MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bacillus amyloliquefaciens subsp. plantarum CAU B946

Total Repeats: 12121

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016784	TCTT	2	8	11	18	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_016784	ACA	2	6	40	45	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_016784	CAA	2	6	82	87	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_016784	ATATT	2	10	144	153	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016784	CA	3	6	229	234	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_016784	TTG	2	6	246	251	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_016784	CTA	2	6	288	293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_016784	GT	3	6	316	321	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_016784	T	7	7	346	352	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_016784	AGG	2	6	393	398	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_016784	CTA	2	6	1876	1881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_016784	TAC	2	6	1883	1888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_016784	AT	3	6	1902	1907	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016784	ATTAT	2	10	1910	1919	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_016784	AGG	2	6	1925	1930	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_016784	TGC	2	6	3086	3091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_016784	TCA	2	6	3117	3122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_016784	T	6	6	3160	3165	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016784	AT	3	6	4831	4836	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016784	T	6	6	6825	6830	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016784	CTA	2	6	6879	6884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_016784	ATT	2	6	6971	6976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016784	T	7	7	6998	7004	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016784	TA	3	6	9502	9507	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_016784	A	7	7	9516	9522	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016784	TGA	2	6	9537	9542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016784	TGT	2	6	9561	9566	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016784	T	6	6	9600	9605	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_016784	A	6	6	9606	9611	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_016784	TAAA	2	8	9722	9729	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_016784	AGTC	2	8	9748	9755	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_016784	ACT	2	6	9758	9763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_016784	GGC	2	6	9801	9806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_016784	GCG	2	6	9861	9866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_016784	CCTG	2	8	9891	9898	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
36	NC_016784	CGA	2	6	10046	10051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_016784	GCA	2	6	10120	10125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_016784	CGC	2	6	10167	10172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_016784	GTGA	2	8	10173	10180	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016784	TGT	2	6	10206	10211	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016784	GAA	2	6	10216	10221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_016784	GGC	2	6	10240	10245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_016784	CAG	2	6	10289	10294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_016784	ATT	2	6	10330	10335	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_016784	AGA	2	6	10430	10435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_016784	GGA	2	6	10480	10485	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_016784	CT	3	6	10505	10510	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_016784	GAG	2	6	10528	10533	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016784	TGC	2	6	10625	10630	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_016784	GAA	2	6	10744	10749	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016784	GGT	2	6	10818	10823	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_016784	GTC	2	6	10832	10837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_016784	TCGTG	2	10	10841	10850	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
54	NC_016784	GGA	2	6	10944	10949	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_016784	ATC	2	6	10968	10973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_016784	AC	3	6	10995	11000	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_016784	AC	3	6	11164	11169	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_016784	CAC	2	6	11179	11184	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_016784	AGCC	2	8	11227	11234	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
60	NC_016784	GAT	2	6	11250	11255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_016784	CCT	2	6	11306	11311	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_016784	GGT	2	6	11463	11468	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_016784	CCA	2	6	11485	11490	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_016784	AGG	2	6	11545	11550	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_016784	CCA	2	6	11575	11580	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_016784	GGACG	2	10	11716	11725	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
67	NC_016784	AAGC	2	8	11752	11759	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
68	NC_016784	CAC	2	6	11791	11796	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_016784	GGA	2	6	11876	11881	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_016784	GCG	2	6	11910	11915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_016784	AGG	2	6	12028	12033	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_016784	TC	3	6	12060	12065	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_016784	CGG	2	6	12084	12089	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_016784	GGA	2	6	12116	12121	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_016784	AGT	2	6	12237	12242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_016784	AGA	2	6	12318	12323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_016784	CACG	2	8	12448	12455	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
78	NC_016784	TC	3	6	12521	12526	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_016784	AGC	2	6	12779	12784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_016784	TTC	2	6	12877	12882	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_016784	ACC	2	6	13105	13110	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_016784	G	6	6	13130	13135	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
83	NC_016784	AGG	2	6	13140	13145	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_016784	GCGA	2	8	13236	13243	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
85	NC_016784	TAG	2	6	13248	13253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_016784	GAG	2	6	13335	13340	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_016784	GA	3	6	13358	13363	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_016784	GA	3	6	13437	13442	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_016784	CGG	2	6	13595	13600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_016784	GA	3	6	13693	13698	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_016784	TAGG	2	8	13811	13818	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_016784	TAC	2	6	13865	13870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_016784	CGC	2	6	13895	13900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_016784	CGGG	2	8	13907	13914	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
95	NC_016784	CCT	2	6	13953	13958	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_016784	GGT	2	6	14089	14094	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_016784	CGT	2	6	14284	14289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_016784	GAG	2	6	14333	14338	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_016784	GTT	2	6	14387	14392	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_016784	C	6	6	14460	14465	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
101	NC_016784	GAT	2	6	14511	14516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_016784	ATCG	2	8	14572	14579	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
103	NC_016784	GA	3	6	14624	14629	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_016784	TGG	2	6	14645	14650	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_016784	CGC	2	6	14748	14753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_016784	TCA	2	6	14780	14785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_016784	T	6	6	14795	14800	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_016784	CCTTT	2	10	15768	15777	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
109	NC_016784	ATA	2	6	15841	15846	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_016784	A	6	6	17352	17357	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_016784	T	8	8	17386	17393	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_016784	TGT	2	6	17419	17424	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_016784	TTTGAA	2	12	17427	17438	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_016784	ATGA	2	8	17471	17478	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_016784	AAGA	2	8	18830	18837	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_016784	TGA	2	6	18842	18847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_016784	A	6	6	18877	18882	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_016784	ATT	2	6	18887	18892	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_016784	A	7	7	18896	18902	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_016784	ATCT	2	8	18907	18914	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
121	NC_016784	AG	3	6	20613	20618	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_016784	GTG	2	6	20626	20631	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_016784	T	6	6	20799	20804	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_016784	GTT	2	6	20828	20833	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_016784	GAAAT	2	10	23415	23424	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
126	NC_016784	A	6	6	23425	23430	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_016784	TAT	2	6	23470	23475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_016784	GGA	2	6	23489	23494	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_016784	TCC	2	6	23572	23577	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_016784	AT	3	6	23612	23617	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_016784	T	6	6	23655	23660	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_016784	A	7	7	23667	23673	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_016784	TCC	2	6	24992	24997	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_016784	A	6	6	25064	25069	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_016784	TA	3	6	26362	26367	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_016784	TGAA	2	8	26372	26379	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_016784	CCT	2	6	26385	26390	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
138	NC_016784	AT	3	6	26408	26413	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_016784	A	6	6	26415	26420	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_016784	CTG	2	6	27004	27009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_016784	A	6	6	27042	27047	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_016784	AAG	2	6	27051	27056	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_016784	AG	3	6	27055	27060	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_016784	TG	3	6	27589	27594	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_016784	CAT	2	6	27595	27600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_016784	ATTT	2	8	27627	27634	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_016784	TAAG	2	8	27733	27740	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
148	NC_016784	GGAA	2	8	27795	27802	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
149	NC_016784	GCA	2	6	27803	27808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_016784	ATCA	2	8	27905	27912	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
151	NC_016784	T	6	6	27947	27952	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_016784	TAA	2	6	27997	28002	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_016784	ATG	2	6	28005	28010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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164	NC_016784	AGTC	2	8	31485	31492	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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186	NC_016784	GGA	2	6	32680	32685	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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282	NC_016784	TTG	2	6	53823	53828	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
283	NC_016784	TTTTG	2	10	54144	54153	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
284	NC_016784	ATT	2	6	54172	54177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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289	NC_016784	T	7	7	56805	56811	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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449	NC_016784	ATA	2	6	97016	97021	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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461	NC_016784	CGA	2	6	97638	97643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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