MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bacillus subtilis subsp. spizizenii TU-B-10 chromosome

Total Repeats: 13432

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016047	T	6	6	13	18	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016047	ACA	2	6	39	44	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_016047	T	6	6	75	80	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016047	TAT	2	6	144	149	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016047	GATT	2	8	219	226	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_016047	CA	3	6	228	233	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_016047	CTA	2	6	287	292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_016047	TAT	2	6	293	298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_016047	T	7	7	345	351	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_016047	AGG	2	6	390	395	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_016047	CTA	2	6	1872	1877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_016047	CTA	2	6	1884	1889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_016047	T	7	7	1890	1896	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016047	AT	5	10	1901	1910	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_016047	AGG	2	6	1927	1932	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_016047	CTG	2	6	3085	3090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_016047	TTTCCC	2	12	3137	3148	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_016047	T	9	9	3156	3164	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016047	T	6	6	4817	4822	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016047	AT	3	6	4830	4835	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016047	T	6	6	6988	6993	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016047	T	7	7	9487	9493	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016047	TGT	2	6	9540	9545	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016047	T	6	6	9579	9584	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_016047	A	6	6	9585	9590	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016047	AGT	2	6	9625	9630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016047	GAG	2	6	9639	9644	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016047	CA	3	6	9645	9650	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_016047	AGTC	2	8	9726	9733	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_016047	ACG	2	6	9748	9753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_016047	CA	3	6	9759	9764	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_016047	GGC	2	6	9844	9849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_016047	GCG	2	6	9904	9909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_016047	CCTG	2	8	9934	9941	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
35	NC_016047	GCA	2	6	10163	10168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_016047	CGC	2	6	10210	10215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_016047	GTGA	2	8	10216	10223	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_016047	TGT	2	6	10249	10254	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_016047	GAA	2	6	10259	10264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016047	CAG	2	6	10332	10337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_016047	ATT	2	6	10373	10378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_016047	AGA	2	6	10473	10478	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_016047	GGA	2	6	10523	10528	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016047	CT	3	6	10548	10553	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_016047	GAG	2	6	10571	10576	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_016047	TGC	2	6	10668	10673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_016047	GAA	2	6	10787	10792	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_016047	GGT	2	6	10861	10866	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016047	GTC	2	6	10875	10880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_016047	TCGTG	2	10	10884	10893	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
51	NC_016047	GGA	2	6	10987	10992	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_016047	ATC	2	6	11011	11016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_016047	AC	3	6	11038	11043	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_016047	AC	3	6	11207	11212	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_016047	CAC	2	6	11222	11227	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_016047	AGCC	2	8	11270	11277	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
57	NC_016047	GAT	2	6	11293	11298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_016047	CCT	2	6	11349	11354	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_016047	GGT	2	6	11507	11512	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_016047	CCA	2	6	11529	11534	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_016047	AAT	2	6	11540	11545	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_016047	AGG	2	6	11586	11591	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_016047	CCA	2	6	11616	11621	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_016047	GGACG	2	10	11756	11765	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
65	NC_016047	AAGC	2	8	11792	11799	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
66	NC_016047	CAC	2	6	11831	11836	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_016047	GGA	2	6	11916	11921	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_016047	GCG	2	6	11950	11955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_016047	TC	3	6	12100	12105	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_016047	CGG	2	6	12124	12129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_016047	GGA	2	6	12156	12161	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_016047	AGT	2	6	12277	12282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_016047	AGA	2	6	12358	12363	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_016047	CACG	2	8	12487	12494	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
75	NC_016047	TC	3	6	12560	12565	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_016047	AGC	2	6	12818	12823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_016047	TTC	2	6	12916	12921	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_016047	TGG	2	6	12973	12978	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_016047	ACA	2	6	13123	13128	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_016047	ACC	2	6	13144	13149	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_016047	G	6	6	13169	13174	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
82	NC_016047	AGG	2	6	13179	13184	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_016047	GCGA	2	8	13274	13281	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
84	NC_016047	TAG	2	6	13286	13291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_016047	GAG	2	6	13373	13378	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_016047	GA	3	6	13396	13401	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_016047	GA	3	6	13475	13480	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_016047	CGG	2	6	13633	13638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_016047	GA	3	6	13731	13736	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_016047	TAGG	2	8	13849	13856	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_016047	TAC	2	6	13903	13908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_016047	CGC	2	6	13933	13938	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_016047	CGGG	2	8	13945	13952	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
94	NC_016047	CCT	2	6	13991	13996	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_016047	GGT	2	6	14127	14132	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_016047	CGT	2	6	14322	14327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_016047	GAG	2	6	14371	14376	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_016047	GTT	2	6	14425	14430	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_016047	C	6	6	14498	14503	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
100	NC_016047	GAT	2	6	14549	14554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_016047	ATCG	2	8	14610	14617	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
102	NC_016047	ATG	2	6	14639	14644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_016047	GA	3	6	14666	14671	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_016047	CT	3	6	14676	14681	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_016047	TTTG	2	8	14762	14769	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_016047	CGC	2	6	14871	14876	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_016047	CAAG	2	8	14877	14884	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
108	NC_016047	T	6	6	14910	14915	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_016047	ATA	2	6	15956	15961	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_016047	T	8	8	17505	17512	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_016047	TGT	2	6	17538	17543	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_016047	GAA	2	6	17579	17584	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_016047	ATGT	2	8	18958	18965	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_016047	A	6	6	18991	18996	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_016047	AATAA	2	10	19040	19049	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_016047	TA	3	6	19050	19055	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_016047	ATT	2	6	19065	19070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_016047	GCT	2	6	20033	20038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_016047	TAG	2	6	20705	20710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_016047	CT	3	6	20716	20721	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_016047	AG	3	6	20727	20732	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_016047	TGGT	2	8	20737	20744	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_016047	ATCC	2	8	20771	20778	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_016047	A	6	6	22300	22305	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_016047	GGA	2	6	22365	22370	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_016047	TCC	2	6	22448	22453	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_016047	AT	3	6	22488	22493	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_016047	T	6	6	22531	22536	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_016047	TCC	2	6	23848	23853	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_016047	A	7	7	23922	23928	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_016047	AGC	3	9	23981	23989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_016047	GGAA	2	8	24000	24007	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_016047	GAA	2	6	24133	24138	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_016047	CTG	2	6	24237	24242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_016047	CGC	2	6	24372	24377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_016047	AAC	2	6	24403	24408	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_016047	CTG	2	6	24463	24468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_016047	TCT	2	6	24619	24624	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_016047	TTCA	2	8	24640	24647	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
140	NC_016047	TCT	2	6	24652	24657	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_016047	TCG	2	6	24668	24673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_016047	ATC	3	9	24731	24739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_016047	CTT	2	6	24767	24772	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_016047	GCC	2	6	24866	24871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
145	NC_016047	GCT	2	6	25019	25024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_016047	CCG	2	6	25036	25041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
147	NC_016047	GATG	2	8	25045	25052	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
148	NC_016047	TTG	2	6	25066	25071	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
149	NC_016047	ACA	2	6	25118	25123	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_016047	GTT	2	6	25172	25177	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
151	NC_016047	CAC	2	6	25219	25224	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
152	NC_016047	TGAA	2	8	25232	25239	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
153	NC_016047	CCT	2	6	25245	25250	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
154	NC_016047	GAAA	2	8	25272	25279	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
155	NC_016047	A	6	6	25896	25901	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_016047	AG	3	6	25910	25915	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
157	NC_016047	TATG	2	8	26445	26452	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
158	NC_016047	CAT	2	6	26453	26458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
159	NC_016047	ATTT	2	8	26483	26490	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_016047	TAAG	2	8	26589	26596	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
161	NC_016047	GGAA	2	8	26651	26658	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
162	NC_016047	GCA	2	6	26659	26664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
163	NC_016047	ATCA	2	8	26761	26768	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
164	NC_016047	T	6	6	26802	26807	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
165	NC_016047	ATG	2	6	26859	26864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
166	NC_016047	GGA	2	6	26871	26876	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
167	NC_016047	AG	3	6	28588	28593	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
168	NC_016047	TCT	2	6	29797	29802	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
169	NC_016047	CAAG	2	8	29821	29828	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
170	NC_016047	TAA	2	6	30129	30134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
171	NC_016047	TGA	2	6	30163	30168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
172	NC_016047	A	6	6	30197	30202	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
173	NC_016047	GCG	2	6	30216	30221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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176	NC_016047	CGC	2	6	30382	30387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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178	NC_016047	GCG	2	6	30515	30520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
179	NC_016047	CCTG	2	8	30545	30552	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
180	NC_016047	GCA	2	6	30774	30779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
181	NC_016047	CGC	2	6	30821	30826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
182	NC_016047	GTGA	2	8	30827	30834	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
183	NC_016047	TGT	2	6	30860	30865	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
184	NC_016047	GAA	2	6	30870	30875	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
185	NC_016047	CAG	2	6	30943	30948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
186	NC_016047	ATT	2	6	30984	30989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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188	NC_016047	GGA	2	6	31134	31139	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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199	NC_016047	AC	3	6	31818	31823	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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275	NC_016047	ACT	2	6	45372	45377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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279	NC_016047	T	6	6	45459	45464	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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281	NC_016047	T	7	7	45507	45513	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
282	NC_016047	ATT	2	6	45540	45545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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284	NC_016047	ATAAAT	2	12	45609	45620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
285	NC_016047	AAT	3	9	45618	45626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
286	NC_016047	AT	3	6	45628	45633	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
287	NC_016047	CGC	2	6	45647	45652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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290	NC_016047	TCT	2	6	48615	48620	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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434	NC_016047	TCA	2	6	71939	71944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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