MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Brachyspira intermedia PWS/A chromosome

Total Repeats: 20300

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_017243	ATT	3	9	2242799	2242807	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13002	NC_017243	T	6	6	2242861	2242866	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13003	NC_017243	TAA	2	6	2242873	2242878	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13004	NC_017243	TTAT	2	8	2242879	2242886	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13005	NC_017243	AT	3	6	2242905	2242910	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13006	NC_017243	TAT	2	6	2242960	2242965	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13007	NC_017243	AT	3	6	2242964	2242969	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13008	NC_017243	TAG	2	6	2242989	2242994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13009	NC_017243	ATA	2	6	2243031	2243036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13010	NC_017243	AT	3	6	2244727	2244732	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13011	NC_017243	A	6	6	2244740	2244745	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13012	NC_017243	TAA	2	6	2244764	2244769	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13013	NC_017243	TA	4	8	2244772	2244779	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13014	NC_017243	A	6	6	2244799	2244804	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13015	NC_017243	CTT	2	6	2244842	2244847	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13016	NC_017243	AT	3	6	2244889	2244894	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13017	NC_017243	A	6	6	2244896	2244901	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13018	NC_017243	TA	3	6	2244913	2244918	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13019	NC_017243	AAATA	2	10	2244919	2244928	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
13020	NC_017243	ATTT	2	8	2244944	2244951	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13021	NC_017243	TA	3	6	2244954	2244959	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13022	NC_017243	ATTAC	2	10	2244960	2244969	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
13023	NC_017243	TTAA	2	8	2244981	2244988	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13025	NC_017243	T	6	6	2244995	2245000	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13029	NC_017243	T	7	7	2245075	2245081	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13032	NC_017243	TAA	2	6	2247730	2247735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13033	NC_017243	ATA	2	6	2248541	2248546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13036	NC_017243	AT	3	6	2251679	2251684	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13037	NC_017243	T	7	7	2251706	2251712	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13039	NC_017243	T	7	7	2251790	2251796	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13040	NC_017243	CTATT	2	10	2251807	2251816	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
13041	NC_017243	T	6	6	2251840	2251845	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13042	NC_017243	GTT	2	6	2251859	2251864	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13043	NC_017243	T	7	7	2251885	2251891	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13044	NC_017243	T	6	6	2251922	2251927	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13045	NC_017243	TAT	2	6	2254307	2254312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13047	NC_017243	ATTT	2	8	2254377	2254384	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13048	NC_017243	A	6	6	2254389	2254394	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13049	NC_017243	TA	3	6	2255442	2255447	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13050	NC_017243	ATA	2	6	2255472	2255477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13051	NC_017243	TTA	2	6	2255484	2255489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13055	NC_017243	TTA	2	6	2258761	2258766	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13056	NC_017243	AT	3	6	2258777	2258782	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13057	NC_017243	A	6	6	2258799	2258804	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13058	NC_017243	AT	3	6	2258823	2258828	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13059	NC_017243	TA	4	8	2258840	2258847	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13060	NC_017243	TAT	2	6	2258859	2258864	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13061	NC_017243	TACT	2	8	2258867	2258874	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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13064	NC_017243	ATG	2	6	2258946	2258951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13065	NC_017243	TATTAA	2	12	2259003	2259014	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13066	NC_017243	ATA	2	6	2259019	2259024	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13067	NC_017243	TTA	2	6	2259028	2259033	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13068	NC_017243	ATA	2	6	2259040	2259045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13069	NC_017243	AAT	2	6	2259046	2259051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13072	NC_017243	T	6	6	2259106	2259111	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13073	NC_017243	TA	3	6	2259744	2259749	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13074	NC_017243	ACAAT	2	10	2259771	2259780	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
13075	NC_017243	ATTT	2	8	2259801	2259808	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13076	NC_017243	AT	3	6	2259813	2259818	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13077	NC_017243	TTA	2	6	2259856	2259861	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13083	NC_017243	AAT	2	6	2260461	2260466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13093	NC_017243	TA	3	6	2260686	2260691	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13101	NC_017243	GTTTA	2	10	2264404	2264413	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
13102	NC_017243	TAAT	2	8	2264440	2264447	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13103	NC_017243	AT	3	6	2264446	2264451	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13122	NC_017243	T	6	6	2265802	2265807	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13123	NC_017243	ATATT	2	10	2265814	2265823	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
13124	NC_017243	TTA	2	6	2265826	2265831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13127	NC_017243	AATT	2	8	2267108	2267115	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13130	NC_017243	TA	3	6	2267149	2267154	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13131	NC_017243	TTA	2	6	2267156	2267161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13133	NC_017243	GCCC	2	8	2267215	2267222	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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13404	NC_017243	TAAA	2	8	2312010	2312017	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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13406	NC_017243	AATTTA	2	12	2312078	2312089	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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