MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bifidobacterium animalis subsp. lactis V9 chromosome

Total Repeats: 5072

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_017217	ACA	2	6	1216186	1216191	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3002	NC_017217	GTG	2	6	1216194	1216199	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3003	NC_017217	CAA	2	6	1218562	1218567	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3004	NC_017217	CGT	2	6	1220144	1220149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3005	NC_017217	GCA	2	6	1220176	1220181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3006	NC_017217	GCACA	2	10	1220195	1220204	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
3007	NC_017217	TGG	2	6	1220319	1220324	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3008	NC_017217	AT	3	6	1220389	1220394	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3009	NC_017217	CCAA	2	8	1224706	1224713	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3010	NC_017217	GC	4	8	1226616	1226623	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3011	NC_017217	GAA	2	6	1227626	1227631	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3012	NC_017217	TGG	2	6	1228316	1228321	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3013	NC_017217	CAC	2	6	1228352	1228357	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3014	NC_017217	GCC	2	6	1230654	1230659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3015	NC_017217	TTCCCT	2	12	1231961	1231972	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3016	NC_017217	TC	3	6	1231990	1231995	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3017	NC_017217	CGG	2	6	1232028	1232033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3018	NC_017217	CGC	2	6	1232072	1232077	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3019	NC_017217	TTG	2	6	1232120	1232125	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3020	NC_017217	CTG	2	6	1232154	1232159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3021	NC_017217	GCT	2	6	1232171	1232176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3022	NC_017217	GCAT	2	8	1232214	1232221	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3023	NC_017217	CA	3	6	1232225	1232230	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3024	NC_017217	CTG	2	6	1232274	1232279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3025	NC_017217	GCT	2	6	1232291	1232296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3026	NC_017217	TTGC	2	8	1232322	1232329	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3027	NC_017217	GCAT	2	8	1233753	1233760	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3028	NC_017217	GCAC	2	8	1233784	1233791	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3029	NC_017217	CG	3	6	1235250	1235255	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3030	NC_017217	CCG	2	6	1236694	1236699	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3031	NC_017217	GTTCT	2	10	1238130	1238139	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
3032	NC_017217	CCT	2	6	1239481	1239486	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3033	NC_017217	GGGGC	2	10	1240510	1240519	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
3034	NC_017217	GCCCC	2	10	1240526	1240535	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
3035	NC_017217	ACG	2	6	1242973	1242978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3036	NC_017217	CACAA	2	10	1243093	1243102	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
3037	NC_017217	GGCG	2	8	1243103	1243110	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3038	NC_017217	GCC	2	6	1243127	1243132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3039	NC_017217	ATA	2	6	1243152	1243157	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3040	NC_017217	CAT	2	6	1243389	1243394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3041	NC_017217	TGG	2	6	1245205	1245210	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3042	NC_017217	GGC	2	6	1245225	1245230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3043	NC_017217	CCT	2	6	1246500	1246505	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3044	NC_017217	TCCG	2	8	1248637	1248644	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3045	NC_017217	GT	3	6	1248697	1248702	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3046	NC_017217	CGT	2	6	1248706	1248711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3047	NC_017217	TGT	2	6	1249803	1249808	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3048	NC_017217	TG	3	6	1249827	1249832	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3049	NC_017217	ACGC	2	8	1249894	1249901	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3050	NC_017217	GTT	2	6	1249904	1249909	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3051	NC_017217	GC	3	6	1249928	1249933	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3052	NC_017217	AACCG	2	10	1249935	1249944	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
3053	NC_017217	TAT	2	6	1250013	1250018	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3054	NC_017217	GGC	2	6	1250570	1250575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3055	NC_017217	GCC	2	6	1250590	1250595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3056	NC_017217	CCT	2	6	1252983	1252988	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3057	NC_017217	CTC	2	6	1252993	1252998	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3058	NC_017217	GC	3	6	1253072	1253077	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3059	NC_017217	TAC	2	6	1253890	1253895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3060	NC_017217	CAC	2	6	1256645	1256650	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3061	NC_017217	GAG	2	6	1260536	1260541	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3062	NC_017217	ATT	2	6	1265242	1265247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3063	NC_017217	GC	3	6	1265900	1265905	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3064	NC_017217	TCG	2	6	1265921	1265926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3065	NC_017217	CGT	2	6	1266067	1266072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3066	NC_017217	ATA	2	6	1266086	1266091	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3067	NC_017217	TATG	2	8	1266115	1266122	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3068	NC_017217	GAGCGC	2	12	1266127	1266138	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
3069	NC_017217	GAA	2	6	1266172	1266177	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3070	NC_017217	CAG	3	9	1266178	1266186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3071	NC_017217	CCA	2	6	1266222	1266227	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3072	NC_017217	GCG	2	6	1266317	1266322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3073	NC_017217	ACG	2	6	1266326	1266331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3074	NC_017217	CGG	2	6	1266345	1266350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3075	NC_017217	CCA	2	6	1266447	1266452	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3076	NC_017217	CGT	2	6	1266487	1266492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3077	NC_017217	TGC	2	6	1266507	1266512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3078	NC_017217	AT	3	6	1266513	1266518	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3079	NC_017217	TCT	2	6	1267830	1267835	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3080	NC_017217	TTC	2	6	1267856	1267861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3081	NC_017217	GAT	2	6	1267873	1267878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3082	NC_017217	GC	3	6	1269126	1269131	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3083	NC_017217	CTC	2	6	1269149	1269154	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3084	NC_017217	CTC	2	6	1271543	1271548	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3085	NC_017217	AG	3	6	1271571	1271576	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3086	NC_017217	GTC	2	6	1271615	1271620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3087	NC_017217	GCAC	2	8	1271629	1271636	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3088	NC_017217	CGT	2	6	1273176	1273181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3089	NC_017217	TGCT	2	8	1273183	1273190	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3090	NC_017217	ATT	2	6	1273254	1273259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3091	NC_017217	GGC	2	6	1274030	1274035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3092	NC_017217	TCC	2	6	1275261	1275266	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3093	NC_017217	CAG	2	6	1275294	1275299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3094	NC_017217	GCG	2	6	1277542	1277547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3095	NC_017217	CTC	2	6	1278337	1278342	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3096	NC_017217	CTC	2	6	1280097	1280102	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3097	NC_017217	GCT	2	6	1280111	1280116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3098	NC_017217	CAT	2	6	1280163	1280168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3099	NC_017217	GCG	2	6	1280194	1280199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3100	NC_017217	CAA	2	6	1283172	1283177	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3101	NC_017217	T	6	6	1283215	1283220	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3102	NC_017217	CA	3	6	1283270	1283275	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3103	NC_017217	TG	3	6	1283278	1283283	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3104	NC_017217	GCC	2	6	1283287	1283292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3105	NC_017217	TA	3	6	1284080	1284085	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3106	NC_017217	A	6	6	1284183	1284188	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3107	NC_017217	CCT	2	6	1284274	1284279	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3108	NC_017217	CCA	2	6	1284284	1284289	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3109	NC_017217	GCAG	2	8	1284292	1284299	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3110	NC_017217	GA	3	6	1284418	1284423	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3111	NC_017217	GCA	2	6	1284428	1284433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3112	NC_017217	GCCT	2	8	1284445	1284452	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3113	NC_017217	CGG	2	6	1284473	1284478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3114	NC_017217	ACC	2	6	1284487	1284492	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3115	NC_017217	TGAT	2	8	1284700	1284707	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3116	NC_017217	CGGC	2	8	1285412	1285419	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3117	NC_017217	AAG	2	6	1285445	1285450	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3118	NC_017217	CTC	2	6	1286608	1286613	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3119	NC_017217	GGC	2	6	1286674	1286679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3120	NC_017217	GC	3	6	1286684	1286689	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3121	NC_017217	GGA	2	6	1286705	1286710	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3122	NC_017217	CA	3	6	1286721	1286726	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3123	NC_017217	GCA	2	6	1286733	1286738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3124	NC_017217	ACC	2	6	1286859	1286864	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3125	NC_017217	AT	3	6	1287174	1287179	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3126	NC_017217	GCG	2	6	1287185	1287190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3127	NC_017217	CCA	2	6	1287212	1287217	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3128	NC_017217	AGC	2	6	1287219	1287224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3129	NC_017217	CCTTT	2	10	1287779	1287788	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
3130	NC_017217	CTCC	2	8	1288425	1288432	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
3131	NC_017217	CGT	2	6	1288434	1288439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3264	NC_017217	ACACT	2	10	1352591	1352600	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
3265	NC_017217	AATA	2	8	1352615	1352622	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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