MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid lp38

Total Repeats: 601

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017237	TA	3	6	273	278	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017237	CATA	2	8	293	300	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_017237	ATA	2	6	327	332	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017237	ATTGA	2	10	363	372	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017237	TA	3	6	400	405	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017237	AAAT	2	8	443	450	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017237	ATAG	2	8	462	469	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017237	CTAA	2	8	488	495	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_017237	AATATA	2	12	500	511	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017237	ATT	2	6	524	529	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017237	AAAT	2	8	546	553	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017237	ATTT	2	8	601	608	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017237	A	6	6	623	628	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017237	TAAA	2	8	645	652	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017237	AT	3	6	662	667	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017237	TATT	2	8	668	675	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017237	T	9	9	1397	1405	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017237	TAT	2	6	1416	1421	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017237	TAAA	2	8	1426	1433	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017237	ATC	2	6	1492	1497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_017237	AGCTT	2	10	1522	1531	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
22	NC_017237	CTT	2	6	1542	1547	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_017237	T	6	6	1558	1563	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017237	AT	3	6	1564	1569	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017237	TTCT	2	8	1659	1666	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_017237	A	6	6	1683	1688	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017237	TTA	2	6	1816	1821	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017237	ATT	2	6	1846	1851	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017237	A	6	6	1852	1857	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017237	TAA	2	6	1858	1863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017237	AATA	2	8	1888	1895	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017237	TAC	2	6	1900	1905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_017237	TAT	2	6	1961	1966	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017237	AAAT	2	8	1978	1985	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017237	AAT	2	6	2016	2021	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017237	ATC	2	6	2037	2042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_017237	TAA	2	6	2049	2054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017237	ATA	2	6	2085	2090	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017237	TAAA	2	8	2097	2104	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017237	A	6	6	2102	2107	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017237	GCT	2	6	2108	2113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_017237	T	6	6	2143	2148	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017237	A	6	6	2149	2154	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017237	AAC	2	6	2185	2190	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_017237	TAC	2	6	2265	2270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_017237	T	6	6	2271	2276	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017237	ATA	2	6	2277	2282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017237	A	6	6	3953	3958	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017237	AT	5	10	3990	3999	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017237	TAT	3	9	3997	4005	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017237	AT	3	6	4009	4014	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017237	TTA	2	6	4027	4032	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017237	TACA	2	8	4054	4061	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_017237	T	6	6	4074	4079	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017237	AGA	2	6	4190	4195	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017237	ATA	2	6	4223	4228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017237	A	6	6	4280	4285	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017237	TAA	2	6	4341	4346	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017237	AACA	2	8	4361	4368	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_017237	ATG	2	6	4398	4403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017237	TAA	2	6	4437	4442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017237	TTA	2	6	4444	4449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017237	AGA	2	6	4489	4494	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017237	AATCTC	2	12	4498	4509	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_017237	T	6	6	5167	5172	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017237	TAA	2	6	5187	5192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017237	AAAT	2	8	5226	5233	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017237	TAA	2	6	5248	5253	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017237	TAT	2	6	5254	5259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017237	T	7	7	5259	5265	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017237	ATA	2	6	5313	5318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017237	TTA	2	6	5324	5329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017237	AAT	2	6	5345	5350	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017237	AAAAT	2	10	5354	5363	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017237	T	8	8	5379	5386	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017237	AAT	2	6	5463	5468	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017237	TAA	2	6	5537	5542	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017237	AAT	2	6	5544	5549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017237	AATA	2	8	5635	5642	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017237	ATT	2	6	5646	5651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017237	TGT	2	6	5692	5697	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017237	AAT	2	6	5705	5710	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017237	AAAAT	2	10	5750	5759	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017237	AGA	2	6	5780	5785	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017237	AAAT	2	8	5790	5797	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017237	AT	3	6	5813	5818	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017237	ATT	2	6	5835	5840	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017237	A	6	6	5841	5846	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017237	TA	3	6	5847	5852	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017237	A	7	7	5858	5864	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017237	GAA	2	6	5865	5870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017237	A	6	6	5900	5905	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017237	TTA	2	6	5907	5912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017237	AAT	2	6	5956	5961	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017237	TTTA	2	8	6014	6021	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017237	AT	3	6	6050	6055	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017237	AGT	2	6	6082	6087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017237	TAC	2	6	6147	6152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_017237	TATT	2	8	6234	6241	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017237	T	8	8	6248	6255	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017237	ATA	2	6	6277	6282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017237	ATTTTA	2	12	6306	6317	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017237	T	6	6	6320	6325	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017237	GAAA	2	8	6379	6386	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017237	TAAAA	2	10	6421	6430	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017237	AAT	2	6	6455	6460	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017237	TAA	2	6	6555	6560	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017237	T	7	7	6561	6567	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017237	ATTT	2	8	6612	6619	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017237	TAA	2	6	6647	6652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017237	AGC	2	6	6825	6830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_017237	ACA	2	6	6831	6836	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_017237	TC	3	6	6851	6856	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_017237	AATT	2	8	6857	6864	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017237	TAA	2	6	6871	6876	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017237	GTA	2	6	6892	6897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017237	TAA	2	6	6917	6922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017237	ATT	2	6	6926	6931	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017237	TAG	2	6	6932	6937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017237	ATA	2	6	6945	6950	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017237	T	6	6	7026	7031	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017237	TA	3	6	7451	7456	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017237	AAAG	2	8	8274	8281	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017237	AT	3	6	8286	8291	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017237	T	6	6	8293	8298	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017237	TTGG	2	8	8378	8385	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017237	AAT	2	6	8429	8434	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017237	ATT	2	6	8454	8459	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017237	TAT	2	6	8465	8470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017237	ATTTAA	2	12	8511	8522	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017237	GTA	2	6	8532	8537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017237	TAA	2	6	8556	8561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017237	TAT	2	6	8566	8571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017237	ATT	2	6	8584	8589	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017237	AGG	2	6	8607	8612	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017237	AAT	2	6	9715	9720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017237	TAT	2	6	9725	9730	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017237	ATTT	2	8	9761	9768	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017237	TTA	2	6	9788	9793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017237	ATA	2	6	9852	9857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017237	TAA	2	6	9902	9907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017237	TAAATT	2	12	9934	9945	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017237	T	6	6	9984	9989	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017237	A	6	6	10018	10023	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017237	ATT	2	6	10026	10031	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017237	GT	3	6	10037	10042	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017237	CAAA	2	8	10049	10056	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
148	NC_017237	A	6	6	10089	10094	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017237	AT	4	8	10164	10171	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017237	C	6	6	10189	10194	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
151	NC_017237	AAT	2	6	10225	10230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_017237	CTA	2	6	10241	10246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
153	NC_017237	TAG	2	6	10261	10266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
154	NC_017237	ATTG	2	8	10295	10302	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
155	NC_017237	ATG	2	6	10310	10315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
156	NC_017237	A	7	7	10372	10378	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_017237	T	7	7	10398	10404	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_017237	A	7	7	10435	10441	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_017237	TG	3	6	10445	10450	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
160	NC_017237	TAT	2	6	10471	10476	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_017237	GATTT	2	10	10499	10508	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
162	NC_017237	T	7	7	10534	10540	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_017237	A	6	6	10542	10547	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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171	NC_017237	TA	3	6	11147	11152	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
172	NC_017237	TCTA	2	8	11153	11160	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
173	NC_017237	ATTTT	2	10	11206	11215	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
174	NC_017237	TAT	2	6	11236	11241	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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191	NC_017237	T	6	6	11888	11893	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
192	NC_017237	AAAT	2	8	11894	11901	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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