MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Borrelia afzelii PKo plasmid cp26

Total Repeats: 120

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017229	TA	3	6	1	6	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017229	AT	3	6	762	767	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017229	TTA	2	6	774	779	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017229	AAT	2	6	816	821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017229	AAAC	2	8	830	837	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_017229	A	6	6	2233	2238	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017229	TA	3	6	2262	2267	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017229	TAAA	2	8	2340	2347	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017229	TTATT	2	10	2348	2357	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017229	A	7	7	2425	2431	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017229	TCC	2	6	3767	3772	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_017229	AAC	2	6	3800	3805	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_017229	TTA	3	9	3806	3814	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017229	ATT	2	6	3821	3826	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017229	AT	3	6	3846	3851	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017229	TAAAA	2	10	3853	3862	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017229	TTAT	2	8	3863	3870	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017229	AT	3	6	3876	3881	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017229	TATAA	2	10	3884	3893	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017229	TAT	2	6	3896	3901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017229	AT	3	6	3905	3910	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017229	ATT	2	6	3923	3928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017229	TAAAA	2	10	3935	3944	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017229	ATT	2	6	6454	6459	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017229	AAT	2	6	6461	6466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017229	ATT	2	6	6486	6491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017229	TA	3	6	6508	6513	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017229	ATTT	2	8	7599	7606	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017229	TAA	2	6	7609	7614	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017229	ACTTT	2	10	7616	7625	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
31	NC_017229	T	7	7	7623	7629	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017229	TAT	2	6	7638	7643	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017229	TAA	2	6	9902	9907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017229	A	6	6	10534	10539	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017229	A	6	6	10559	10564	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017229	TA	3	6	10574	10579	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017229	TA	3	6	10586	10591	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017229	TTG	2	6	10615	10620	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017229	AAT	2	6	10630	10635	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017229	ATT	2	6	10675	10680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017229	TTTA	2	8	10701	10708	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017229	ATTT	2	8	10710	10717	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017229	TTTA	2	8	10729	10736	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017229	A	6	6	10748	10753	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017229	A	7	7	11287	11293	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017229	ATA	3	9	11310	11318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017229	T	6	6	11321	11326	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017229	AAT	2	6	11341	11346	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017229	A	6	6	11351	11356	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017229	T	6	6	11380	11385	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017229	A	10	10	11386	11395	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017229	GTT	2	6	11410	11415	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017229	T	7	7	11544	11550	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017229	T	6	6	11579	11584	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017229	ATT	2	6	11586	11591	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017229	TAT	2	6	11592	11597	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017229	T	6	6	11667	11672	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017229	ATT	2	6	11673	11678	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017229	TA	3	6	11699	11704	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017229	TAT	2	6	11724	11729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017229	TAA	2	6	11738	11743	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017229	A	6	6	11760	11765	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017229	AATTA	2	10	11770	11779	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017229	TAAAT	2	10	11787	11796	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017229	ATA	2	6	11874	11879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017229	TGA	2	6	11891	11896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017229	AATA	2	8	11899	11906	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017229	TTTTA	2	10	11913	11922	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017229	AGT	2	6	11925	11930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017229	AAT	2	6	11943	11948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017229	AT	3	6	11970	11975	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017229	AAATTT	2	12	11991	12002	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017229	T	6	6	13825	13830	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017229	TTC	2	6	13833	13838	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_017229	TA	3	6	13879	13884	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017229	ATAA	2	8	16695	16702	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017229	TTA	2	6	16711	16716	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017229	AATTA	2	10	16770	16779	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017229	AAT	2	6	16802	16807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017229	ATT	2	6	16831	16836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017229	ATT	2	6	16857	16862	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017229	T	8	8	16861	16868	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017229	A	6	6	16873	16878	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017229	GAAAA	2	10	16881	16890	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017229	TTG	2	6	16892	16897	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017229	AGG	2	6	16916	16921	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017229	A	6	6	17601	17606	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017229	AAG	2	6	17638	17643	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017229	T	7	7	17660	17666	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017229	A	6	6	17675	17680	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017229	AGT	2	6	17761	17766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017229	ATA	2	6	17855	17860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017229	T	7	7	17932	17938	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017229	T	6	6	17955	17960	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017229	T	8	8	17979	17986	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017229	ATTTT	2	10	19376	19385	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017229	AAAAT	2	10	19392	19401	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017229	CCAT	2	8	19407	19414	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_017229	CTA	2	6	19425	19430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_017229	TGA	2	6	19439	19444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017229	TAAAT	2	10	19445	19454	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017229	AAT	2	6	21357	21362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017229	AT	3	6	21361	21366	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017229	TTATA	2	10	21895	21904	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017229	TAA	2	6	23214	23219	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017229	TAAAG	2	10	23222	23231	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017229	TAAA	2	8	23232	23239	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017229	AT	3	6	23241	23246	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017229	A	6	6	24573	24578	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017229	TTA	2	6	24601	24606	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017229	TAA	3	9	24661	24669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017229	AAATT	2	10	24678	24687	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017229	AAT	2	6	24733	24738	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017229	ATT	2	6	24749	24754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017229	TAT	2	6	24809	24814	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017229	ATTA	2	8	24819	24826	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017229	TAAT	3	12	24830	24841	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017229	TAA	2	6	24849	24854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017229	T	7	7	26496	26502	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017229	A	8	8	26503	26510	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.