MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Blattabacterium sp. (Mastotermes darwiniensis) str. MADAR chromosome

Total Repeats: 1148

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_016146	AAC	2	6	318628	318633	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
502	NC_016146	GGT	2	6	318641	318646	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
503	NC_016146	TATT	2	8	318647	318654	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_016146	GCA	2	6	318701	318706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
505	NC_016146	AGA	2	6	318730	318735	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
506	NC_016146	T	6	6	318740	318745	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_016146	GTT	2	6	318825	318830	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
508	NC_016146	GTAT	2	8	318852	318859	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
509	NC_016146	A	6	6	318871	318876	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_016146	TGG	2	6	318904	318909	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
511	NC_016146	A	6	6	318958	318963	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
512	NC_016146	ATT	2	6	318989	318994	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
513	NC_016146	TTA	2	6	318999	319004	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
514	NC_016146	ATT	2	6	319022	319027	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_016146	AGCA	2	8	319031	319038	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
516	NC_016146	TATT	2	8	319066	319073	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_016146	TCA	2	6	319156	319161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
518	NC_016146	AGAA	2	8	319216	319223	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
519	NC_016146	T	7	7	319275	319281	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_016146	A	6	6	319319	319324	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
521	NC_016146	CAT	2	6	319340	319345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
522	NC_016146	TGT	2	6	319400	319405	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
523	NC_016146	TTC	2	6	319408	319413	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
524	NC_016146	TA	3	6	319422	319427	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_016146	GAA	2	6	319441	319446	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
526	NC_016146	T	6	6	319458	319463	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
527	NC_016146	TATTT	2	10	319468	319477	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
528	NC_016146	TAA	2	6	319504	319509	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_016146	AGA	2	6	319531	319536	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
530	NC_016146	TTTAGG	2	12	319567	319578	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
531	NC_016146	ATA	2	6	319653	319658	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_016146	CTA	2	6	319692	319697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
533	NC_016146	AGA	2	6	319748	319753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
534	NC_016146	ATGGCT	2	12	319766	319777	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
535	NC_016146	AGG	2	6	319804	319809	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
536	NC_016146	GCT	2	6	319835	319840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
537	NC_016146	AT	4	8	319842	319849	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_016146	GAT	3	9	319853	319861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
539	NC_016146	A	6	6	319899	319904	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
540	NC_016146	A	6	6	319944	319949	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_016146	A	7	7	320001	320007	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_016146	CAAG	2	8	320054	320061	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
543	NC_016146	AT	3	6	320074	320079	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_016146	TCTT	2	8	320101	320108	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
545	NC_016146	TCA	2	6	320110	320115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
546	NC_016146	TAT	3	9	320183	320191	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
547	NC_016146	TTC	2	6	320205	320210	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
548	NC_016146	GGC	2	6	320249	320254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
549	NC_016146	ACC	2	6	320346	320351	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
550	NC_016146	AAC	2	6	320365	320370	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
551	NC_016146	AC	3	6	320369	320374	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
552	NC_016146	GAA	2	6	320377	320382	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
553	NC_016146	ATA	2	6	320387	320392	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_016146	TAC	2	6	320411	320416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
555	NC_016146	GTC	2	6	320462	320467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
556	NC_016146	AAG	2	6	320483	320488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
557	NC_016146	ATAG	2	8	320653	320660	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
558	NC_016146	ACG	2	6	320676	320681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
559	NC_016146	CTT	2	6	320737	320742	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
560	NC_016146	ACC	2	6	320871	320876	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
561	NC_016146	AC	3	6	320953	320958	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
562	NC_016146	ACC	2	6	321015	321020	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
563	NC_016146	CAC	2	6	321035	321040	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
564	NC_016146	A	7	7	321082	321088	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
565	NC_016146	GGT	2	6	321090	321095	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
566	NC_016146	ATA	2	6	321126	321131	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_016146	TTAA	2	8	321164	321171	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NC_016146	GCC	2	6	321360	321365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
569	NC_016146	CAT	2	6	321451	321456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
570	NC_016146	GTC	2	6	321494	321499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
571	NC_016146	AAGG	2	8	321526	321533	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
572	NC_016146	TC	3	6	321607	321612	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
573	NC_016146	TA	3	6	321753	321758	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
574	NC_016146	C	6	6	321820	321825	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
575	NC_016146	AGTA	2	8	321838	321845	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
576	NC_016146	TC	3	6	321961	321966	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
577	NC_016146	ACA	2	6	322023	322028	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
578	NC_016146	AT	3	6	322087	322092	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
579	NC_016146	ATT	2	6	322103	322108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
580	NC_016146	GCT	2	6	322162	322167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
581	NC_016146	CTGT	2	8	322186	322193	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
582	NC_016146	TTGT	2	8	322205	322212	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
583	NC_016146	AT	3	6	322221	322226	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_016146	TGA	2	6	322243	322248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
585	NC_016146	GTT	2	6	322254	322259	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
586	NC_016146	ATA	2	6	322309	322314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
587	NC_016146	TGA	2	6	322347	322352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
588	NC_016146	TAT	2	6	322386	322391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
589	NC_016146	TGC	2	6	322401	322406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
590	NC_016146	TCC	2	6	322509	322514	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
591	NC_016146	TTC	2	6	322574	322579	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
592	NC_016146	ACT	2	6	322629	322634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
593	NC_016146	CGT	2	6	322682	322687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
594	NC_016146	GAG	2	6	322804	322809	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
595	NC_016146	TGAT	2	8	322925	322932	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
596	NC_016146	CTA	2	6	322947	322952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
597	NC_016146	T	6	6	322967	322972	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
598	NC_016146	TCGC	2	8	323028	323035	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
599	NC_016146	ACT	2	6	323037	323042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
600	NC_016146	TTTTC	2	10	323059	323068	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
601	NC_016146	A	6	6	323115	323120	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
602	NC_016146	CTT	2	6	323220	323225	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
603	NC_016146	CCA	2	6	323247	323252	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
604	NC_016146	CTTA	2	8	323259	323266	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
605	NC_016146	TCTT	3	12	323273	323284	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
606	NC_016146	TATG	2	8	323286	323293	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
607	NC_016146	A	7	7	323306	323312	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
608	NC_016146	CCT	2	6	323340	323345	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
609	NC_016146	CG	3	6	323406	323411	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
610	NC_016146	TAA	2	6	323509	323514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_016146	A	6	6	323516	323521	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
612	NC_016146	A	7	7	323528	323534	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
613	NC_016146	GT	3	6	323667	323672	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
614	NC_016146	CAT	2	6	323698	323703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
615	NC_016146	GT	3	6	323837	323842	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
616	NC_016146	TGA	2	6	323863	323868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
617	NC_016146	CGT	2	6	323874	323879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
618	NC_016146	GAC	2	6	324002	324007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
619	NC_016146	GCA	2	6	324014	324019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
620	NC_016146	GTA	2	6	324062	324067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
621	NC_016146	ATC	2	6	324097	324102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
622	NC_016146	CAA	2	6	324226	324231	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
623	NC_016146	ATC	2	6	324238	324243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
624	NC_016146	TG	3	6	324348	324353	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
625	NC_016146	CA	3	6	324379	324384	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
626	NC_016146	ACT	2	6	324457	324462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
627	NC_016146	TCC	2	6	324520	324525	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
628	NC_016146	GCT	2	6	324537	324542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
629	NC_016146	TTC	2	6	324644	324649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
630	NC_016146	TCC	2	6	324678	324683	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
631	NC_016146	CTG	2	6	324702	324707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
632	NC_016146	AACT	2	8	324806	324813	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
633	NC_016146	TCT	2	6	324911	324916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
634	NC_016146	AGGT	2	8	324923	324930	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
635	NC_016146	TCT	2	6	324972	324977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
636	NC_016146	AGA	2	6	324981	324986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
637	NC_016146	CGC	2	6	325022	325027	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
638	NC_016146	ATA	2	6	325069	325074	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
639	NC_016146	TTA	3	9	325092	325100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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