MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Burkholderia sp. YI23 plasmid byi_1p

Total Repeats: 6131

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_016626	CG	3	6	209671	209676	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
502	NC_016626	GTC	2	6	210222	210227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
503	NC_016626	CG	3	6	210335	210340	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
504	NC_016626	CG	3	6	210356	210361	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
505	NC_016626	TGG	2	6	214575	214580	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
506	NC_016626	AGG	2	6	214608	214613	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
507	NC_016626	GC	5	10	214629	214638	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
508	NC_016626	CGG	2	6	214677	214682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
509	NC_016626	CGAT	2	8	214698	214705	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
510	NC_016626	GGCGC	2	10	217925	217934	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
511	NC_016626	CCT	2	6	217971	217976	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
512	NC_016626	GCC	2	6	217991	217996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
513	NC_016626	GC	3	6	218072	218077	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
514	NC_016626	GCG	2	6	218120	218125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
515	NC_016626	GGCG	2	8	218136	218143	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
516	NC_016626	CG	4	8	218160	218167	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
517	NC_016626	ATCGAG	2	12	218222	218233	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
518	NC_016626	TCC	2	6	218287	218292	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
519	NC_016626	ACG	2	6	218340	218345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
520	NC_016626	GGA	2	6	218358	218363	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
521	NC_016626	GTT	2	6	219544	219549	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
522	NC_016626	GCA	2	6	219643	219648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
523	NC_016626	CG	3	6	222484	222489	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
524	NC_016626	CGC	2	6	222507	222512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
525	NC_016626	AGCCC	2	10	222532	222541	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
526	NC_016626	TCT	2	6	223651	223656	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
527	NC_016626	TCC	2	6	223657	223662	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
528	NC_016626	TGC	2	6	223684	223689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
529	NC_016626	AACG	2	8	223691	223698	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
530	NC_016626	GTCG	2	8	223699	223706	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
531	NC_016626	CGG	2	6	223723	223728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
532	NC_016626	CCG	2	6	223822	223827	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
533	NC_016626	GA	3	6	223830	223835	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
534	NC_016626	AGCG	2	8	228009	228016	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
535	NC_016626	CG	3	6	228034	228039	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
536	NC_016626	GGA	2	6	228078	228083	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
537	NC_016626	CGT	2	6	228144	228149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
538	NC_016626	GCG	2	6	228150	228155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
539	NC_016626	CGT	2	6	228163	228168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
540	NC_016626	AGG	3	9	228170	228178	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
541	NC_016626	GCA	2	6	228202	228207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
542	NC_016626	GC	3	6	230666	230671	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
543	NC_016626	GCTT	2	8	230737	230744	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
544	NC_016626	GCG	2	6	230889	230894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
545	NC_016626	ACG	2	6	232079	232084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
546	NC_016626	CGC	2	6	232122	232127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
547	NC_016626	TCG	2	6	232132	232137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
548	NC_016626	TCG	2	6	232184	232189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
549	NC_016626	GAA	2	6	232239	232244	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
550	NC_016626	GCA	2	6	232250	232255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
551	NC_016626	GGA	2	6	232277	232282	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
552	NC_016626	GCG	2	6	232297	232302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
553	NC_016626	GGGCA	2	10	232338	232347	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
554	NC_016626	GAAGA	2	10	232359	232368	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
555	NC_016626	ACG	3	9	232374	232382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
556	NC_016626	GC	3	6	232427	232432	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
557	NC_016626	CCG	2	6	234205	234210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
558	NC_016626	CGC	3	9	234215	234223	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
559	NC_016626	GCC	3	9	234231	234239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
560	NC_016626	CGATCC	2	12	234273	234284	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
561	NC_016626	GCC	3	9	234288	234296	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
562	NC_016626	TGC	2	6	234299	234304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
563	NC_016626	GCC	2	6	234309	234314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
564	NC_016626	C	7	7	234318	234324	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
565	NC_016626	GCC	2	6	234336	234341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
566	NC_016626	T	7	7	234710	234716	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_016626	TG	3	6	234731	234736	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
568	NC_016626	TCG	2	6	234751	234756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
569	NC_016626	CGC	2	6	234811	234816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
570	NC_016626	CGT	2	6	234848	234853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
571	NC_016626	ACG	2	6	234860	234865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
572	NC_016626	CGG	2	6	234959	234964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
573	NC_016626	TGCG	2	8	234969	234976	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
574	NC_016626	CGT	2	6	235070	235075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
575	NC_016626	TG	3	6	235085	235090	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
576	NC_016626	AGAT	2	8	235131	235138	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
577	NC_016626	GCC	2	6	235222	235227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
578	NC_016626	CGAAT	2	10	235239	235248	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
579	NC_016626	CAA	2	6	236454	236459	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
580	NC_016626	CCG	2	6	236491	236496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
581	NC_016626	TTAG	2	8	236505	236512	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
582	NC_016626	GAC	2	6	236520	236525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
583	NC_016626	GC	3	6	236609	236614	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
584	NC_016626	TCGC	2	8	236659	236666	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
585	NC_016626	GGCG	2	8	236703	236710	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
586	NC_016626	TCG	2	6	236711	236716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
587	NC_016626	ATT	2	6	236757	236762	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
588	NC_016626	A	7	7	236860	236866	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
589	NC_016626	ACTT	2	8	236894	236901	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
590	NC_016626	AAC	2	6	236943	236948	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
591	NC_016626	CAG	2	6	238076	238081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
592	NC_016626	ACGC	3	12	238107	238118	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
593	NC_016626	GAA	3	9	238119	238127	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
594	NC_016626	GATC	2	8	238148	238155	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
595	NC_016626	CGT	2	6	239245	239250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
596	NC_016626	GCGG	2	8	239255	239262	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
597	NC_016626	CCGG	2	8	239266	239273	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
598	NC_016626	GCAA	2	8	239318	239325	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
599	NC_016626	GC	3	6	239341	239346	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
600	NC_016626	GC	4	8	240459	240466	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
601	NC_016626	GCC	2	6	240480	240485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
602	NC_016626	TGC	2	6	240616	240621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
603	NC_016626	GCT	2	6	240624	240629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
604	NC_016626	CAA	2	6	240642	240647	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
605	NC_016626	AAG	2	6	240648	240653	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
606	NC_016626	GGA	2	6	240661	240666	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
607	NC_016626	CTT	2	6	242065	242070	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
608	NC_016626	A	7	7	242082	242088	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
609	NC_016626	GCC	2	6	242092	242097	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
610	NC_016626	GCGG	2	8	242106	242113	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
611	NC_016626	CGA	2	6	242131	242136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
612	NC_016626	CGGC	2	8	245309	245316	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
613	NC_016626	T	6	6	245321	245326	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
614	NC_016626	TTG	2	6	245329	245334	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
615	NC_016626	CCAG	2	8	245423	245430	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
616	NC_016626	GGT	2	6	245448	245453	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
617	NC_016626	GC	3	6	245541	245546	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
618	NC_016626	GTC	2	6	245547	245552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
619	NC_016626	TCT	2	6	245594	245599	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
620	NC_016626	GAT	2	6	245600	245605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
621	NC_016626	T	7	7	245605	245611	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
622	NC_016626	GC	3	6	246846	246851	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
623	NC_016626	CGC	2	6	246906	246911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
624	NC_016626	TTTC	2	8	251204	251211	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
625	NC_016626	TGA	2	6	251226	251231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
626	NC_016626	GC	3	6	251261	251266	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
627	NC_016626	CAA	2	6	251289	251294	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
628	NC_016626	GA	4	8	251327	251334	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
629	NC_016626	GC	4	8	253958	253965	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
630	NC_016626	GCG	2	6	255534	255539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
631	NC_016626	TG	3	6	257398	257403	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
632	NC_016626	ATT	2	6	258811	258816	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
633	NC_016626	CG	3	6	259605	259610	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
634	NC_016626	AGG	2	6	259657	259662	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
635	NC_016626	GC	3	6	260092	260097	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
636	NC_016626	TGGG	2	8	263531	263538	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
637	NC_016626	GC	3	6	263552	263557	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
638	NC_016626	CCT	2	6	264548	264553	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
639	NC_016626	CTT	2	6	264590	264595	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
640	NC_016626	CCA	2	6	264686	264691	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
641	NC_016626	GGC	2	6	265661	265666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
642	NC_016626	CGC	2	6	265678	265683	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
643	NC_016626	GGAA	2	8	267634	267641	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
644	NC_016626	CAT	2	6	275512	275517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
645	NC_016626	CATC	2	8	279439	279446	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
646	NC_016626	ATC	2	6	279473	279478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
647	NC_016626	T	6	6	279480	279485	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
648	NC_016626	CCA	2	6	280460	280465	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
649	NC_016626	ATCAG	2	10	280557	280566	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
650	NC_016626	CGC	2	6	280575	280580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
651	NC_016626	GCG	2	6	280590	280595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
652	NC_016626	CG	3	6	280606	280611	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
653	NC_016626	CCT	2	6	282254	282259	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
654	NC_016626	CGG	2	6	282793	282798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
655	NC_016626	TCG	2	6	282809	282814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
656	NC_016626	GC	3	6	282855	282860	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
657	NC_016626	CGAG	2	8	282891	282898	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
658	NC_016626	CGA	2	6	282936	282941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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661	NC_016626	GCG	2	6	283037	283042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
662	NC_016626	CG	3	6	283041	283046	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
663	NC_016626	GCT	2	6	283047	283052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
664	NC_016626	GAT	2	6	283124	283129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
665	NC_016626	GCCAT	2	10	283138	283147	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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671	NC_016626	CGG	2	6	283271	283276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
672	NC_016626	CG	3	6	283278	283283	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
673	NC_016626	GAC	2	6	283302	283307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
674	NC_016626	TC	3	6	283330	283335	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
675	NC_016626	GCG	2	6	283362	283367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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679	NC_016626	T	7	7	283466	283472	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
680	NC_016626	TAAG	2	8	283484	283491	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
681	NC_016626	ATCG	2	8	283544	283551	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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684	NC_016626	CGA	2	6	283632	283637	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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686	NC_016626	CG	3	6	283853	283858	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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688	NC_016626	CGA	2	6	283926	283931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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691	NC_016626	CG	3	6	285784	285789	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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703	NC_016626	CCG	2	6	295093	295098	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
704	NC_016626	CGC	2	6	295112	295117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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761	NC_016626	C	6	6	336075	336080	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
762	NC_016626	ATA	2	6	336099	336104	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
763	NC_016626	TGT	2	6	336230	336235	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
764	NC_016626	TAT	2	6	336764	336769	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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775	NC_016626	CTA	2	6	346630	346635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
776	NC_016626	T	6	6	346702	346707	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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778	NC_016626	GCG	2	6	346747	346752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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