MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bradyrhizobium sp. S23321

Total Repeats: 18087

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18001	NC_017082	TC	3	6	7213967	7213972	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18002	NC_017082	CGTGC	2	10	7213973	7213982	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
18003	NC_017082	TA	3	6	7215799	7215804	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18004	NC_017082	AAC	2	6	7215855	7215860	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18005	NC_017082	CG	3	6	7215883	7215888	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18006	NC_017082	GTCT	2	8	7215948	7215955	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
18007	NC_017082	GCAAG	2	10	7217177	7217186	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
18008	NC_017082	CGT	2	6	7217202	7217207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18009	NC_017082	CGC	2	6	7217212	7217217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18010	NC_017082	CGC	2	6	7217237	7217242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18011	NC_017082	CTG	2	6	7217260	7217265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18012	NC_017082	CGC	2	6	7217313	7217318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18013	NC_017082	CTC	2	6	7217608	7217613	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18014	NC_017082	ATC	2	6	7217643	7217648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18015	NC_017082	CGC	2	6	7217681	7217686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18016	NC_017082	A	6	6	7217699	7217704	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18017	NC_017082	GTT	2	6	7218745	7218750	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18018	NC_017082	GTC	2	6	7218776	7218781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18019	NC_017082	ACG	2	6	7218833	7218838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18020	NC_017082	GGCT	2	8	7219262	7219269	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
18021	NC_017082	GTC	2	6	7219285	7219290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18022	NC_017082	AG	4	8	7219322	7219329	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18023	NC_017082	CCT	2	6	7219348	7219353	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18024	NC_017082	C	6	6	7219354	7219359	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
18025	NC_017082	AAT	2	6	7219397	7219402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18026	NC_017082	GCC	2	6	7219412	7219417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18027	NC_017082	GGA	2	6	7219438	7219443	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18028	NC_017082	GTCCG	2	10	7222251	7222260	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
18029	NC_017082	AAC	2	6	7222270	7222275	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18030	NC_017082	TGA	2	6	7222299	7222304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18031	NC_017082	CTCGC	2	10	7222326	7222335	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
18032	NC_017082	GTC	2	6	7222344	7222349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18033	NC_017082	CGG	2	6	7222384	7222389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18034	NC_017082	GCG	2	6	7222407	7222412	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18035	NC_017082	CCG	2	6	7222476	7222481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18036	NC_017082	CGG	2	6	7222493	7222498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18037	NC_017082	CGG	2	6	7225333	7225338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18038	NC_017082	ATCG	2	8	7225429	7225436	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
18039	NC_017082	CAACG	2	10	7225495	7225504	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
18040	NC_017082	TCC	2	6	7225546	7225551	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18041	NC_017082	AAC	2	6	7225588	7225593	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18042	NC_017082	AGCA	2	8	7226756	7226763	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
18043	NC_017082	GCGA	2	8	7226870	7226877	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
18044	NC_017082	GAGC	2	8	7226926	7226933	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
18045	NC_017082	TCGA	2	8	7226941	7226948	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
18046	NC_017082	ACCA	2	8	7226951	7226958	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
18047	NC_017082	GC	3	6	7227647	7227652	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18048	NC_017082	CT	3	6	7227655	7227660	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18049	NC_017082	GGA	2	6	7227719	7227724	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18050	NC_017082	CG	3	6	7227749	7227754	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18051	NC_017082	GGA	2	6	7227768	7227773	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18052	NC_017082	GA	3	6	7227772	7227777	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18053	NC_017082	TAA	2	6	7228592	7228597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18054	NC_017082	TCT	2	6	7228684	7228689	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18055	NC_017082	GA	3	6	7228737	7228742	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18056	NC_017082	GGC	2	6	7229460	7229465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18057	NC_017082	CG	3	6	7229499	7229504	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18058	NC_017082	CGC	2	6	7229525	7229530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18059	NC_017082	CGG	2	6	7229571	7229576	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18060	NC_017082	CGG	2	6	7229594	7229599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18061	NC_017082	GTC	2	6	7229943	7229948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18062	NC_017082	GAC	2	6	7229955	7229960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18063	NC_017082	GCCA	2	8	7229973	7229980	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
18064	NC_017082	CT	3	6	7230088	7230093	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18065	NC_017082	GCC	2	6	7230127	7230132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18066	NC_017082	AGC	2	6	7230274	7230279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18067	NC_017082	TGT	2	6	7230675	7230680	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18068	NC_017082	CG	3	6	7230703	7230708	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18069	NC_017082	TTC	2	6	7230716	7230721	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18070	NC_017082	ATG	2	6	7230749	7230754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18071	NC_017082	CTGCG	2	10	7230803	7230812	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
18072	NC_017082	GC	4	8	7230847	7230854	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18073	NC_017082	A	6	6	7230924	7230929	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18074	NC_017082	AAC	2	6	7230942	7230947	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18075	NC_017082	CG	3	6	7230987	7230992	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18076	NC_017082	CG	5	10	7230994	7231003	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18077	NC_017082	GGC	2	6	7231025	7231030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18078	NC_017082	TGC	2	6	7231048	7231053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18079	NC_017082	CG	3	6	7231115	7231120	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18080	NC_017082	GATC	2	8	7231145	7231152	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
18081	NC_017082	GTC	2	6	7231203	7231208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18082	NC_017082	CGG	3	9	7231267	7231275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18083	NC_017082	CAA	2	6	7231296	7231301	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18084	NC_017082	TCGC	2	8	7231382	7231389	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
18085	NC_017082	GA	3	6	7231403	7231408	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18086	NC_017082	GGGCA	2	10	7231467	7231476	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
18087	NC_017082	TC	3	6	7231819	7231824	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.