MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Brachyspira intermedia PWS/A chromosome

Total Repeats: 20300

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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15502	NC_017243	ATT	2	6	2629450	2629455	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15503	NC_017243	TATAA	2	10	2629457	2629466	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
15504	NC_017243	ATT	2	6	2629489	2629494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15505	NC_017243	TAAAT	2	10	2629500	2629509	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
15506	NC_017243	ATA	2	6	2629515	2629520	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15507	NC_017243	A	6	6	2629532	2629537	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15508	NC_017243	ATA	2	6	2631098	2631103	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15509	NC_017243	ATA	2	6	2631109	2631114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15510	NC_017243	TA	3	6	2631164	2631169	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15511	NC_017243	TAT	2	6	2631172	2631177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15512	NC_017243	TAA	2	6	2631197	2631202	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15513	NC_017243	ATA	2	6	2631203	2631208	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15514	NC_017243	A	6	6	2631222	2631227	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15515	NC_017243	T	6	6	2632494	2632499	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15516	NC_017243	ATA	2	6	2635180	2635185	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15517	NC_017243	TA	3	6	2635245	2635250	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15518	NC_017243	TCG	2	6	2635278	2635283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15519	NC_017243	T	7	7	2635299	2635305	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15520	NC_017243	TAATTA	2	12	2635315	2635326	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15521	NC_017243	ATA	2	6	2635327	2635332	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15522	NC_017243	TAAT	2	8	2635391	2635398	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15523	NC_017243	ATA	2	6	2635416	2635421	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15527	NC_017243	T	7	7	2635521	2635527	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15528	NC_017243	T	6	6	2635934	2635939	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15529	NC_017243	AT	4	8	2635954	2635961	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15530	NC_017243	T	6	6	2635963	2635968	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15533	NC_017243	T	6	6	2636009	2636014	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15539	NC_017243	AAT	2	6	2636556	2636561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15540	NC_017243	AT	3	6	2636560	2636565	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15541	NC_017243	TA	3	6	2636568	2636573	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15542	NC_017243	AAAT	2	8	2636589	2636596	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15543	NC_017243	TTA	2	6	2636603	2636608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15545	NC_017243	ATTT	2	8	2636624	2636631	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15546	NC_017243	TTA	2	6	2636642	2636647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15548	NC_017243	TAA	2	6	2637098	2637103	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15549	NC_017243	AT	4	8	2637106	2637113	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15550	NC_017243	T	6	6	2637115	2637120	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15551	NC_017243	A	6	6	2637142	2637147	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15552	NC_017243	A	6	6	2637149	2637154	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15555	NC_017243	ATAA	2	8	2637614	2637621	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15556	NC_017243	AT	3	6	2637622	2637627	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15557	NC_017243	A	6	6	2637666	2637671	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15558	NC_017243	TA	3	6	2637672	2637677	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15559	NC_017243	AATAA	2	10	2637678	2637687	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
15560	NC_017243	TAT	3	9	2637704	2637712	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15562	NC_017243	ATTATA	2	12	2638138	2638149	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15563	NC_017243	T	6	6	2638150	2638155	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15564	NC_017243	TAA	2	6	2638203	2638208	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15565	NC_017243	TTA	2	6	2641213	2641218	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15566	NC_017243	TAT	2	6	2641228	2641233	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15567	NC_017243	CGC	2	6	2641246	2641251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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15605	NC_017243	TAT	2	6	2647434	2647439	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15609	NC_017243	ATTT	2	8	2648297	2648304	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15611	NC_017243	AAAT	2	8	2648314	2648321	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15612	NC_017243	A	7	7	2648342	2648348	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15613	NC_017243	ATT	2	6	2648396	2648401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15614	NC_017243	ATA	2	6	2648402	2648407	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15615	NC_017243	TA	3	6	2648406	2648411	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15616	NC_017243	TA	3	6	2648415	2648420	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15617	NC_017243	A	6	6	2648424	2648429	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15626	NC_017243	AT	4	8	2649484	2649491	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15627	NC_017243	T	6	6	2649498	2649503	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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