MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Bacillus thuringiensis serovar chinensis CT-43 plasmid pCT127

Total Repeats: 628

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017202	A	6	6	1	6	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017202	ACA	2	6	11	16	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017202	TGT	2	6	29	34	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017202	TAA	2	6	46	51	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017202	ATAA	2	8	89	96	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017202	GGA	2	6	129	134	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017202	A	6	6	3998	4003	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017202	T	7	7	4016	4022	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017202	AAAAT	2	10	4065	4074	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017202	A	6	6	4096	4101	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017202	AC	4	8	4131	4138	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_017202	AGAA	2	8	5639	5646	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017202	T	7	7	5652	5658	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017202	TAAAG	2	10	5727	5736	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017202	GTTAT	2	10	5759	5768	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017202	GTT	2	6	5780	5785	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017202	ACA	2	6	5798	5803	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_017202	AAG	2	6	5812	5817	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017202	TAA	2	6	6541	6546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017202	AGG	2	6	6549	6554	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017202	AT	3	6	7301	7306	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017202	TA	3	6	7384	7389	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017202	AGAA	2	8	7467	7474	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017202	GA	3	6	7559	7564	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017202	ACG	2	6	7571	7576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_017202	TAT	2	6	7588	7593	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017202	AG	3	6	7594	7599	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017202	AGA	2	6	8023	8028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017202	CA	3	6	8035	8040	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_017202	C	7	7	8051	8057	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
31	NC_017202	TA	3	6	8063	8068	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017202	TA	3	6	8071	8076	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017202	TAT	2	6	8144	8149	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017202	TAA	2	6	8173	8178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017202	TAT	2	6	8180	8185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017202	TAG	2	6	8197	8202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017202	ATT	2	6	8297	8302	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017202	A	6	6	8316	8321	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017202	TCGT	2	8	8363	8370	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_017202	AT	3	6	8382	8387	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017202	CTTTT	2	10	8442	8451	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_017202	A	6	6	8521	8526	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017202	ACA	2	6	8540	8545	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_017202	A	6	6	8548	8553	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017202	TA	3	6	8589	8594	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017202	GA	3	6	8610	8615	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017202	AGG	2	6	8899	8904	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017202	AAT	2	6	8916	8921	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017202	A	6	6	8925	8930	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017202	AG	3	6	8939	8944	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017202	T	7	7	8949	8955	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017202	TGAA	2	8	8971	8978	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017202	GAA	2	6	8985	8990	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017202	GT	3	6	9053	9058	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017202	ACT	2	6	9107	9112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_017202	GA	3	6	9239	9244	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017202	CAA	2	6	9317	9322	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_017202	T	7	7	9343	9349	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017202	TAG	2	6	9353	9358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017202	TAT	2	6	9497	9502	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017202	AAT	2	6	9562	9567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017202	GAAATG	2	12	10665	10676	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017202	A	6	6	10881	10886	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017202	TTA	2	6	11018	11023	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017202	ATA	2	6	11089	11094	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017202	GTTCC	2	10	11178	11187	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
67	NC_017202	TAA	2	6	11338	11343	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017202	TGA	2	6	11344	11349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017202	GCG	2	6	11433	11438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_017202	TTA	2	6	11476	11481	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017202	TA	3	6	11497	11502	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017202	TA	3	6	11575	11580	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017202	TAG	2	6	11590	11595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017202	GTC	2	6	11617	11622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_017202	A	6	6	11813	11818	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017202	GAA	2	6	11868	11873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017202	TAAT	2	8	12140	12147	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017202	ATT	2	6	12171	12176	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017202	TACT	2	8	12195	12202	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_017202	T	6	6	12243	12248	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017202	AAT	2	6	12254	12259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017202	A	6	6	12333	12338	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017202	GCG	2	6	12373	12378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_017202	CGG	2	6	12426	12431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_017202	ATT	2	6	12479	12484	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017202	GTA	2	6	12501	12506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017202	TTTAT	2	10	12973	12982	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017202	CG	3	6	13005	13010	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
89	NC_017202	AAT	2	6	13041	13046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017202	CCT	2	6	13178	13183	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_017202	TAA	2	6	13210	13215	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017202	A	7	7	13214	13220	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017202	ATA	2	6	13227	13232	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017202	TA	3	6	13248	13253	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017202	GCG	2	6	13292	13297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_017202	CTC	2	6	14038	14043	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_017202	AGG	2	6	14149	14154	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017202	CCT	2	6	14886	14891	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_017202	CAT	2	6	14901	14906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_017202	ATT	2	6	14913	14918	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017202	TAC	2	6	15073	15078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_017202	A	7	7	15105	15111	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017202	A	6	6	15134	15139	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017202	AT	3	6	15147	15152	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017202	ATT	2	6	15154	15159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017202	T	7	7	15179	15185	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017202	A	6	6	15190	15195	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017202	ACA	2	6	15200	15205	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_017202	TGT	2	6	15218	15223	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017202	TAA	2	6	15235	15240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017202	ATAA	2	8	15278	15285	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017202	GGA	2	6	15318	15323	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017202	A	6	6	19187	19192	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017202	T	7	7	19205	19211	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017202	TCT	2	6	19297	19302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_017202	A	7	7	19337	19343	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017202	AT	3	6	19353	19358	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017202	A	6	6	19406	19411	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017202	A	6	6	19474	19479	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017202	T	7	7	19662	19668	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017202	GAA	2	6	19944	19949	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017202	ATG	2	6	20018	20023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017202	AGC	2	6	20145	20150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_017202	TCA	2	6	20165	20170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_017202	TCC	2	6	21565	21570	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_017202	TGC	2	6	21581	21586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_017202	TAC	2	6	21601	21606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_017202	TTC	2	6	21683	21688	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_017202	TC	3	6	21728	21733	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_017202	CGC	2	6	21739	21744	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
131	NC_017202	CCG	2	6	21752	21757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_017202	TTG	2	6	21795	21800	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017202	GGAGT	2	10	21966	21975	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017202	GATG	2	8	23159	23166	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017202	TG	3	6	23165	23170	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017202	AAG	2	6	23197	23202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017202	ATTA	2	8	23258	23265	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017202	ATA	3	9	23282	23290	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017202	ATATT	2	10	23296	23305	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017202	TAC	2	6	23357	23362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_017202	TTC	2	6	23373	23378	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_017202	TAT	2	6	23439	23444	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017202	TAA	2	6	23511	23516	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017202	AAATA	2	10	23536	23545	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017202	A	7	7	23582	23588	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017202	A	7	7	23604	23610	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017202	TTCT	2	8	23616	23623	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
148	NC_017202	AT	4	8	24879	24886	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017202	TCT	3	9	24902	24910	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_017202	TCT	2	6	24971	24976	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
151	NC_017202	A	7	7	25011	25017	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_017202	AT	3	6	25027	25032	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_017202	A	6	6	25080	25085	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_017202	A	6	6	25148	25153	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_017202	A	6	6	25300	25305	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_017202	CT	3	6	25315	25320	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
157	NC_017202	ACT	2	6	25385	25390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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167	NC_017202	TAA	2	6	29384	29389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
168	NC_017202	TA	4	8	29405	29412	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
169	NC_017202	TA	3	6	29560	29565	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
170	NC_017202	ATT	2	6	29612	29617	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
171	NC_017202	ATT	2	6	29668	29673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
172	NC_017202	TCC	2	6	33630	33635	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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177	NC_017202	T	6	6	33772	33777	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
178	NC_017202	A	7	7	33832	33838	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
179	NC_017202	T	7	7	33857	33863	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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181	NC_017202	TTG	2	6	33907	33912	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
182	NC_017202	CTT	2	6	33917	33922	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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184	NC_017202	AT	3	6	33973	33978	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
185	NC_017202	T	6	6	33983	33988	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
186	NC_017202	T	6	6	34089	34094	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
187	NC_017202	TAT	2	6	34411	34416	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
188	NC_017202	A	7	7	34481	34487	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
189	NC_017202	TA	3	6	34822	34827	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
190	NC_017202	TAA	2	6	34843	34848	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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204	NC_017202	TTAT	2	8	36850	36857	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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282	NC_017202	TA	3	6	52817	52822	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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288	NC_017202	T	7	7	52997	53003	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
289	NC_017202	TCG	2	6	53013	53018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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293	NC_017202	GGT	2	6	53342	53347	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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295	NC_017202	ATA	2	6	55465	55470	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
296	NC_017202	AAATA	2	10	55476	55485	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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