MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Burkholderia sp. YI23 plasmid byi_2p

Total Repeats: 1178

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_016591	GCACAC	2	12	313152	313163	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
1002	NC_016591	CCT	2	6	313206	313211	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1003	NC_016591	T	6	6	314352	314357	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_016591	A	6	6	314388	314393	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_016591	CA	3	6	314522	314527	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1006	NC_016591	TGC	2	6	314576	314581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1007	NC_016591	A	6	6	314609	314614	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_016591	CAG	2	6	314647	314652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1009	NC_016591	CTT	2	6	314836	314841	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1010	NC_016591	TGA	2	6	314890	314895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_016591	GAA	2	6	314960	314965	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_016591	ATCG	2	8	314978	314985	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1013	NC_016591	AG	3	6	314998	315003	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_016591	GAG	2	6	315018	315023	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_016591	AG	3	6	315041	315046	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_016591	CGC	2	6	315063	315068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1017	NC_016591	CAG	2	6	315157	315162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1018	NC_016591	ACTG	2	8	315219	315226	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1019	NC_016591	TCGAGT	2	12	315278	315289	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
1020	NC_016591	CGT	2	6	315294	315299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1021	NC_016591	T	6	6	316100	316105	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_016591	GA	3	6	316115	316120	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_016591	GTCT	2	8	316168	316175	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1024	NC_016591	TCT	2	6	317293	317298	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1025	NC_016591	T	7	7	317318	317324	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_016591	ACT	2	6	317344	317349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1027	NC_016591	AC	3	6	318092	318097	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1028	NC_016591	AAC	2	6	318100	318105	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1029	NC_016591	TAT	2	6	318199	318204	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_016591	CAG	2	6	319363	319368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1031	NC_016591	GGCC	2	8	319399	319406	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1032	NC_016591	CA	3	6	319449	319454	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1033	NC_016591	CTTTT	2	10	325620	325629	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
1034	NC_016591	T	6	6	325626	325631	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_016591	AAAG	2	8	326308	326315	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_016591	CGGG	2	8	326327	326334	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1037	NC_016591	AGG	2	6	326348	326353	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_016591	GGA	2	6	326360	326365	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_016591	CCT	2	6	326417	326422	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1040	NC_016591	CGT	2	6	326795	326800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1041	NC_016591	AGCA	2	8	326801	326808	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1042	NC_016591	ACG	2	6	327195	327200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1043	NC_016591	GAGT	2	8	327349	327356	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1044	NC_016591	CCG	2	6	327428	327433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1045	NC_016591	TC	3	6	327464	327469	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1046	NC_016591	CGACTG	2	12	327569	327580	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1047	NC_016591	CAC	2	6	327586	327591	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1048	NC_016591	AAAG	2	8	327621	327628	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_016591	CAAC	2	8	327680	327687	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1050	NC_016591	TAG	2	6	328718	328723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_016591	CAT	2	6	328767	328772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1052	NC_016591	GA	3	6	328800	328805	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_016591	TGA	2	6	328926	328931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_016591	TGG	2	6	328983	328988	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1055	NC_016591	CCG	2	6	329064	329069	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1056	NC_016591	AGTT	2	8	329142	329149	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_016591	GC	3	6	329167	329172	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1058	NC_016591	CTT	2	6	329203	329208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1059	NC_016591	CGAGT	2	10	329212	329221	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1060	NC_016591	GGT	2	6	329232	329237	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_016591	TCG	2	6	329275	329280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1062	NC_016591	TTC	2	6	329671	329676	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1063	NC_016591	TTG	2	6	329712	329717	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_016591	AGC	2	6	329759	329764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1065	NC_016591	TCAA	2	8	329900	329907	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1066	NC_016591	GGC	2	6	329988	329993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1067	NC_016591	CGA	2	6	331324	331329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1068	NC_016591	AC	3	6	331398	331403	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1069	NC_016591	CGA	2	6	331496	331501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1070	NC_016591	AG	3	6	331513	331518	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_016591	GCC	2	6	331529	331534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1072	NC_016591	GA	3	6	331606	331611	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_016591	AAT	2	6	331612	331617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_016591	GTC	2	6	331727	331732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1075	NC_016591	ACAT	2	8	331746	331753	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1076	NC_016591	CTA	2	6	331784	331789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1077	NC_016591	TGT	2	6	333029	333034	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_016591	AGC	2	6	333042	333047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1079	NC_016591	GCG	2	6	333067	333072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1080	NC_016591	CGTC	2	8	333158	333165	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1081	NC_016591	GGC	2	6	333195	333200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1082	NC_016591	TGA	2	6	333206	333211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_016591	CG	3	6	333227	333232	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1084	NC_016591	TCGAA	2	10	333233	333242	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1085	NC_016591	CAC	2	6	333258	333263	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1086	NC_016591	TCG	2	6	333283	333288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1087	NC_016591	ACG	2	6	333312	333317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1088	NC_016591	CGGC	2	8	333347	333354	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1089	NC_016591	AAG	2	6	333665	333670	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_016591	ACG	2	6	333684	333689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1091	NC_016591	GTG	2	6	333698	333703	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_016591	CGTC	2	8	333764	333771	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1093	NC_016591	ACG	2	6	333779	333784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1094	NC_016591	CTCG	2	8	333820	333827	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1095	NC_016591	ATG	2	6	333915	333920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_016591	AGC	2	6	333928	333933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1097	NC_016591	TTCG	2	8	333977	333984	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1098	NC_016591	AC	3	6	334053	334058	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1099	NC_016591	CCG	2	6	334106	334111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1100	NC_016591	CGCTAC	2	12	334126	334137	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
1101	NC_016591	CTG	3	9	334140	334148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1102	NC_016591	CCT	2	6	334323	334328	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1103	NC_016591	ACA	2	6	334333	334338	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1104	NC_016591	ACT	2	6	334342	334347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1105	NC_016591	GTC	2	6	338588	338593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1106	NC_016591	CATC	2	8	338611	338618	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1107	NC_016591	ACC	2	6	338664	338669	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1108	NC_016591	AG	4	8	339653	339660	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_016591	GTT	2	6	339690	339695	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_016591	AATT	2	8	339787	339794	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_016591	CGT	2	6	339854	339859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1112	NC_016591	TC	4	8	339937	339944	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1113	NC_016591	CTT	2	6	339953	339958	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1114	NC_016591	GCC	2	6	339971	339976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1115	NC_016591	ATG	2	6	339999	340004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_016591	ATT	2	6	340096	340101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_016591	CAA	2	6	340104	340109	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1118	NC_016591	GAG	2	6	340177	340182	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_016591	CCG	2	6	341538	341543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1120	NC_016591	TCGC	2	8	341649	341656	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1121	NC_016591	GTCA	2	8	341657	341664	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1122	NC_016591	GGT	2	6	341778	341783	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_016591	GA	3	6	341881	341886	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_016591	GCCG	2	8	341893	341900	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1125	NC_016591	ACG	2	6	341953	341958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1126	NC_016591	CAA	2	6	341974	341979	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1127	NC_016591	T	6	6	342028	342033	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_016591	TGC	2	6	342039	342044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1129	NC_016591	GCTT	2	8	342098	342105	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1130	NC_016591	TGC	2	6	343230	343235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1131	NC_016591	GAA	2	6	343265	343270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_016591	TCT	2	6	343317	343322	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1133	NC_016591	CCA	2	6	343357	343362	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1134	NC_016591	CAG	2	6	343428	343433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1135	NC_016591	GTC	3	9	344822	344830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1136	NC_016591	ATG	2	6	344834	344839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1137	NC_016591	GCCT	2	8	344895	344902	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1138	NC_016591	TC	3	6	344920	344925	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1139	NC_016591	GTC	2	6	344937	344942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1140	NC_016591	TTC	2	6	344961	344966	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1141	NC_016591	GCC	2	6	344989	344994	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1142	NC_016591	CGT	2	6	346164	346169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1143	NC_016591	CCTG	2	8	347643	347650	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1144	NC_016591	CACGTG	2	12	347684	347695	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1145	NC_016591	GCC	2	6	350654	350659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1146	NC_016591	ACACCT	2	12	350727	350738	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
1147	NC_016591	GCG	2	6	350752	350757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1148	NC_016591	TGCGC	2	10	350773	350782	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
1149	NC_016591	TGCG	2	8	350844	350851	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1150	NC_016591	GA	3	6	352294	352299	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1151	NC_016591	AAC	2	6	352541	352546	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1152	NC_016591	GCA	2	6	352548	352553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1153	NC_016591	TCTT	2	8	352570	352577	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1154	NC_016591	TCA	2	6	352594	352599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1155	NC_016591	AC	3	6	352617	352622	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1156	NC_016591	GCT	2	6	352668	352673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1157	NC_016591	CGAC	2	8	353399	353406	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1158	NC_016591	TAA	2	6	353408	353413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1159	NC_016591	TGC	2	6	353460	353465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1160	NC_016591	ATA	2	6	353504	353509	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1161	NC_016591	TGCT	2	8	353521	353528	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1162	NC_016591	CG	3	6	353579	353584	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1163	NC_016591	CGAAT	2	10	353644	353653	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1164	NC_016591	AGA	2	6	353691	353696	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1165	NC_016591	TGT	2	6	353716	353721	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1166	NC_016591	GGCG	2	8	353722	353729	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1167	NC_016591	CAG	2	6	353786	353791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1168	NC_016591	A	6	6	355036	355041	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1169	NC_016591	CCG	2	6	355044	355049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1170	NC_016591	GCAAT	2	10	355113	355122	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1171	NC_016591	AGA	2	6	355168	355173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1172	NC_016591	GCG	2	6	355180	355185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1173	NC_016591	GC	3	6	355246	355251	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1174	NC_016591	ATTTT	2	10	355311	355320	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1175	NC_016591	AGT	2	6	355330	355335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1176	NC_016591	TTA	2	6	355357	355362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1177	NC_016591	ACC	2	6	355386	355391	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1178	NC_016591	GCA	2	6	356157	356162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

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