MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Brachyspira intermedia PWS/A chromosome

Total Repeats: 20300

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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19502	NC_017243	TAT	2	6	3199953	3199958	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19503	NC_017243	AT	3	6	3199957	3199962	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19504	NC_017243	A	7	7	3199963	3199969	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19505	NC_017243	T	6	6	3199994	3199999	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19506	NC_017243	TA	3	6	3200008	3200013	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19507	NC_017243	TAA	2	6	3200026	3200031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19508	NC_017243	T	6	6	3200032	3200037	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19509	NC_017243	ATT	2	6	3200038	3200043	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19510	NC_017243	TAT	2	6	3200935	3200940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19511	NC_017243	TCGCC	2	10	3200949	3200958	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
19512	NC_017243	AGT	2	6	3200963	3200968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19513	NC_017243	GGCTC	2	10	3200990	3200999	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
19514	NC_017243	T	6	6	3201002	3201007	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19515	NC_017243	T	6	6	3201035	3201040	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19516	NC_017243	TGT	2	6	3201045	3201050	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19517	NC_017243	TGCCT	2	10	3201067	3201076	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
19518	NC_017243	AGT	2	6	3201105	3201110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19519	NC_017243	T	6	6	3201138	3201143	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19520	NC_017243	TTA	2	6	3201182	3201187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19521	NC_017243	GT	3	6	3201200	3201205	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
19522	NC_017243	CTA	2	6	3201207	3201212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19523	NC_017243	T	7	7	3201215	3201221	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19524	NC_017243	TA	3	6	3201224	3201229	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19525	NC_017243	T	6	6	3201241	3201246	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19526	NC_017243	T	6	6	3201261	3201266	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19527	NC_017243	TA	5	10	3201275	3201284	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19528	NC_017243	A	6	6	3201313	3201318	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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19531	NC_017243	AAAT	2	8	3202408	3202415	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
19532	NC_017243	TAT	2	6	3202451	3202456	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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19535	NC_017243	ATT	2	6	3202514	3202519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19536	NC_017243	TAA	2	6	3202522	3202527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19537	NC_017243	TAA	2	6	3202539	3202544	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19538	NC_017243	AAAT	2	8	3202554	3202561	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
19539	NC_017243	TAT	2	6	3202597	3202602	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19540	NC_017243	TA	5	10	3202606	3202615	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19541	NC_017243	AT	3	6	3202631	3202636	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19542	NC_017243	GCT	2	6	3202699	3202704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19543	NC_017243	TAT	2	6	3202718	3202723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19544	NC_017243	T	6	6	3203299	3203304	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19545	NC_017243	TA	3	6	3203308	3203313	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19546	NC_017243	ATT	2	6	3203319	3203324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19547	NC_017243	ACTT	2	8	3203349	3203356	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
19548	NC_017243	TAT	2	6	3203376	3203381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19549	NC_017243	T	6	6	3203381	3203386	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19550	NC_017243	ATT	2	6	3203390	3203395	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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19552	NC_017243	ATA	2	6	3203429	3203434	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19553	NC_017243	ATAAAA	2	12	3203444	3203455	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19554	NC_017243	TAA	2	6	3203463	3203468	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19555	NC_017243	TA	3	6	3203469	3203474	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19556	NC_017243	TA	3	6	3203502	3203507	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19557	NC_017243	TA	3	6	3203511	3203516	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19558	NC_017243	AT	3	6	3203526	3203531	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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19560	NC_017243	ATT	2	6	3203546	3203551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19561	NC_017243	T	6	6	3203601	3203606	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19562	NC_017243	TA	3	6	3203622	3203627	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19563	NC_017243	TA	3	6	3203761	3203766	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19564	NC_017243	T	6	6	3203770	3203775	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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19572	NC_017243	TA	3	6	3205423	3205428	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19573	NC_017243	A	6	6	3205451	3205456	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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19575	NC_017243	TAT	2	6	3205495	3205500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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19594	NC_017243	TAA	2	6	3212064	3212069	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19595	NC_017243	ATA	2	6	3212096	3212101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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19597	NC_017243	TAT	2	6	3212131	3212136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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19601	NC_017243	A	7	7	3212172	3212178	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19602	NC_017243	AT	3	6	3212185	3212190	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19603	NC_017243	A	6	6	3212192	3212197	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19604	NC_017243	CTTT	2	8	3214400	3214407	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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19609	NC_017243	AT	3	6	3214504	3214509	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19610	NC_017243	AT	3	6	3214536	3214541	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19611	NC_017243	A	7	7	3214585	3214591	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19612	NC_017243	A	6	6	3214675	3214680	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19613	NC_017243	TAAA	2	8	3214710	3214717	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
19614	NC_017243	T	6	6	3214730	3214735	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19615	NC_017243	GCA	2	6	3214749	3214754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19616	NC_017243	AT	3	6	3214775	3214780	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19617	NC_017243	ATATT	2	10	3214808	3214817	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
19618	NC_017243	AAT	3	9	3214821	3214829	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19619	NC_017243	ACC	2	6	3214835	3214840	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
19620	NC_017243	AGGG	2	8	3214845	3214852	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
19621	NC_017243	TAAT	2	8	3214859	3214866	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19622	NC_017243	AAT	2	6	3214887	3214892	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19623	NC_017243	AAATAT	2	12	3214900	3214911	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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19625	NC_017243	AAT	2	6	3215082	3215087	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19626	NC_017243	AT	3	6	3215086	3215091	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19627	NC_017243	T	7	7	3215132	3215138	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19628	NC_017243	AGCG	2	8	3215249	3215256	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
19629	NC_017243	AAT	2	6	3215273	3215278	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19630	NC_017243	A	6	6	3215279	3215284	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19631	NC_017243	TAA	2	6	3215285	3215290	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19632	NC_017243	A	7	7	3215306	3215312	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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