MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid lp32-10

Total Repeats: 318

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017240	AG	3	6	225	230	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017240	TGT	2	6	257	262	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017240	TAA	2	6	476	481	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017240	A	6	6	480	485	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017240	ATTA	2	8	487	494	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017240	TTA	3	9	504	512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017240	ATT	2	6	518	523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017240	TAA	2	6	525	530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017240	ATA	2	6	547	552	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017240	TTTA	2	8	593	600	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017240	A	7	7	617	623	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017240	A	6	6	626	631	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017240	TAT	2	6	641	646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017240	A	7	7	667	673	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017240	TA	3	6	686	691	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017240	A	6	6	703	708	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017240	AAT	2	6	723	728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017240	ATT	2	6	1534	1539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017240	AAAT	2	8	1540	1547	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017240	AAAAT	2	10	1728	1737	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017240	A	7	7	1770	1776	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017240	ATG	2	6	1787	1792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017240	TTAT	2	8	1848	1855	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017240	A	6	6	1870	1875	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017240	TA	3	6	1929	1934	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017240	AT	3	6	1938	1943	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017240	TTAATT	2	12	2181	2192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017240	T	7	7	2191	2197	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017240	T	7	7	2210	2216	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017240	T	7	7	2245	2251	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017240	AT	3	6	2252	2257	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017240	AT	3	6	2286	2291	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017240	TTTCA	2	10	2306	2315	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
34	NC_017240	T	6	6	2344	2349	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017240	TTA	2	6	2372	2377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017240	TAT	2	6	2407	2412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017240	A	6	6	2424	2429	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017240	AATTA	2	10	2438	2447	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017240	A	7	7	2447	2453	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017240	TAAA	2	8	2454	2461	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017240	AAT	2	6	2490	2495	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017240	AGC	2	6	2505	2510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_017240	AT	3	6	2518	2523	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017240	TAAAA	2	10	2543	2552	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017240	A	7	7	2600	2606	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017240	AGA	2	6	2613	2618	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017240	AGAA	2	8	2625	2632	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017240	AAG	2	6	2636	2641	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017240	AGA	2	6	2646	2651	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017240	A	6	6	2677	2682	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017240	AAT	2	6	2688	2693	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017240	A	7	7	2694	2700	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017240	A	6	6	2712	2717	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017240	TCA	2	6	2998	3003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_017240	A	7	7	3003	3009	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017240	AGA	2	6	3018	3023	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017240	AT	3	6	3029	3034	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017240	T	9	9	3043	3051	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017240	A	7	7	3063	3069	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017240	AGA	2	6	3074	3079	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017240	GAA	2	6	3096	3101	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017240	T	6	6	3670	3675	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017240	T	8	8	3712	3719	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017240	TTTA	2	8	3736	3743	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017240	ATA	2	6	3763	3768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017240	A	7	7	3778	3784	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017240	ACT	2	6	4258	4263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_017240	AAATAA	2	12	4317	4328	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017240	TAA	3	9	4357	4365	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017240	TAT	2	6	4372	4377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017240	AAT	2	6	4395	4400	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017240	TA	4	8	4416	4423	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017240	TGATAA	2	12	4425	4436	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017240	A	6	6	4475	4480	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017240	TAAA	2	8	4535	4542	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017240	A	6	6	4540	4545	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017240	TAT	2	6	4554	4559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017240	TAA	2	6	4562	4567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017240	TAA	2	6	4575	4580	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017240	A	6	6	4599	4604	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017240	AT	3	6	4613	4618	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017240	TTAA	2	8	4638	4645	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017240	ATTT	2	8	5047	5054	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017240	AT	3	6	5086	5091	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017240	T	6	6	5708	5713	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017240	A	7	7	5735	5741	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017240	ATT	2	6	5765	5770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017240	TAG	2	6	5904	5909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017240	TAA	2	6	5916	5921	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017240	A	7	7	5940	5946	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017240	GGGT	2	8	6069	6076	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017240	AAATA	2	10	6108	6117	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017240	ATTACT	2	12	6121	6132	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_017240	CAAAT	2	10	6134	6143	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
95	NC_017240	TAA	2	6	6273	6278	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017240	ATT	2	6	6313	6318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017240	TAAA	2	8	6327	6334	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017240	T	7	7	6388	6394	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017240	ATTT	2	8	6397	6404	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017240	A	6	6	6433	6438	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017240	AAG	2	6	6482	6487	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017240	GTT	2	6	6492	6497	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017240	TCTT	2	8	6511	6518	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_017240	TA	3	6	6519	6524	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017240	T	7	7	7061	7067	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017240	AT	3	6	7074	7079	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017240	TAA	2	6	7091	7096	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017240	TTA	2	6	7100	7105	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017240	TA	3	6	7104	7109	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017240	TA	3	6	7174	7179	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017240	ATAA	2	8	7213	7220	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017240	TAA	2	6	7224	7229	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017240	AT	3	6	7239	7244	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017240	T	7	7	7258	7264	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017240	TA	3	6	7292	7297	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017240	TAA	2	6	10536	10541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017240	TTAATT	2	12	10552	10563	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017240	T	7	7	10572	10578	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017240	T	6	6	10596	10601	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017240	TAAA	2	8	10605	10612	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017240	TTAT	2	8	10625	10632	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017240	ATT	2	6	10639	10644	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017240	AT	3	6	10654	10659	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017240	T	6	6	10677	10682	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017240	GT	3	6	10683	10688	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017240	TATT	2	8	10692	10699	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017240	T	8	8	10698	10705	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017240	AATT	2	8	10742	10749	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017240	TATAC	2	10	10752	10761	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
130	NC_017240	ATT	2	6	10811	10816	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017240	TTA	2	6	10844	10849	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017240	A	7	7	10851	10857	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017240	TTACA	2	10	10903	10912	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
134	NC_017240	T	6	6	10913	10918	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017240	TGTAG	2	10	10975	10984	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017240	TAAAAT	2	12	10992	11003	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017240	ATTT	2	8	11006	11013	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017240	A	7	7	11043	11049	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017240	TAA	3	9	11051	11059	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017240	T	7	7	11070	11076	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017240	TAA	2	6	11119	11124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017240	TTA	2	6	11131	11136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017240	CTAG	2	8	11144	11151	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
144	NC_017240	T	6	6	13229	13234	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017240	AT	3	6	13244	13249	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017240	GAA	2	6	13296	13301	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017240	CTA	2	6	13346	13351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_017240	ACTA	2	8	13851	13858	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
149	NC_017240	GAA	2	6	13930	13935	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017240	AT	3	6	13939	13944	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_017240	AAT	2	6	14526	14531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_017240	AT	3	6	14539	14544	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_017240	AAC	2	6	14571	14576	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
154	NC_017240	TTA	2	6	14625	14630	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_017240	A	7	7	14653	14659	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_017240	AGA	2	6	14831	14836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
157	NC_017240	A	8	8	14866	14873	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_017240	ATG	2	6	14935	14940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
159	NC_017240	TAAAA	2	10	14945	14954	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_017240	GC	3	6	14956	14961	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
161	NC_017240	A	7	7	15016	15022	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_017240	CAAA	2	8	15084	15091	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
163	NC_017240	TAA	2	6	15108	15113	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
164	NC_017240	ATA	2	6	15721	15726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
165	NC_017240	AACC	2	8	15767	15774	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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169	NC_017240	T	6	6	15985	15990	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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172	NC_017240	A	7	7	16261	16267	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
173	NC_017240	A	7	7	16275	16281	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
174	NC_017240	TTACA	2	10	16328	16337	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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176	NC_017240	AAC	2	6	16385	16390	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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181	NC_017240	TAA	2	6	16476	16481	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
182	NC_017240	T	7	7	16495	16501	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
183	NC_017240	ATTA	2	8	16543	16550	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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186	NC_017240	AT	3	6	19844	19849	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
187	NC_017240	AGA	2	6	19913	19918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
188	NC_017240	AGAT	2	8	19931	19938	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
189	NC_017240	AGAT	2	8	19952	19959	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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193	NC_017240	ATT	2	6	20136	20141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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195	NC_017240	TTATT	2	10	20217	20226	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
196	NC_017240	A	6	6	20229	20234	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
197	NC_017240	TTA	2	6	20266	20271	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
198	NC_017240	AAG	2	6	20281	20286	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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202	NC_017240	ATA	2	6	20561	20566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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301	NC_017240	ATT	2	6	27555	27560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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303	NC_017240	A	7	7	27571	27577	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
304	NC_017240	AGG	2	6	27877	27882	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
305	NC_017240	TTC	2	6	27895	27900	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
306	NC_017240	A	7	7	27903	27909	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
307	NC_017240	TATAA	2	10	28582	28591	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
308	NC_017240	TTA	2	6	28592	28597	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
309	NC_017240	AG	3	6	28598	28603	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
310	NC_017240	ATTA	2	8	29260	29267	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
311	NC_017240	ATTA	3	12	29273	29284	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
312	NC_017240	TA	3	6	29296	29301	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
313	NC_017240	A	6	6	29410	29415	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
314	NC_017240	TAA	2	6	29429	29434	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
315	NC_017240	ATA	2	6	29466	29471	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
316	NC_017240	TTGA	2	8	29484	29491	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
317	NC_017240	TA	3	6	30048	30053	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
318	NC_017240	T	6	6	30088	30093	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.