MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bradyrhizobium japonicum USDA 6

Total Repeats: 28481

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_017249	TAC	2	6	2147471	2147476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6502	NC_017249	TCG	2	6	2147525	2147530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6503	NC_017249	AC	3	6	2148570	2148575	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6504	NC_017249	GAT	2	6	2148582	2148587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6505	NC_017249	GCA	2	6	2148711	2148716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6506	NC_017249	GCT	2	6	2148779	2148784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6507	NC_017249	GC	3	6	2151265	2151270	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6508	NC_017249	GGC	2	6	2151293	2151298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6509	NC_017249	CGGC	2	8	2151716	2151723	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6510	NC_017249	CTTC	2	8	2151734	2151741	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6511	NC_017249	CAT	2	6	2152329	2152334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6512	NC_017249	AT	3	6	2152340	2152345	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6513	NC_017249	GGA	2	6	2152355	2152360	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6514	NC_017249	ACG	2	6	2152981	2152986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6515	NC_017249	GGT	2	6	2152995	2153000	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6516	NC_017249	CCAG	2	8	2153617	2153624	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6517	NC_017249	TCT	2	6	2154205	2154210	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6518	NC_017249	CGG	2	6	2154277	2154282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6519	NC_017249	CCG	2	6	2154283	2154288	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6520	NC_017249	ATT	2	6	2156104	2156109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6521	NC_017249	GC	4	8	2156122	2156129	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6522	NC_017249	TCGC	2	8	2156240	2156247	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6523	NC_017249	CGC	2	6	2156259	2156264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6524	NC_017249	GCA	2	6	2159575	2159580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6525	NC_017249	TGC	2	6	2159619	2159624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6526	NC_017249	AAT	2	6	2159637	2159642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6527	NC_017249	CG	3	6	2161540	2161545	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6528	NC_017249	CG	3	6	2161565	2161570	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6529	NC_017249	CCG	2	6	2161645	2161650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6530	NC_017249	TTG	2	6	2163398	2163403	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6531	NC_017249	GT	3	6	2163464	2163469	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6532	NC_017249	GCG	2	6	2163474	2163479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6533	NC_017249	GGC	2	6	2163514	2163519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6534	NC_017249	CGTC	2	8	2163551	2163558	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6535	NC_017249	TATCC	2	10	2165211	2165220	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
6536	NC_017249	GTC	2	6	2167397	2167402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6537	NC_017249	GAC	2	6	2168326	2168331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6538	NC_017249	GTCG	2	8	2168345	2168352	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6539	NC_017249	TCA	2	6	2168376	2168381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6540	NC_017249	GCAG	2	8	2168391	2168398	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6541	NC_017249	TGG	2	6	2168446	2168451	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6542	NC_017249	CCG	2	6	2168461	2168466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6543	NC_017249	GCAAC	2	10	2168939	2168948	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
6544	NC_017249	AC	3	6	2168955	2168960	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6545	NC_017249	GCG	2	6	2171718	2171723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6546	NC_017249	CTT	2	6	2171728	2171733	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6547	NC_017249	CGC	2	6	2171798	2171803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6548	NC_017249	GGT	2	6	2172948	2172953	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6549	NC_017249	CGG	2	6	2172955	2172960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6550	NC_017249	GCGA	2	8	2173030	2173037	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6551	NC_017249	AG	3	6	2173169	2173174	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6552	NC_017249	GCC	2	6	2173177	2173182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6553	NC_017249	A	7	7	2173222	2173228	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6554	NC_017249	GC	3	6	2173245	2173250	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6555	NC_017249	TGA	2	6	2173258	2173263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6556	NC_017249	GCG	2	6	2173286	2173291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6557	NC_017249	GGT	2	6	2173302	2173307	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6558	NC_017249	CGCGT	2	10	2173315	2173324	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
6559	NC_017249	AGGCA	2	10	2175746	2175755	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
6560	NC_017249	GCGA	2	8	2175875	2175882	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6561	NC_017249	TCG	2	6	2175886	2175891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6562	NC_017249	CG	3	6	2176009	2176014	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6563	NC_017249	CCG	2	6	2176024	2176029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6564	NC_017249	GCA	2	6	2176031	2176036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6565	NC_017249	GGA	2	6	2176038	2176043	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6566	NC_017249	TGG	2	6	2176684	2176689	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6567	NC_017249	TCG	2	6	2176693	2176698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6568	NC_017249	CG	3	6	2176697	2176702	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6569	NC_017249	CGA	2	6	2179821	2179826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6570	NC_017249	GGGC	2	8	2180887	2180894	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
6571	NC_017249	GCA	2	6	2181833	2181838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6572	NC_017249	CGAT	2	8	2181958	2181965	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6573	NC_017249	GTC	2	6	2184376	2184381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6574	NC_017249	GAGT	2	8	2184417	2184424	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
6575	NC_017249	GTTGA	2	10	2187695	2187704	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
6576	NC_017249	GCT	2	6	2187745	2187750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6577	NC_017249	CTC	2	6	2188497	2188502	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6578	NC_017249	CCG	2	6	2188509	2188514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6579	NC_017249	GC	3	6	2188571	2188576	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6580	NC_017249	CTG	2	6	2188582	2188587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6581	NC_017249	GCG	2	6	2190052	2190057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6582	NC_017249	CTT	2	6	2190093	2190098	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6583	NC_017249	CGCC	2	8	2190171	2190178	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6584	NC_017249	GCAA	2	8	2190262	2190269	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6585	NC_017249	AGG	2	6	2191327	2191332	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6586	NC_017249	CAC	2	6	2191338	2191343	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6587	NC_017249	GT	3	6	2192957	2192962	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6588	NC_017249	GAT	2	6	2193876	2193881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6589	NC_017249	TG	3	6	2193994	2193999	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6590	NC_017249	GCC	2	6	2194002	2194007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6591	NC_017249	TTG	2	6	2195235	2195240	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6592	NC_017249	CG	3	6	2195246	2195251	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6593	NC_017249	GCA	2	6	2195278	2195283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6594	NC_017249	GGC	2	6	2195401	2195406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6595	NC_017249	CG	3	6	2195428	2195433	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6596	NC_017249	CGT	2	6	2199181	2199186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6597	NC_017249	T	6	6	2199212	2199217	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6598	NC_017249	GCA	2	6	2199245	2199250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6599	NC_017249	TCT	2	6	2199469	2199474	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6600	NC_017249	TCC	2	6	2199485	2199490	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6601	NC_017249	CCGG	2	8	2199519	2199526	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6602	NC_017249	CGC	2	6	2199657	2199662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6603	NC_017249	TCC	2	6	2201201	2201206	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6604	NC_017249	TCA	2	6	2201230	2201235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6605	NC_017249	GCA	2	6	2201292	2201297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6606	NC_017249	GCA	2	6	2201316	2201321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6607	NC_017249	ATGAG	2	10	2201341	2201350	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
6608	NC_017249	GAGCC	2	10	2201367	2201376	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
6609	NC_017249	TC	3	6	2201397	2201402	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6610	NC_017249	CGT	2	6	2201466	2201471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6611	NC_017249	GA	3	6	2201473	2201478	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6612	NC_017249	GC	3	6	2201504	2201509	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6613	NC_017249	CAGC	2	8	2203275	2203282	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6614	NC_017249	CCA	2	6	2203376	2203381	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6615	NC_017249	GAC	2	6	2203484	2203489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6616	NC_017249	GCA	2	6	2205076	2205081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6617	NC_017249	CTT	2	6	2205084	2205089	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6618	NC_017249	CG	3	6	2205128	2205133	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6619	NC_017249	AAC	2	6	2205159	2205164	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6620	NC_017249	TCGCT	2	10	2205187	2205196	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
6621	NC_017249	GCC	2	6	2205226	2205231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6622	NC_017249	ACC	2	6	2205242	2205247	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6623	NC_017249	CG	3	6	2206119	2206124	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6624	NC_017249	GCA	2	6	2206136	2206141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6625	NC_017249	ACCG	2	8	2206163	2206170	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6626	NC_017249	GC	3	6	2206304	2206309	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6627	NC_017249	GGC	2	6	2206317	2206322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6628	NC_017249	GGC	2	6	2206389	2206394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6629	NC_017249	CGA	2	6	2206413	2206418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6631	NC_017249	GTCT	2	8	2206571	2206578	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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