MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid cp32-7

Total Repeats: 102

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017231	TAT	2	6	30	35	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017231	AC	3	6	36	41	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_017231	TAA	2	6	46	51	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017231	GAA	2	6	1317	1322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017231	AAG	2	6	1324	1329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017231	AGG	2	6	1348	1353	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017231	CAG	2	6	1356	1361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_017231	AATC	2	8	1406	1413	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_017231	TAAA	2	8	1428	1435	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017231	T	6	6	10038	10043	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017231	TA	3	6	10064	10069	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017231	TA	3	6	10073	10078	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017231	A	6	6	10084	10089	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017231	T	6	6	10256	10261	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017231	GGAAAT	2	12	10268	10279	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017231	A	6	6	10289	10294	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017231	GTT	2	6	11339	11344	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017231	CTAA	2	8	11385	11392	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_017231	ATA	2	6	11401	11406	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017231	AAT	2	6	11957	11962	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017231	TCT	2	6	11994	11999	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_017231	AAT	3	9	12015	12023	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017231	TAG	2	6	12039	12044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017231	AAT	2	6	12046	12051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017231	A	6	6	12071	12076	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017231	GGAGA	2	10	12077	12086	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017231	TTGT	2	8	14043	14050	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017231	CCT	2	6	14063	14068	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_017231	TA	3	6	14079	14084	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017231	AATA	2	8	14085	14092	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017231	TA	3	6	14091	14096	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017231	T	6	6	14118	14123	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017231	T	6	6	14131	14136	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017231	A	7	7	14139	14145	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017231	TTG	2	6	14197	14202	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017231	T	8	8	14203	14210	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017231	AAC	2	6	14253	14258	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_017231	TGTAG	2	10	14268	14277	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017231	TAAAAT	2	12	14285	14296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017231	ATT	2	6	14299	14304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017231	TA	3	6	14315	14320	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017231	TAAT	2	8	14330	14337	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017231	TAA	2	6	14343	14348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017231	T	7	7	14362	14368	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017231	ATTAT	2	10	14402	14411	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017231	TAT	3	9	14416	14424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017231	AGG	2	6	14436	14441	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017231	TTA	2	6	16866	16871	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017231	TAAA	2	8	16875	16882	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017231	AAT	2	6	17956	17961	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017231	T	6	6	17973	17978	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017231	TAT	2	6	17982	17987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017231	TGA	2	6	17998	18003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017231	A	6	6	18012	18017	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017231	ATTTT	2	10	18022	18031	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017231	T	7	7	18091	18097	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017231	A	6	6	18157	18162	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017231	T	7	7	18166	18172	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017231	CTTTA	2	10	18191	18200	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
60	NC_017231	T	6	6	18206	18211	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017231	TAA	2	6	18224	18229	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017231	T	9	9	18232	18240	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017231	TAATA	2	10	18281	18290	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017231	ATA	2	6	18299	18304	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017231	AT	3	6	18320	18325	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017231	TGG	2	6	18344	18349	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017231	T	6	6	18392	18397	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017231	A	6	6	18423	18428	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017231	TA	4	8	18443	18450	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017231	AT	3	6	18454	18459	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017231	A	8	8	18463	18470	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017231	TAT	2	6	18476	18481	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017231	T	7	7	18545	18551	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017231	A	6	6	18554	18559	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017231	A	6	6	18567	18572	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017231	TA	3	6	18594	18599	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017231	TTTA	2	8	18600	18607	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017231	TA	3	6	18606	18611	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017231	AGG	2	6	18622	18627	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017231	ACAA	2	8	18640	18647	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_017231	A	6	6	19989	19994	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017231	A	7	7	19997	20003	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017231	AAGTAA	2	12	21270	21281	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017231	AT	3	6	21287	21292	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017231	CAAAAA	2	12	21316	21327	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_017231	AAGA	2	8	21424	21431	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017231	AT	3	6	21448	21453	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017231	AATTT	2	10	21468	21477	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017231	T	6	6	21485	21490	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017231	GA	3	6	21523	21528	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017231	A	7	7	21611	21617	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017231	AAT	2	6	22483	22488	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017231	ATA	2	6	22530	22535	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017231	AGG	2	6	22541	22546	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017231	AGT	2	6	23233	23238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017231	TAA	2	6	23239	23244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017231	CAA	2	6	23730	23735	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_017231	A	8	8	23734	23741	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017231	GTT	2	6	23749	23754	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017231	A	6	6	23845	23850	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017231	TGC	3	9	23853	23861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_017231	AGT	2	6	23893	23898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.