MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bacillus coagulans 36D1 chromosome

Total Repeats: 14741

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_016023	CGTG	2	8	2316496	2316503	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10002	NC_016023	AAAG	2	8	2316884	2316891	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
10003	NC_016023	CCGG	2	8	2316915	2316922	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10004	NC_016023	TTG	2	6	2316924	2316929	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10005	NC_016023	GAGG	2	8	2317070	2317077	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
10006	NC_016023	AGC	2	6	2317111	2317116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10007	NC_016023	TGC	2	6	2317450	2317455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10008	NC_016023	TCC	2	6	2317475	2317480	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10009	NC_016023	ATAA	2	8	2317493	2317500	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10010	NC_016023	T	6	6	2317508	2317513	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10011	NC_016023	CCT	2	6	2317514	2317519	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10012	NC_016023	GGA	2	6	2317630	2317635	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10013	NC_016023	T	6	6	2318950	2318955	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10014	NC_016023	GAT	2	6	2318963	2318968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10015	NC_016023	ATC	2	6	2319659	2319664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10016	NC_016023	C	6	6	2319800	2319805	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10017	NC_016023	T	6	6	2319848	2319853	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10018	NC_016023	GGCG	2	8	2319857	2319864	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
10019	NC_016023	GGGA	2	8	2319884	2319891	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
10020	NC_016023	GA	3	6	2319907	2319912	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10021	NC_016023	CT	3	6	2319925	2319930	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10022	NC_016023	GA	3	6	2319969	2319974	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10023	NC_016023	TGT	2	6	2320017	2320022	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10024	NC_016023	TGCCG	2	10	2320025	2320034	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
10025	NC_016023	GCA	3	9	2320120	2320128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10027	NC_016023	A	6	6	2322863	2322868	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10028	NC_016023	A	6	6	2322889	2322894	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10029	NC_016023	ATC	2	6	2322903	2322908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10030	NC_016023	GAA	2	6	2322913	2322918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10031	NC_016023	AAG	2	6	2322941	2322946	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10032	NC_016023	TGC	2	6	2322960	2322965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10033	NC_016023	ATG	2	6	2322982	2322987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10034	NC_016023	TCA	2	6	2323159	2323164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10035	NC_016023	GA	3	6	2323168	2323173	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10036	NC_016023	T	6	6	2323186	2323191	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10037	NC_016023	A	7	7	2323314	2323320	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10038	NC_016023	ATA	2	6	2323372	2323377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10039	NC_016023	T	6	6	2323452	2323457	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10040	NC_016023	CTC	2	6	2324767	2324772	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10041	NC_016023	ATTGGC	2	12	2324773	2324784	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
10042	NC_016023	TTC	2	6	2324816	2324821	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10043	NC_016023	CGG	2	6	2324846	2324851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10044	NC_016023	AGG	2	6	2325311	2325316	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10045	NC_016023	GT	3	6	2326173	2326178	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10046	NC_016023	A	6	6	2326200	2326205	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10047	NC_016023	CTT	2	6	2326228	2326233	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10048	NC_016023	T	6	6	2326232	2326237	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10049	NC_016023	CGG	2	6	2326270	2326275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10050	NC_016023	TTTG	2	8	2326289	2326296	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
10051	NC_016023	T	7	7	2326863	2326869	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10052	NC_016023	GCAA	2	8	2326898	2326905	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10053	NC_016023	CTT	2	6	2326964	2326969	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10054	NC_016023	TCC	2	6	2327917	2327922	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10055	NC_016023	TAT	2	6	2327945	2327950	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10056	NC_016023	AT	3	6	2327949	2327954	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10057	NC_016023	AAT	2	6	2327967	2327972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10058	NC_016023	AT	3	6	2327971	2327976	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10059	NC_016023	GTG	2	6	2327994	2327999	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10060	NC_016023	TAGA	2	8	2328007	2328014	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10061	NC_016023	TAA	2	6	2328054	2328059	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10062	NC_016023	GCG	2	6	2329802	2329807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10063	NC_016023	GCT	2	6	2329812	2329817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10064	NC_016023	AGAA	2	8	2329859	2329866	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
10065	NC_016023	TTC	2	6	2330672	2330677	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10066	NC_016023	CTTT	2	8	2331103	2331110	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
10067	NC_016023	A	7	7	2331157	2331163	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10068	NC_016023	ATC	2	6	2331178	2331183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10069	NC_016023	AG	5	10	2331211	2331220	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10070	NC_016023	GC	3	6	2332674	2332679	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10071	NC_016023	GA	3	6	2332716	2332721	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10072	NC_016023	CGAG	2	8	2332737	2332744	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10073	NC_016023	GCCG	2	8	2332752	2332759	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10074	NC_016023	CG	3	6	2332782	2332787	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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10084	NC_016023	TAA	2	6	2334069	2334074	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10085	NC_016023	AAACG	2	10	2334117	2334126	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
10086	NC_016023	GGC	2	6	2334195	2334200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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10089	NC_016023	CCTG	2	8	2334287	2334294	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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10099	NC_016023	ATT	2	6	2334726	2334731	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10100	NC_016023	GC	4	8	2334741	2334748	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10101	NC_016023	GGC	2	6	2334750	2334755	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10102	NC_016023	AGA	2	6	2334826	2334831	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10104	NC_016023	GGC	2	6	2334896	2334901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10105	NC_016023	TGC	2	6	2335021	2335026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10108	NC_016023	GTC	2	6	2335230	2335235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10109	NC_016023	TCGTG	2	10	2335239	2335248	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
10110	NC_016023	GGA	2	6	2335342	2335347	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10111	NC_016023	ATC	2	6	2335366	2335371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10112	NC_016023	AC	3	6	2335393	2335398	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10113	NC_016023	ATGG	2	8	2335407	2335414	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
10114	NC_016023	AC	3	6	2335562	2335567	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
10115	NC_016023	CAC	2	6	2335577	2335582	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10116	NC_016023	AGCC	2	8	2335625	2335632	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10117	NC_016023	GAT	2	6	2335648	2335653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10119	NC_016023	CGTTTT	2	12	2335909	2335920	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
10120	NC_016023	AAAC	2	8	2335977	2335984	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
10121	NC_016023	CCTG	2	8	2336182	2336189	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10122	NC_016023	GGA	2	6	2336242	2336247	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10123	NC_016023	GCG	2	6	2336276	2336281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10124	NC_016023	TC	3	6	2336426	2336431	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10125	NC_016023	CGG	2	6	2336450	2336455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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10127	NC_016023	GGA	2	6	2336482	2336487	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10128	NC_016023	GGGAG	2	10	2336563	2336572	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
10129	NC_016023	AGT	2	6	2336603	2336608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10130	NC_016023	GAA	2	6	2336685	2336690	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10131	NC_016023	CACG	2	8	2336813	2336820	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
10132	NC_016023	TC	3	6	2336886	2336891	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10133	NC_016023	AGC	2	6	2337144	2337149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10134	NC_016023	CAT	2	6	2337150	2337155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10135	NC_016023	CCGGA	2	10	2337289	2337298	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
10136	NC_016023	AAG	2	6	2337346	2337351	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10137	NC_016023	ACA	2	6	2337454	2337459	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10138	NC_016023	G	6	6	2337500	2337505	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
10139	NC_016023	AGG	2	6	2337510	2337515	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10140	NC_016023	GAG	2	6	2337704	2337709	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10141	NC_016023	GA	3	6	2337727	2337732	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10142	NC_016023	CTGAA	2	10	2337944	2337953	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
10143	NC_016023	CGG	2	6	2337965	2337970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10144	NC_016023	GA	3	6	2338063	2338068	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10145	NC_016023	TAGG	2	8	2338181	2338188	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
10146	NC_016023	CGG	2	6	2338215	2338220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10147	NC_016023	TAC	2	6	2338235	2338240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10148	NC_016023	CAGG	2	8	2338295	2338302	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10149	NC_016023	CCT	2	6	2338323	2338328	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10150	NC_016023	GGT	2	6	2338459	2338464	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10151	NC_016023	CGT	2	6	2338654	2338659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10152	NC_016023	GAG	2	6	2338703	2338708	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10153	NC_016023	C	6	6	2338830	2338835	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
10154	NC_016023	GAT	2	6	2338881	2338886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10155	NC_016023	GCG	2	6	2338913	2338918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10156	NC_016023	ATCG	2	8	2338942	2338949	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10157	NC_016023	GCC	2	6	2338977	2338982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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10161	NC_016023	GGC	2	6	2339386	2339391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10162	NC_016023	CGG	2	6	2339480	2339485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10163	NC_016023	TCA	2	6	2339512	2339517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10164	NC_016023	GGA	2	6	2339526	2339531	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10165	NC_016023	CGG	2	6	2339573	2339578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10166	NC_016023	TCC	2	6	2339592	2339597	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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10170	NC_016023	CCAT	2	8	2339770	2339777	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
10171	NC_016023	CGG	2	6	2339838	2339843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10172	NC_016023	CCA	2	6	2339861	2339866	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10173	NC_016023	CAC	2	6	2339942	2339947	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10174	NC_016023	CGG	2	6	2339980	2339985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10175	NC_016023	CGG	2	6	2340011	2340016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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10178	NC_016023	CCA	2	6	2340188	2340193	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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10185	NC_016023	ATTAT	2	10	2340603	2340612	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10191	NC_016023	CAA	2	6	2341328	2341333	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10194	NC_016023	TTTTG	2	10	2341541	2341550	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
10195	NC_016023	ATCT	2	8	2341573	2341580	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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10197	NC_016023	CA	3	6	2342657	2342662	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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10199	NC_016023	AACA	2	8	2342712	2342719	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
10200	NC_016023	TTTG	2	8	2342722	2342729	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
10201	NC_016023	ACC	2	6	2342818	2342823	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10202	NC_016023	T	6	6	2342886	2342891	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10203	NC_016023	GAA	2	6	2342901	2342906	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10204	NC_016023	CT	3	6	2342911	2342916	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10205	NC_016023	GCT	2	6	2342972	2342977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10208	NC_016023	TAAAA	2	10	2343004	2343013	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
10209	NC_016023	TAA	2	6	2343023	2343028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10212	NC_016023	AGA	2	6	2344406	2344411	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10217	NC_016023	GAG	2	6	2344613	2344618	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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10222	NC_016023	GGT	2	6	2345696	2345701	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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10225	NC_016023	CAT	2	6	2345824	2345829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10226	NC_016023	CTT	2	6	2345872	2345877	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10227	NC_016023	CCGT	2	8	2345943	2345950	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10228	NC_016023	T	7	7	2345991	2345997	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10229	NC_016023	A	6	6	2346005	2346010	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10230	NC_016023	A	6	6	2346038	2346043	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10231	NC_016023	A	6	6	2346133	2346138	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10232	NC_016023	AAAG	2	8	2347613	2347620	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
10233	NC_016023	AAG	2	6	2347656	2347661	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10234	NC_016023	ATC	2	6	2348138	2348143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10235	NC_016023	TGAA	2	8	2348157	2348164	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10236	NC_016023	AG	4	8	2348170	2348177	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10237	NC_016023	TA	3	6	2349682	2349687	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10238	NC_016023	ACT	2	6	2349706	2349711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10239	NC_016023	A	6	6	2350113	2350118	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10240	NC_016023	GAA	2	6	2350124	2350129	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10241	NC_016023	CAG	2	6	2350153	2350158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10242	NC_016023	TCT	2	6	2351222	2351227	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10243	NC_016023	T	6	6	2351253	2351258	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10244	NC_016023	A	6	6	2351265	2351270	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10245	NC_016023	TGA	2	6	2351287	2351292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10246	NC_016023	GTC	2	6	2351412	2351417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10247	NC_016023	T	7	7	2351425	2351431	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10248	NC_016023	AT	3	6	2351630	2351635	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10249	NC_016023	GATT	2	8	2351680	2351687	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10250	NC_016023	TGTTT	2	10	2351697	2351706	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
10251	NC_016023	CGG	2	6	2351708	2351713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10252	NC_016023	ATTTT	2	10	2351747	2351756	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
10253	NC_016023	GCT	2	6	2351758	2351763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10254	NC_016023	TCTTT	2	10	2351779	2351788	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
10255	NC_016023	T	6	6	2351842	2351847	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10256	NC_016023	ACAG	2	8	2351864	2351871	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10257	NC_016023	GAA	2	6	2351915	2351920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10258	NC_016023	ATG	2	6	2351924	2351929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10259	NC_016023	AACA	2	8	2351980	2351987	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
10260	NC_016023	ATT	2	6	2352034	2352039	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10261	NC_016023	AT	3	6	2352046	2352051	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10394	NC_016023	T	6	6	2378243	2378248	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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