MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Brachyspira intermedia PWS/A chromosome

Total Repeats: 20300

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_017243	ATA	2	6	2137014	2137019	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12502	NC_017243	TAA	2	6	2137029	2137034	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12503	NC_017243	AT	3	6	2137054	2137059	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12504	NC_017243	TAA	2	6	2137176	2137181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12505	NC_017243	TAT	2	6	2137209	2137214	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12506	NC_017243	ATG	2	6	2137262	2137267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12507	NC_017243	ATT	2	6	2137372	2137377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12508	NC_017243	T	6	6	2137403	2137408	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12509	NC_017243	T	6	6	2137414	2137419	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12510	NC_017243	A	6	6	2137427	2137432	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12511	NC_017243	TA	3	6	2137485	2137490	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12512	NC_017243	AAC	2	6	2137495	2137500	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12513	NC_017243	T	6	6	2137521	2137526	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12514	NC_017243	CTT	2	6	2137565	2137570	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12515	NC_017243	TTG	2	6	2137571	2137576	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12516	NC_017243	AAG	2	6	2137582	2137587	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12517	NC_017243	TAA	2	6	2137614	2137619	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12518	NC_017243	TACA	2	8	2137627	2137634	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
12519	NC_017243	TAT	2	6	2137647	2137652	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12520	NC_017243	GCG	2	6	2137693	2137698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12521	NC_017243	A	7	7	2137713	2137719	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12522	NC_017243	AAAT	2	8	2137751	2137758	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12523	NC_017243	ATA	2	6	2137785	2137790	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12524	NC_017243	A	6	6	2137813	2137818	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12525	NC_017243	TAT	2	6	2137826	2137831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12526	NC_017243	TCT	2	6	2138613	2138618	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12527	NC_017243	TTA	2	6	2139457	2139462	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12528	NC_017243	TA	3	6	2139461	2139466	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12529	NC_017243	TAA	2	6	2139603	2139608	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12530	NC_017243	TATAT	2	10	2139611	2139620	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
12531	NC_017243	TAT	2	6	2139636	2139641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12532	NC_017243	AAC	2	6	2139724	2139729	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12533	NC_017243	A	7	7	2139730	2139736	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12536	NC_017243	AAT	2	6	2141173	2141178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12537	NC_017243	AAT	2	6	2141202	2141207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12538	NC_017243	TAAAA	2	10	2141224	2141233	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
12539	NC_017243	TTA	2	6	2141280	2141285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12540	NC_017243	T	6	6	2141317	2141322	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12541	NC_017243	AT	3	6	2141323	2141328	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12542	NC_017243	TA	3	6	2141329	2141334	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12543	NC_017243	AAAAT	2	10	2141337	2141346	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
12544	NC_017243	T	6	6	2141370	2141375	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12545	NC_017243	TAT	2	6	2141382	2141387	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12546	NC_017243	TA	3	6	2142344	2142349	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12547	NC_017243	A	6	6	2142351	2142356	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12548	NC_017243	TAA	2	6	2142380	2142385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12549	NC_017243	T	6	6	2142386	2142391	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12550	NC_017243	TCC	2	6	2143749	2143754	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12551	NC_017243	ATA	2	6	2143755	2143760	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12552	NC_017243	TAA	3	9	2146034	2146042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12553	NC_017243	TAC	2	6	2146553	2146558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12554	NC_017243	CTAT	2	8	2146563	2146570	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12555	NC_017243	ATT	3	9	2146589	2146597	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12556	NC_017243	A	6	6	2146679	2146684	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12557	NC_017243	ATTC	2	8	2146692	2146699	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12558	NC_017243	TTA	2	6	2146725	2146730	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12559	NC_017243	TCA	2	6	2148268	2148273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12560	NC_017243	AAT	2	6	2148297	2148302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12561	NC_017243	TTAT	2	8	2148365	2148372	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12562	NC_017243	ACA	4	12	2149385	2149396	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12563	NC_017243	AT	3	6	2149405	2149410	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12564	NC_017243	T	6	6	2149410	2149415	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12565	NC_017243	AT	3	6	2149417	2149422	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12566	NC_017243	TAA	2	6	2149452	2149457	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12567	NC_017243	A	12	12	2149456	2149467	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12568	NC_017243	AT	3	6	2149477	2149482	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12569	NC_017243	T	8	8	2149482	2149489	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12570	NC_017243	A	6	6	2149492	2149497	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12571	NC_017243	T	8	8	2149520	2149527	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12572	NC_017243	AT	4	8	2149542	2149549	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12573	NC_017243	AT	3	6	2149583	2149588	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12574	NC_017243	TATTAA	2	12	2149608	2149619	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12575	NC_017243	CTT	2	6	2150786	2150791	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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12578	NC_017243	TAA	2	6	2150912	2150917	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12579	NC_017243	ATATA	2	10	2150928	2150937	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
12580	NC_017243	ATT	2	6	2150939	2150944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12581	NC_017243	GTT	2	6	2151050	2151055	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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12583	NC_017243	TCA	2	6	2151070	2151075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12584	NC_017243	ATAAA	2	10	2152955	2152964	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12586	NC_017243	TA	3	6	2152990	2152995	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12587	NC_017243	A	7	7	2153015	2153021	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12589	NC_017243	TTAT	2	8	2153059	2153066	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12591	NC_017243	TTTA	2	8	2155965	2155972	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12592	NC_017243	TAT	2	6	2155987	2155992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12594	NC_017243	TTAA	2	8	2156016	2156023	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12595	NC_017243	T	6	6	2156027	2156032	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12596	NC_017243	CTA	2	6	2156034	2156039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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12598	NC_017243	CAATA	2	10	2157120	2157129	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
12599	NC_017243	A	7	7	2157129	2157135	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12600	NC_017243	TAATA	2	10	2157136	2157145	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
12601	NC_017243	AAAT	2	8	2158009	2158016	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12602	NC_017243	ATT	2	6	2158036	2158041	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12603	NC_017243	TA	3	6	2158043	2158048	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12604	NC_017243	A	7	7	2158051	2158057	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12605	NC_017243	CTA	2	6	2159825	2159830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12606	NC_017243	TTA	2	6	2159831	2159836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12607	NC_017243	TA	3	6	2159850	2159855	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12608	NC_017243	AT	3	6	2159867	2159872	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12609	NC_017243	T	6	6	2159875	2159880	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12610	NC_017243	T	6	6	2159897	2159902	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12611	NC_017243	TTA	2	6	2159920	2159925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12612	NC_017243	TAT	2	6	2159926	2159931	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12613	NC_017243	AT	3	6	2159969	2159974	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12614	NC_017243	ATTA	2	8	2159976	2159983	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12615	NC_017243	TATT	2	8	2160003	2160010	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12616	NC_017243	ATT	2	6	2162272	2162277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12617	NC_017243	T	7	7	2162276	2162282	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12619	NC_017243	ATTAT	2	10	2162295	2162304	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
12620	NC_017243	A	7	7	2162313	2162319	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12621	NC_017243	AATG	2	8	2162337	2162344	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
12622	NC_017243	ATA	2	6	2162352	2162357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12623	NC_017243	AAT	2	6	2162448	2162453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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12625	NC_017243	TTG	2	6	2162472	2162477	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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12627	NC_017243	ATT	4	12	2162519	2162530	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12628	NC_017243	TA	3	6	2162542	2162547	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12629	NC_017243	TAA	3	9	2162554	2162562	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12630	NC_017243	ACTT	2	8	2162567	2162574	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12631	NC_017243	CAT	2	6	2163764	2163769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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