MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Bacillus thuringiensis serovar chinensis CT-43 plasmid pCT83

Total Repeats: 528

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017206	TCCCT	2	10	272	281	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
2	NC_017206	A	6	6	349	354	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017206	GGA	2	6	355	360	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017206	CAT	2	6	767	772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_017206	TTTA	2	8	809	816	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017206	T	6	6	970	975	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017206	A	6	6	1022	1027	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017206	TCC	2	6	1102	1107	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_017206	AT	3	6	1118	1123	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017206	ATT	2	6	1129	1134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017206	T	7	7	1151	1157	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017206	TAA	2	6	1177	1182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017206	GAAA	2	8	2403	2410	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017206	AT	3	6	2426	2431	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017206	TGAA	2	8	2450	2457	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017206	TTA	2	6	2463	2468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017206	AAC	2	6	2526	2531	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_017206	ATT	2	6	2555	2560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017206	AAG	2	6	2605	2610	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017206	AT	3	6	2620	2625	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017206	CAAAA	2	10	2630	2639	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_017206	A	9	9	2636	2644	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017206	GTT	2	6	2668	2673	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017206	TA	3	6	2745	2750	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017206	GAA	2	6	2782	2787	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017206	TG	3	6	2812	2817	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017206	A	6	6	2822	2827	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017206	AGG	2	6	2829	2834	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017206	T	7	7	2835	2841	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017206	A	7	7	3861	3867	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017206	A	6	6	3890	3895	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017206	CCT	2	6	3899	3904	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_017206	TAT	2	6	3962	3967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017206	A	6	6	3996	4001	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017206	AATTG	2	10	4018	4027	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017206	AAG	2	6	4055	4060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017206	AAAT	2	8	4101	4108	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017206	AT	3	6	4113	4118	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017206	T	8	8	4132	4139	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017206	TAT	2	6	4151	4156	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017206	CTT	2	6	4241	4246	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_017206	AT	3	6	4326	4331	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017206	AAAC	2	8	4347	4354	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_017206	AATT	2	8	4384	4391	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017206	AAT	2	6	4395	4400	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017206	ACA	2	6	4429	4434	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_017206	TCTTA	2	10	4458	4467	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
48	NC_017206	GGCGG	2	10	4601	4610	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
49	NC_017206	TCC	2	6	4637	4642	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_017206	CAT	2	6	4656	4661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_017206	TA	3	6	4688	4693	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017206	AGA	2	6	4790	4795	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017206	TTGT	2	8	4822	4829	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017206	TA	3	6	4840	4845	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017206	TA	3	6	4877	4882	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017206	AGAT	2	8	5867	5874	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017206	T	6	6	6573	6578	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017206	A	7	7	6611	6617	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017206	TTA	2	6	6644	6649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017206	ATTA	2	8	6653	6660	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017206	AAT	2	6	6662	6667	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017206	GAT	2	6	6668	6673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017206	AGA	2	6	6685	6690	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017206	AAAT	2	8	6875	6882	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017206	TAA	2	6	6945	6950	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017206	TATT	2	8	6966	6973	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017206	A	6	6	7046	7051	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017206	AGG	2	6	7060	7065	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017206	A	6	6	9399	9404	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017206	GTT	2	6	9407	9412	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017206	T	6	6	9431	9436	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017206	ATT	2	6	9476	9481	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017206	GAGG	2	8	9554	9561	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017206	A	6	6	10130	10135	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017206	CAT	2	6	10139	10144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_017206	TTTATT	2	12	10150	10161	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017206	CA	3	6	10166	10171	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_017206	ATT	2	6	10173	10178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017206	TTC	2	6	10180	10185	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_017206	TGTA	2	8	10239	10246	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017206	TGT	2	6	10285	10290	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017206	ATG	2	6	10291	10296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017206	TCGT	2	8	10355	10362	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
84	NC_017206	AAATTT	2	12	10398	10409	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017206	AAT	2	6	10414	10419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017206	AT	3	6	10439	10444	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017206	TAAA	2	8	10456	10463	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017206	CCT	2	6	13667	13672	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_017206	TAC	2	6	14076	14081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_017206	AGG	2	6	14097	14102	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017206	ATT	2	6	14145	14150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017206	ATA	2	6	14513	14518	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017206	A	7	7	14574	14580	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017206	T	6	6	14589	14594	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017206	A	7	7	14632	14638	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017206	ACA	2	6	14728	14733	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_017206	TCT	2	6	14747	14752	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_017206	AG	3	6	14862	14867	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017206	AAC	2	6	14872	14877	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_017206	AGA	2	6	15771	15776	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017206	A	6	6	15778	15783	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017206	TAA	2	6	15799	15804	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017206	A	6	6	15924	15929	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017206	AAT	2	6	15946	15951	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017206	CATA	2	8	15994	16001	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
106	NC_017206	AGTT	2	8	16021	16028	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017206	T	7	7	16027	16033	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017206	T	6	6	16063	16068	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017206	T	6	6	16077	16082	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017206	T	6	6	16091	16096	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017206	TAT	2	6	16377	16382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017206	A	6	6	16412	16417	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017206	TAAAA	2	10	16449	16458	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017206	GTA	2	6	16466	16471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017206	T	7	7	16523	16529	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017206	CT	3	6	16541	16546	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_017206	ATT	2	6	16593	16598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017206	AAT	2	6	16606	16611	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017206	T	6	6	16630	16635	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017206	T	6	6	16653	16658	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017206	TTCAA	2	10	16740	16749	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
122	NC_017206	CAA	2	6	16753	16758	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_017206	T	6	6	16806	16811	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017206	A	6	6	16819	16824	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017206	CTT	2	6	16894	16899	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_017206	TCC	2	6	18066	18071	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_017206	CCTTC	2	10	18303	18312	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
128	NC_017206	CAAC	2	8	18364	18371	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_017206	ATTG	2	8	18391	18398	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017206	AAC	2	6	18439	18444	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_017206	TTC	2	6	18447	18452	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_017206	CT	3	6	18463	18468	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_017206	CAT	2	6	18509	18514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_017206	TTC	2	6	18566	18571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_017206	TTC	2	6	18711	18716	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_017206	T	6	6	18718	18723	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017206	CCT	2	6	19096	19101	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
138	NC_017206	T	6	6	19119	19124	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017206	TAGA	2	8	19184	19191	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017206	ACC	2	6	19201	19206	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
141	NC_017206	TAA	2	6	19250	19255	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017206	TGA	2	6	19280	19285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017206	TTC	2	6	19296	19301	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_017206	GTA	2	6	19316	19321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017206	TTA	2	6	19326	19331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017206	AGG	2	6	19338	19343	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017206	ACA	2	6	19344	19349	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_017206	T	7	7	20589	20595	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017206	T	6	6	20625	20630	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017206	ATTT	2	8	20712	20719	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_017206	T	6	6	20739	20744	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_017206	AATTTA	2	12	20781	20792	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_017206	TA	3	6	20796	20801	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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156	NC_017206	A	6	6	20855	20860	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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176	NC_017206	T	6	6	23892	23897	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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