT	2	8	8189929	8189936	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
24518	NC_017249	GCCA	2	8	8189938	8189945	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
24519	NC_017249	AGG	2	6	8190032	8190037	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24520	NC_017249	CAA	2	6	8190748	8190753	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24521	NC_017249	GGC	2	6	8190770	8190775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
24522	NC_017249	GATC	2	8	8190919	8190926	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
24523	NC_017249	CT	3	6	8191814	8191819	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24524	NC_017249	A	6	6	8191868	8191873	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24525	NC_017249	CCTG	2	8	8191898	8191905	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
24526	NC_017249	GATG	2	8	8191934	8191941	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
24527	NC_017249	GAG	2	6	8192002	8192007	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24528	NC_017249	TCT	2	6	8192075	8192080	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24529	NC_017249	GGAT	2	8	8192366	8192373	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
24530	NC_017249	AG	4	8	8192402	8192409	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24531	NC_017249	CGC	2	6	8192505	8192510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
24532	NC_017249	GAT	2	6	8192553	8192558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24533	NC_017249	AAC	2	6	8192593	8192598	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24534	NC_017249	GTT	2	6	8192648	8192653	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24535	NC_017249	AG	3	6	8192715	8192720	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24536	NC_017249	CCA	2	6	8192734	8192739	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24537	NC_017249	CGGC	2	8	8192881	8192888	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24538	NC_017249	CTA	2	6	8192894	8192899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24539	NC_017249	CGA	2	6	8192921	8192926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24540	NC_017249	C	6	6	8199450	8199455	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
24541	NC_017249	ATA	2	6	8199469	8199474	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24542	NC_017249	GCA	2	6	8199514	8199519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24543	NC_017249	CAT	2	6	8199551	8199556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24544	NC_017249	ACA	2	6	8199638	8199643	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24545	NC_017249	CCG	2	6	8199695	8199700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
24546	NC_017249	GCT	2	6	8199728	8199733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24547	NC_017249	CGG	2	6	8199754	8199759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
24548	NC_017249	GCT	2	6	8199782	8199787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24549	NC_017249	T	6	6	8199797	8199802	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24550	NC_017249	CGA	2	6	8199814	8199819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24551	NC_017249	AAAC	2	8	8199829	8199836	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
24552	NC_017249	T	6	6	8199863	8199868	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24553	NC_017249	GCA	2	6	8199879	8199884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24554	NC_017249	CAT	2	6	8199898	8199903	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24555	NC_017249	CCG	2	6	8200024	8200029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
24556	NC_017249	AAG	2	6	8200223	8200228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24557	NC_017249	GCGCA	2	10	8200229	8200238	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
24558	NC_017249	TGA	2	6	8200357	8200362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24559	NC_017249	CGGC	2	8	8200380	8200387	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24560	NC_017249	CG	3	6	8200389	8200394	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24561	NC_017249	AAC	2	6	8200431	8200436	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24562	NC_017249	GAA	2	6	8200525	8200530	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24563	NC_017249	CTG	2	6	8200548	8200553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24564	NC_017249	TTCGC	2	10	8200664	8200673	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
24565	NC_017249	CAA	2	6	8200725	8200730	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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24567	NC_017249	GCT	2	6	8200835	8200840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24568	NC_017249	CTT	2	6	8201295	8201300	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24569	NC_017249	TGCG	2	8	8201468	8201475	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
24570	NC_017249	GTC	2	6	8201568	8201573	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24571	NC_017249	TGT	2	6	8201661	8201666	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24572	NC_017249	CAA	2	6	8201717	8201722	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24573	NC_017249	AGT	2	6	8201744	8201749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24574	NC_017249	GGC	2	6	8201795	8201800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
24575	NC_017249	GC	3	6	8201818	8201823	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24576	NC_017249	CTCG	2	8	8201828	8201835	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
24577	NC_017249	CGTC	2	8	8202972	8202979	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
24578	NC_017249	TACAG	2	10	8203016	8203025	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
24579	NC_017249	TAG	2	6	8203032	8203037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24580	NC_017249	TACC	2	8	8203043	8203050	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
24581	NC_017249	TGGTG	2	10	8203051	8203060	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
24582	NC_017249	GA	3	6	8203083	8203088	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24583	NC_017249	GCG	2	6	8203137	8203142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
24584	NC_017249	CG	3	6	8203169	8203174	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24585	NC_017249	GC	4	8	8203198	8203205	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24586	NC_017249	CG	3	6	8203215	8203220	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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24591	NC_017249	GGTG	2	8	8203480	8203487	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
24592	NC_017249	CGT	2	6	8203489	8203494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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24594	NC_017249	CGA	2	6	8203576	8203581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24595	NC_017249	GCC	2	6	8203603	8203608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
24596	NC_017249	CGG	2	6	8204094	8204099	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
24597	NC_017249	TCT	2	6	8204114	8204119	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24598	NC_017249	CCG	2	6	8204143	8204148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
24599	NC_017249	CAC	2	6	8204166	8204171	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24600	NC_017249	GCA	2	6	8204186	8204191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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24603	NC_017249	AGC	2	6	8204359	8204364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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24606	NC_017249	TGA	2	6	8204497	8204502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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24609	NC_017249	CGA	2	6	8204581	8204586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24610	NC_017249	GCG	2	6	8204652	8204657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
24611	NC_017249	GC	3	6	8204758	8204763	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24612	NC_017249	GTC	2	6	8204769	8204774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24613	NC_017249	GGT	2	6	8204779	8204784	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24614	NC_017249	GC	3	6	8204872	8204877	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24615	NC_017249	C	6	6	8204886	8204891	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
24616	NC_017249	GCG	2	6	8204906	8204911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
24617	NC_017249	CTTT	2	8	8204956	8204963	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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24619	NC_017249	TC	3	6	8204988	8204993	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24620	NC_017249	GCC	2	6	8206497	8206502	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
24621	NC_017249	CGG	2	6	8206528	8206533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
24622	NC_017249	CTC	2	6	8206551	8206556	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24623	NC_017249	CTCAA	2	10	8206588	8206597	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
24624	NC_017249	AAG	2	6	8206598	8206603	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24625	NC_017249	CGA	2	6	8206620	8206625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24626	NC_017249	CGAT	2	8	8206685	8206692	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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24628	NC_017249	AAAC	3	12	8206784	8206795	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
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