MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bacillus megaterium WSH-002 plasmid WSH-002_p2

Total Repeats: 67

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017140	AAAG	2	8	3	10	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017140	TAA	2	6	17	22	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017140	A	6	6	36	41	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017140	AGTTTA	2	12	52	63	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017140	TTC	2	6	88	93	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_017140	TA	4	8	436	443	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017140	ATA	2	6	449	454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017140	TAT	2	6	530	535	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017140	T	7	7	559	565	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017140	TAG	2	6	585	590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017140	ATA	3	9	635	643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017140	ATTA	2	8	658	665	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017140	TAT	2	6	666	671	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017140	AAAC	2	8	736	743	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_017140	ATTA	2	8	752	759	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017140	TAA	4	12	762	773	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017140	TAA	2	6	798	803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017140	TA	4	8	804	811	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017140	TAC	2	6	813	818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_017140	TTAAT	2	10	835	844	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017140	CTA	2	6	884	889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_017140	TCA	2	6	1157	1162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_017140	GGA	2	6	1163	1168	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017140	ATA	2	6	1242	1247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017140	CTACA	2	10	1250	1259	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
26	NC_017140	T	6	6	1334	1339	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017140	TA	3	6	1359	1364	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017140	TC	3	6	1409	1414	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_017140	TAAA	2	8	1424	1431	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017140	TAT	2	6	1436	1441	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017140	TG	3	6	2237	2242	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017140	TGA	2	6	2245	2250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017140	CA	3	6	2253	2258	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_017140	GGC	2	6	2288	2293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_017140	T	6	6	2314	2319	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017140	A	6	6	2326	2331	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017140	TAA	2	6	2373	2378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017140	TAA	2	6	2421	2426	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017140	TAAA	2	8	2498	2505	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017140	A	6	6	2503	2508	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017140	ATG	2	6	2521	2526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017140	T	6	6	2535	2540	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017140	GAA	2	6	3145	3150	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017140	TCCT	2	8	3208	3215	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_017140	TTC	2	6	3744	3749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_017140	CT	3	6	4074	4079	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_017140	TC	3	6	4136	4141	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_017140	TG	3	6	4205	4210	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017140	ATG	3	9	4328	4336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017140	TCA	2	6	4340	4345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_017140	TCA	2	6	4374	4379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_017140	AGG	2	6	4414	4419	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017140	T	6	6	6450	6455	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017140	ACAG	2	8	6472	6479	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
55	NC_017140	GGT	2	6	6503	6508	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017140	ATT	2	6	6527	6532	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017140	TA	3	6	7543	7548	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017140	CATA	2	8	7571	7578	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
59	NC_017140	TAAA	2	8	7586	7593	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017140	TTTA	2	8	7619	7626	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017140	ACT	2	6	8370	8375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_017140	ATTT	2	8	8404	8411	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017140	T	6	6	8437	8442	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017140	T	7	7	8446	8452	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017140	GT	3	6	8492	8497	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017140	TAT	2	6	8498	8503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017140	TA	3	6	9685	9690	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.