MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bacillus thuringiensis serovar chinensis CT-43 plasmid pCT6880

Total Repeats: 68

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017210	AT	3	6	5	10	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017210	TTA	2	6	16	21	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017210	AT	3	6	32	37	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017210	A	6	6	83	88	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017210	T	6	6	106	111	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017210	TAA	2	6	123	128	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017210	A	7	7	169	175	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017210	TA	3	6	178	183	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017210	ACA	2	6	218	223	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_017210	A	7	7	223	229	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017210	GTT	2	6	250	255	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017210	AAC	2	6	260	265	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_017210	AGA	2	6	269	274	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017210	T	7	7	280	286	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017210	AATT	2	8	297	304	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017210	AATT	2	8	321	328	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017210	ATA	2	6	340	345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017210	GAG	2	6	387	392	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017210	T	8	8	1036	1043	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017210	GT	3	6	1052	1057	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017210	AC	3	6	1092	1097	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_017210	AT	3	6	1118	1123	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017210	T	8	8	1129	1136	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017210	CT	5	10	1147	1156	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_017210	TA	4	8	1165	1172	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017210	TTC	2	6	1252	1257	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_017210	T	6	6	1268	1273	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017210	ACA	2	6	1565	1570	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_017210	TGG	2	6	2042	2047	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017210	CAA	2	6	2129	2134	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_017210	CT	3	6	2199	2204	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_017210	AGT	2	6	2228	2233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017210	TGT	2	6	3592	3597	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017210	A	6	6	3598	3603	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017210	GTG	2	6	3640	3645	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017210	GTC	2	6	3710	3715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_017210	TGG	2	6	3758	3763	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017210	AATA	2	8	3810	3817	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017210	A	6	6	3851	3856	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017210	TA	4	8	3871	3878	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017210	T	6	6	3885	3890	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017210	AGAA	2	8	4087	4094	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017210	AGT	2	6	4171	4176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017210	TAGA	2	8	4230	4237	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017210	T	6	6	4246	4251	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017210	T	6	6	4253	4258	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017210	GATT	2	8	4288	4295	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017210	AT	3	6	4347	4352	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017210	TAT	2	6	4360	4365	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017210	ATG	2	6	4407	4412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017210	ATT	2	6	4458	4463	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017210	T	6	6	5240	5245	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017210	GATT	2	8	5318	5325	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017210	A	6	6	5341	5346	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017210	GTAT	2	8	5363	5370	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017210	T	6	6	5370	5375	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017210	T	6	6	5389	5394	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017210	TAT	2	6	5399	5404	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017210	TAA	2	6	5498	5503	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017210	A	8	8	5517	5524	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017210	TAAA	2	8	5541	5548	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017210	ATT	2	6	5625	5630	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017210	T	6	6	5629	5634	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017210	TAAAG	2	10	5684	5693	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017210	TAA	2	6	5698	5703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017210	TTTG	2	8	6809	6816	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017210	T	6	6	6838	6843	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017210	TAT	2	6	6853	6858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.