MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bradyrhizobium japonicum USDA 6

Total Repeats: 28481

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
19001	NC_017249	CCG	3	9	6294501	6294509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19002	NC_017249	TCT	2	6	6294569	6294574	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19003	NC_017249	GCG	2	6	6294652	6294657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19004	NC_017249	GGC	2	6	6295604	6295609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19005	NC_017249	GAG	2	6	6295663	6295668	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19006	NC_017249	AG	3	6	6295667	6295672	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19007	NC_017249	ACC	2	6	6295705	6295710	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19008	NC_017249	CA	3	6	6295711	6295716	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
19009	NC_017249	CCAA	2	8	6295774	6295781	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
19010	NC_017249	GCG	2	6	6295811	6295816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19011	NC_017249	GCA	2	6	6295976	6295981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19012	NC_017249	AG	3	6	6300857	6300862	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19013	NC_017249	CTG	2	6	6300990	6300995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19014	NC_017249	GCCTA	2	10	6301020	6301029	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
19015	NC_017249	TGT	2	6	6301100	6301105	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19016	NC_017249	GCC	2	6	6301181	6301186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19017	NC_017249	CGA	2	6	6301223	6301228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19018	NC_017249	GAC	2	6	6301435	6301440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19019	NC_017249	TTG	2	6	6301480	6301485	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19020	NC_017249	TCG	2	6	6301524	6301529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19021	NC_017249	TCT	2	6	6301560	6301565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19022	NC_017249	CGG	2	6	6301635	6301640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19023	NC_017249	CGC	2	6	6302829	6302834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19024	NC_017249	T	7	7	6302841	6302847	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19025	NC_017249	AG	3	6	6302880	6302885	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19026	NC_017249	GCA	2	6	6302945	6302950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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19028	NC_017249	AGT	2	6	6305909	6305914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19029	NC_017249	ATCAG	2	10	6305932	6305941	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
19030	NC_017249	GC	3	6	6306013	6306018	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19031	NC_017249	GA	4	8	6306063	6306070	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19032	NC_017249	ACG	2	6	6306103	6306108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19033	NC_017249	GC	3	6	6306181	6306186	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19034	NC_017249	ATGG	2	8	6308085	6308092	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
19035	NC_017249	CCG	2	6	6309002	6309007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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19037	NC_017249	TATT	2	8	6309061	6309068	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
19038	NC_017249	AAAT	2	8	6309123	6309130	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
19039	NC_017249	C	6	6	6309268	6309273	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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19041	NC_017249	CCG	2	6	6310155	6310160	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19042	NC_017249	GTT	2	6	6311245	6311250	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19043	NC_017249	TGG	2	6	6311321	6311326	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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19046	NC_017249	AAC	2	6	6311438	6311443	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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19052	NC_017249	CGG	2	6	6311740	6311745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19053	NC_017249	CCG	2	6	6311755	6311760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19054	NC_017249	AGG	2	6	6311770	6311775	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19055	NC_017249	GGC	2	6	6312384	6312389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19056	NC_017249	CAC	2	6	6312417	6312422	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19057	NC_017249	CTT	2	6	6312432	6312437	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19058	NC_017249	TTC	2	6	6312549	6312554	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19059	NC_017249	ACA	2	6	6312593	6312598	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19060	NC_017249	AGG	2	6	6312705	6312710	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19061	NC_017249	CGG	2	6	6313344	6313349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19062	NC_017249	CGGAC	2	10	6313445	6313454	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
19063	NC_017249	CGG	2	6	6313457	6313462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19064	NC_017249	CG	3	6	6313585	6313590	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19065	NC_017249	CCTAA	2	10	6313647	6313656	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
19066	NC_017249	AG	3	6	6313689	6313694	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19067	NC_017249	CTG	2	6	6313722	6313727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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19069	NC_017249	CCTA	2	8	6315734	6315741	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
19070	NC_017249	ACG	2	6	6315808	6315813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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19072	NC_017249	CCG	2	6	6315955	6315960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19073	NC_017249	CGT	2	6	6316005	6316010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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19075	NC_017249	TCG	2	6	6317168	6317173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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19079	NC_017249	CTGA	2	8	6317446	6317453	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
19080	NC_017249	CTC	2	6	6317482	6317487	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19081	NC_017249	GATCG	2	10	6317497	6317506	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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19093	NC_017249	CGA	2	6	6326677	6326682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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19096	NC_017249	GAA	2	6	6333007	6333012	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19097	NC_017249	GCCC	2	8	6333074	6333081	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
19098	NC_017249	CAT	2	6	6333087	6333092	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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19102	NC_017249	TCGA	2	8	6335139	6335146	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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19104	NC_017249	GTCGC	2	10	6335237	6335246	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
19105	NC_017249	GCG	2	6	6335263	6335268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19106	NC_017249	GCC	2	6	6335270	6335275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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19109	NC_017249	GC	3	6	6335531	6335536	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19110	NC_017249	TCC	2	6	6335624	6335629	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19111	NC_017249	CCGAG	2	10	6335638	6335647	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
19112	NC_017249	GTC	2	6	6335657	6335662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19113	NC_017249	GAC	2	6	6335663	6335668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19114	NC_017249	GCG	2	6	6335672	6335677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19115	NC_017249	CGC	2	6	6335678	6335683	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19116	NC_017249	CTC	2	6	6336549	6336554	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19117	NC_017249	GCAG	2	8	6337557	6337564	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
19118	NC_017249	TCCGC	2	10	6337591	6337600	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
19119	NC_017249	CGA	2	6	6337978	6337983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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19123	NC_017249	TC	3	6	6342583	6342588	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19124	NC_017249	CGA	2	6	6342594	6342599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19125	NC_017249	CCCCA	2	10	6344229	6344238	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
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19255	NC_017249	CGG	2	6	6403469	6403474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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19257	NC_017249	GACA	2	8	6408721	6408728	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
19258	NC_017249	CA	3	6	6409847	6409852	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
19259	NC_017249	GCG	2	6	6412063	6412068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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19261	NC_017249	CGG	2	6	6412083	6412088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19262	NC_017249	GCGCC	2	10	6412390	6412399	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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19269	NC_017249	GCCC	2	8	6412843	6412850	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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19273	NC_017249	GCG	2	6	6413487	6413492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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19291	NC_017249	CG	3	6	6416252	6416257	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19292	NC_017249	TCG	2	6	6416269	6416274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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19372	NC_017249	GGAA	2	8	6438356	6438363	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19373	NC_017249	GGC	2	6	6444696	6444701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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19375	NC_017249	CAC	2	6	6447598	6447603	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19376	NC_017249	ACA	2	6	6447607	6447612	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19377	NC_017249	CCG	2	6	6447653	6447658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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19383	NC_017249	CAT	2	6	6448435	6448440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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19385	NC_017249	CCAGA	2	10	6450583	6450592	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
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