MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Blattabacterium sp. (Mastotermes darwiniensis) str. MADAR chromosome

Total Repeats: 1148

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016146	T	6	6	1252	1257	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016146	GAT	2	6	1263	1268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016146	TATT	2	8	7211	7218	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016146	ATA	2	6	7243	7248	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016146	AAAGT	2	10	10525	10534	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_016146	ATC	2	6	10611	10616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_016146	GAA	2	6	10666	10671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_016146	GA	3	6	10677	10682	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_016146	ATG	2	6	10718	10723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_016146	TCAT	2	8	10726	10733	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_016146	AGC	2	6	10740	10745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_016146	TAT	2	6	10770	10775	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016146	TTTA	2	8	10787	10794	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016146	ATAA	2	8	10832	10839	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_016146	A	6	6	10889	10894	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_016146	ATA	2	6	10901	10906	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_016146	A	8	8	10921	10928	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016146	TAAA	2	8	10929	10936	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016146	CAATT	2	10	10940	10949	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
20	NC_016146	ACAA	2	8	16515	16522	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_016146	TAT	2	6	16529	16534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016146	TTA	2	6	17063	17068	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016146	TAT	2	6	17069	17074	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016146	A	9	9	17081	17089	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_016146	TAAT	2	8	18676	18683	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016146	T	8	8	21564	21571	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016146	T	6	6	24089	24094	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016146	T	6	6	24121	24126	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_016146	TTTA	2	8	24156	24163	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_016146	T	6	6	24165	24170	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_016146	ATT	2	6	24171	24176	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016146	ATAA	2	8	24200	24207	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016146	AGATT	2	10	24227	24236	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016146	GTT	2	6	24258	24263	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016146	TAA	2	6	24268	24273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_016146	AAAC	2	8	24293	24300	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_016146	TTTAT	2	10	25655	25664	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_016146	T	6	6	27169	27174	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_016146	AAT	2	6	31157	31162	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016146	T	6	6	31165	31170	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016146	ATA	2	6	31179	31184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_016146	A	8	8	31211	31218	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_016146	TTC	2	6	31243	31248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_016146	T	7	7	31284	31290	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_016146	TGA	2	6	31304	31309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_016146	A	9	9	31309	31317	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_016146	TAT	2	6	31318	31323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_016146	T	6	6	31327	31332	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016146	TTTA	2	8	33359	33366	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_016146	TAA	2	6	33387	33392	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016146	A	6	6	33444	33449	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_016146	TA	3	6	34319	34324	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_016146	ATTTA	2	10	34326	34335	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_016146	TAAA	2	8	34389	34396	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_016146	ATGA	2	8	35437	35444	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_016146	A	6	6	35444	35449	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_016146	TACA	2	8	37353	37360	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_016146	ATT	2	6	37377	37382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_016146	T	6	6	37381	37386	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_016146	T	8	8	37395	37402	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_016146	TTTC	2	8	37619	37626	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_016146	TTA	2	6	37640	37645	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_016146	T	7	7	37650	37656	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_016146	TAA	2	6	37662	37667	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_016146	T	6	6	37691	37696	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_016146	AAT	2	6	39775	39780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_016146	TTTAT	2	10	40586	40595	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_016146	ATA	2	6	40596	40601	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_016146	A	6	6	40601	40606	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_016146	TAC	2	6	40607	40612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_016146	T	8	8	47221	47228	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_016146	T	6	6	47243	47248	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_016146	TAT	2	6	47252	47257	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_016146	A	6	6	52453	52458	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_016146	A	7	7	52483	52489	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_016146	A	6	6	52518	52523	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_016146	TTG	2	6	55172	55177	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_016146	T	6	6	55199	55204	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_016146	T	6	6	57309	57314	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_016146	ATT	2	6	57353	57358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_016146	A	7	7	57444	57450	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_016146	ATC	2	6	57477	57482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_016146	TTTGT	2	10	60508	60517	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_016146	T	6	6	60550	60555	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_016146	TGAA	2	8	61870	61877	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_016146	TGAAAA	2	12	61880	61891	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_016146	T	10	10	61903	61912	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_016146	T	7	7	61926	61932	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_016146	ATT	2	6	61953	61958	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_016146	A	6	6	64781	64786	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_016146	T	8	8	68987	68994	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_016146	T	6	6	69073	69078	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_016146	TTTG	2	8	69082	69089	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_016146	CATT	2	8	69127	69134	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
95	NC_016146	TAG	2	6	69162	69167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_016146	A	10	10	69220	69229	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_016146	A	6	6	69290	69295	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_016146	CTT	2	6	69329	69334	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_016146	A	6	6	69364	69369	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_016146	TTCT	2	8	69408	69415	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
101	NC_016146	ATT	2	6	69445	69450	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_016146	AATA	2	8	69454	69461	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_016146	T	7	7	69504	69510	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_016146	ATA	2	6	69524	69529	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_016146	ATT	2	6	69553	69558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_016146	TCT	3	9	69565	69573	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_016146	A	6	6	69600	69605	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_016146	AACA	2	8	69646	69653	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
109	NC_016146	A	7	7	69666	69672	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_016146	CAT	2	6	70586	70591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_016146	ATG	2	6	70594	70599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_016146	GTT	2	6	72359	72364	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_016146	GA	4	8	72392	72399	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_016146	GGA	2	6	72415	72420	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_016146	A	6	6	72420	72425	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_016146	TC	3	6	72468	72473	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_016146	TCTT	2	8	72476	72483	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
118	NC_016146	ATT	2	6	72494	72499	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_016146	A	8	8	74903	74910	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_016146	ATG	2	6	74921	74926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_016146	AAT	2	6	74930	74935	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_016146	ATGA	2	8	74955	74962	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_016146	CCAT	2	8	74996	75003	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_016146	ACT	2	6	75008	75013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_016146	TTTG	2	8	75015	75022	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_016146	A	6	6	77962	77967	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_016146	T	6	6	77974	77979	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_016146	T	6	6	77990	77995	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_016146	A	7	7	80949	80955	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_016146	TAG	2	6	83397	83402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_016146	ATATAA	2	12	83412	83423	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_016146	TTTTC	2	10	83433	83442	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
133	NC_016146	T	6	6	83452	83457	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_016146	ATT	2	6	83480	83485	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_016146	T	6	6	83484	83489	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_016146	TGAA	2	8	83503	83510	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_016146	GAAG	2	8	83525	83532	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_016146	A	6	6	89598	89603	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_016146	T	7	7	92115	92121	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_016146	TAA	2	6	92136	92141	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_016146	A	6	6	92163	92168	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_016146	T	6	6	94830	94835	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_016146	TTTC	2	8	94848	94855	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
144	NC_016146	ATA	2	6	94866	94871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_016146	A	8	8	94871	94878	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_016146	TAC	2	6	94904	94909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_016146	ATTT	2	8	98042	98049	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_016146	CAT	2	6	98058	98063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_016146	T	6	6	99271	99276	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_016146	GAC	2	6	99282	99287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
151	NC_016146	CCA	2	6	99349	99354	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
152	NC_016146	CTT	2	6	99359	99364	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
153	NC_016146	T	7	7	99415	99421	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_016146	TCT	2	6	99452	99457	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
155	NC_016146	TTGCTT	2	12	99528	99539	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
156	NC_016146	TCT	2	6	99542	99547	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
157	NC_016146	A	6	6	99597	99602	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_016146	T	6	6	99669	99674	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_016146	TTC	2	6	99800	99805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
160	NC_016146	TAGGGA	2	12	99858	99869	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
161	NC_016146	ATT	2	6	99881	99886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_016146	TA	3	6	99933	99938	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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182	NC_016146	A	8	8	100437	100444	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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185	NC_016146	TTA	2	6	100481	100486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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187	NC_016146	A	9	9	101923	101931	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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280	NC_016146	A	8	8	162933	162940	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
281	NC_016146	T	6	6	162941	162946	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
282	NC_016146	TAA	2	6	162965	162970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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291	NC_016146	A	13	13	175730	175742	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
292	NC_016146	GTT	2	6	175768	175773	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
293	NC_016146	TTACA	2	10	176408	176417	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
294	NC_016146	ATT	2	6	176429	176434	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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296	NC_016146	T	7	7	176449	176455	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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