MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bradyrhizobium japonicum USDA 6

Total Repeats: 28481

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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7002	NC_017249	GGC	2	6	2348835	2348840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7003	NC_017249	CGG	2	6	2348842	2348847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7004	NC_017249	CGA	3	9	2348877	2348885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7005	NC_017249	GC	3	6	2349014	2349019	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7006	NC_017249	GCC	2	6	2350572	2350577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7007	NC_017249	TCG	2	6	2350578	2350583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7008	NC_017249	GT	3	6	2350644	2350649	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7009	NC_017249	GCGG	2	8	2350725	2350732	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
7010	NC_017249	TCG	2	6	2350833	2350838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7011	NC_017249	GCG	2	6	2350881	2350886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7012	NC_017249	GGTTC	2	10	2350903	2350912	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
7013	NC_017249	GCG	2	6	2350922	2350927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7014	NC_017249	AGACC	2	10	2350942	2350951	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
7015	NC_017249	CGC	2	6	2351245	2351250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7016	NC_017249	CGTC	2	8	2351326	2351333	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7017	NC_017249	GTT	2	6	2351380	2351385	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7019	NC_017249	CG	3	6	2351435	2351440	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7020	NC_017249	GC	3	6	2351470	2351475	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7021	NC_017249	GTG	2	6	2351501	2351506	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7022	NC_017249	GCG	2	6	2351558	2351563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7023	NC_017249	CG	4	8	2352208	2352215	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7024	NC_017249	GTT	2	6	2352270	2352275	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7031	NC_017249	GC	3	6	2354899	2354904	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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7035	NC_017249	GA	3	6	2355349	2355354	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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7040	NC_017249	GCCG	2	8	2359984	2359991	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7041	NC_017249	ACGA	2	8	2360032	2360039	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
7042	NC_017249	GGC	2	6	2360072	2360077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7043	NC_017249	TGTC	2	8	2360167	2360174	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
7044	NC_017249	GCG	2	6	2360230	2360235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7045	NC_017249	CTA	3	9	2361786	2361794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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7047	NC_017249	TTG	2	6	2361873	2361878	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7049	NC_017249	TTCC	2	8	2363819	2363826	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7050	NC_017249	TCCA	2	8	2363871	2363878	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
7051	NC_017249	CGG	2	6	2363898	2363903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7052	NC_017249	CG	3	6	2363937	2363942	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7053	NC_017249	CTA	2	6	2363983	2363988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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7057	NC_017249	GC	5	10	2367415	2367424	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7058	NC_017249	GCC	2	6	2368581	2368586	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7059	NC_017249	TCT	2	6	2371371	2371376	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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7061	NC_017249	CG	3	6	2372884	2372889	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7062	NC_017249	GAA	2	6	2373912	2373917	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7067	NC_017249	CTTG	2	8	2379475	2379482	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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7071	NC_017249	CTCTC	2	10	2379642	2379651	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
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7079	NC_017249	GAG	2	6	2382006	2382011	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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7095	NC_017249	CGC	2	6	2396535	2396540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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7098	NC_017249	GGGGC	2	10	2398682	2398691	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
7099	NC_017249	TGC	2	6	2398700	2398705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7101	NC_017249	CGCC	2	8	2398732	2398739	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
7102	NC_017249	GTC	2	6	2399650	2399655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7103	NC_017249	GAA	2	6	2399660	2399665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7108	NC_017249	TCA	2	6	2401273	2401278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7109	NC_017249	GAGC	2	8	2401305	2401312	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7110	NC_017249	GGT	2	6	2401317	2401322	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7111	NC_017249	CG	3	6	2401371	2401376	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7112	NC_017249	CAA	2	6	2402795	2402800	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7113	NC_017249	CG	3	6	2403061	2403066	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7114	NC_017249	CCT	2	6	2403848	2403853	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7115	NC_017249	GCCG	2	8	2403915	2403922	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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7118	NC_017249	ACAT	2	8	2406755	2406762	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7119	NC_017249	CGGCG	2	10	2406803	2406812	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
7120	NC_017249	CGA	2	6	2406813	2406818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7123	NC_017249	GGGA	2	8	2409399	2409406	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
7124	NC_017249	GTT	2	6	2412399	2412404	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7126	NC_017249	TGCTG	2	10	2412494	2412503	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
7127	NC_017249	TTTG	2	8	2412504	2412511	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
7128	NC_017249	GCA	2	6	2412540	2412545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7129	NC_017249	G	6	6	2412627	2412632	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
7130	NC_017249	AGCC	2	8	2412648	2412655	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7131	NC_017249	TCGC	2	8	2412658	2412665	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7132	NC_017249	GCG	2	6	2412671	2412676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7133	NC_017249	GCCA	2	8	2412680	2412687	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7134	NC_017249	CGA	2	6	2415117	2415122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7135	NC_017249	G	6	6	2415129	2415134	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
7136	NC_017249	TGA	2	6	2415162	2415167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7137	NC_017249	TGA	2	6	2415191	2415196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7138	NC_017249	CCGG	2	8	2415202	2415209	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7139	NC_017249	TCTG	2	8	2416147	2416154	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
7140	NC_017249	C	7	7	2418222	2418228	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
7141	NC_017249	GA	3	6	2418338	2418343	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7142	NC_017249	CGT	2	6	2418345	2418350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7143	NC_017249	GAC	2	6	2419726	2419731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7144	NC_017249	G	7	7	2419814	2419820	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
7145	NC_017249	GA	3	6	2419823	2419828	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7146	NC_017249	GCGA	2	8	2421725	2421732	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7147	NC_017249	CCG	2	6	2421743	2421748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7148	NC_017249	GTCT	2	8	2421777	2421784	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
7149	NC_017249	TCG	2	6	2421808	2421813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7150	NC_017249	CTC	2	6	2421819	2421824	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7151	NC_017249	GTC	2	6	2421842	2421847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7152	NC_017249	TCC	2	6	2423201	2423206	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7153	NC_017249	ATG	2	6	2423209	2423214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7154	NC_017249	GC	3	6	2423263	2423268	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7155	NC_017249	GCCG	2	8	2423274	2423281	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7156	NC_017249	TTG	2	6	2424356	2424361	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7157	NC_017249	CGG	2	6	2424376	2424381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7158	NC_017249	GTTG	2	8	2424426	2424433	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7159	NC_017249	GCG	2	6	2424439	2424444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7160	NC_017249	TCCG	2	8	2424468	2424475	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7161	NC_017249	GCC	2	6	2424488	2424493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7162	NC_017249	CA	3	6	2424515	2424520	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7163	NC_017249	ATT	2	6	2424568	2424573	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7164	NC_017249	GC	3	6	2426308	2426313	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7165	NC_017249	CGC	2	6	2426347	2426352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7166	NC_017249	CGCC	2	8	2426393	2426400	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
7167	NC_017249	GCC	2	6	2427498	2427503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7168	NC_017249	TTG	2	6	2428482	2428487	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7169	NC_017249	GGCTT	2	10	2428523	2428532	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
7170	NC_017249	GAG	2	6	2428533	2428538	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7171	NC_017249	CCCTCC	2	12	2428975	2428986	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
7172	NC_017249	CCCGG	2	10	2429997	2430006	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
7173	NC_017249	CGG	2	6	2430030	2430035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7174	NC_017249	TGG	2	6	2430121	2430126	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7175	NC_017249	CTTG	2	8	2430215	2430222	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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7177	NC_017249	GCT	2	6	2430232	2430237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7179	NC_017249	AGTTG	2	10	2431644	2431653	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
7180	NC_017249	GC	3	6	2433287	2433292	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7181	NC_017249	CTCG	2	8	2433306	2433313	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7182	NC_017249	GA	3	6	2433316	2433321	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7183	NC_017249	TC	3	6	2433755	2433760	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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7194	NC_017249	TCG	2	6	2434451	2434456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7195	NC_017249	GCT	2	6	2434516	2434521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7197	NC_017249	AGGATG	2	12	2434535	2434546	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
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7199	NC_017249	GCGCG	2	10	2434992	2435001	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
7200	NC_017249	CTT	2	6	2435603	2435608	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7201	NC_017249	AG	5	10	2435643	2435652	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7202	NC_017249	CCA	2	6	2436084	2436089	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7203	NC_017249	CGC	2	6	2436101	2436106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7204	NC_017249	CT	3	6	2436121	2436126	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7205	NC_017249	GAT	2	6	2436169	2436174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7209	NC_017249	AGA	2	6	2436450	2436455	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7211	NC_017249	GCG	2	6	2436496	2436501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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7214	NC_017249	TGG	2	6	2437898	2437903	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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7216	NC_017249	AAGCG	2	10	2439666	2439675	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
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7219	NC_017249	GA	3	6	2439702	2439707	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7220	NC_017249	CCG	2	6	2440928	2440933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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7229	NC_017249	GAA	2	6	2449105	2449110	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7230	NC_017249	GCGCT	2	10	2449111	2449120	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
7231	NC_017249	CG	3	6	2449178	2449183	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7232	NC_017249	GCT	2	6	2449196	2449201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7239	NC_017249	TCCT	2	8	2454445	2454452	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7240	NC_017249	GCC	2	6	2454502	2454507	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7241	NC_017249	CAA	2	6	2454519	2454524	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7242	NC_017249	CTG	2	6	2454552	2454557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7245	NC_017249	ACCA	2	8	2454670	2454677	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7246	NC_017249	CAC	2	6	2454686	2454691	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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7248	NC_017249	GAA	2	6	2454719	2454724	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7249	NC_017249	CGA	2	6	2454728	2454733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7250	NC_017249	TTGG	2	8	2454802	2454809	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7251	NC_017249	GTT	2	6	2454835	2454840	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7252	NC_017249	TCC	2	6	2454854	2454859	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7253	NC_017249	GCA	2	6	2454865	2454870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7254	NC_017249	CCA	2	6	2454911	2454916	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7255	NC_017249	TCG	2	6	2454925	2454930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7256	NC_017249	ATG	2	6	2454933	2454938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7257	NC_017249	GACT	2	8	2454992	2454999	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7258	NC_017249	CG	3	6	2455015	2455020	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7259	NC_017249	GC	3	6	2455495	2455500	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7260	NC_017249	CTG	2	6	2455581	2455586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7261	NC_017249	GAC	2	6	2455601	2455606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7395	NC_017249	CGC	2	6	2503075	2503080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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