MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Borrelia bissettii DN127 chromosome

Total Repeats: 1878

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015921	TA	3	6	44	49	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015921	TAAT	2	8	51	58	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015921	AT	3	6	57	62	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015921	CTA	2	6	71	76	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_015921	AC	3	6	664	669	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_015921	T	7	7	680	686	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015921	ACAAG	2	10	698	707	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
8	NC_015921	TA	3	6	712	717	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015921	AAT	2	6	766	771	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015921	AAAACC	2	12	3264	3275	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_015921	TTA	2	6	3289	3294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015921	A	6	6	3303	3308	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015921	T	6	6	3313	3318	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015921	TAA	2	6	3324	3329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015921	ATT	2	6	3343	3348	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015921	AAT	2	6	3365	3370	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015921	GAA	2	6	3390	3395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015921	AAT	2	6	5250	5255	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015921	T	7	7	7411	7417	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015921	GCT	2	6	7418	7423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_015921	AAGT	2	8	7440	7447	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015921	A	6	6	8319	8324	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015921	AAT	2	6	8337	8342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015921	TTAT	2	8	8355	8362	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015921	AT	3	6	8361	8366	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015921	TAT	2	6	8371	8376	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015921	TAA	2	6	8389	8394	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015921	ATA	2	6	15657	15662	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015921	A	6	6	15662	15667	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015921	A	9	9	15676	15684	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015921	ATA	2	6	15740	15745	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015921	A	8	8	15748	15755	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015921	A	7	7	15757	15763	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015921	T	8	8	15777	15784	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015921	TCC	2	6	19989	19994	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_015921	CTTAA	3	15	20013	20027	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
37	NC_015921	AAT	2	6	20035	20040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015921	T	6	6	22132	22137	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015921	A	6	6	22144	22149	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015921	CAA	2	6	22151	22156	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_015921	AATTA	2	10	22753	22762	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015921	A	6	6	22811	22816	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015921	AAC	2	6	25681	25686	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_015921	ATTT	2	8	25708	25715	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015921	TAA	2	6	25723	25728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015921	ATA	2	6	25735	25740	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015921	TAA	2	6	31548	31553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015921	A	6	6	32099	32104	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015921	TTA	2	6	32110	32115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015921	A	6	6	32150	32155	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015921	T	6	6	32158	32163	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015921	TAAAT	2	10	35863	35872	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015921	AAC	2	6	39679	39684	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_015921	TAA	2	6	39688	39693	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015921	TAA	2	6	39712	39717	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015921	ATT	2	6	39747	39752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015921	A	6	6	39798	39803	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015921	TC	3	6	39831	39836	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_015921	A	6	6	39842	39847	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015921	TAT	2	6	40755	40760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015921	ATTT	2	8	40771	40778	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015921	AATTAA	2	12	45406	45417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015921	TAA	2	6	45453	45458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015921	A	7	7	45472	45478	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015921	ATA	2	6	46043	46048	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015921	TCC	2	6	46427	46432	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_015921	AATT	2	8	46467	46474	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015921	A	10	10	46485	46494	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015921	T	8	8	46543	46550	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015921	ATT	2	6	46561	46566	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015921	ATG	2	6	46614	46619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015921	AAATA	2	10	46721	46730	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015921	TTA	2	6	46803	46808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015921	ACC	2	6	46836	46841	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_015921	AAGC	2	8	46893	46900	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
76	NC_015921	CAA	2	6	46943	46948	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_015921	ACA	2	6	47126	47131	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_015921	TAC	2	6	47133	47138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_015921	A	6	6	47147	47152	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015921	AATT	2	8	47882	47889	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015921	AAATT	2	10	49267	49276	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015921	ATA	2	6	49283	49288	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015921	AT	3	6	49302	49307	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015921	TA	3	6	49329	49334	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015921	TAA	2	6	50018	50023	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015921	TTA	2	6	52419	52424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015921	TCC	2	6	53451	53456	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_015921	T	6	6	53459	53464	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015921	ATT	2	6	53483	53488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015921	TAA	2	6	53500	53505	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015921	AAT	2	6	56748	56753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015921	AT	3	6	56756	56761	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015921	AATTA	2	10	56791	56800	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015921	TTTTA	2	10	56801	56810	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015921	C	6	6	57186	57191	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
96	NC_015921	TAA	3	9	57225	57233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015921	T	7	7	57976	57982	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015921	ATT	2	6	58970	58975	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015921	ATTT	2	8	59005	59012	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015921	A	6	6	59033	59038	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015921	ATT	3	9	59057	59065	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015921	AT	3	6	59073	59078	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015921	CAAA	2	8	60534	60541	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_015921	A	6	6	60539	60544	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015921	ATT	2	6	61211	61216	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015921	CTA	2	6	63035	63040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_015921	AAT	2	6	63055	63060	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015921	A	8	8	63070	63077	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015921	T	6	6	63078	63083	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015921	AGG	2	6	65259	65264	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015921	A	6	6	65740	65745	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015921	GAAA	2	8	70122	70129	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015921	AAAT	2	8	70130	70137	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015921	A	7	7	70230	70236	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015921	AAG	2	6	70263	70268	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015921	TAA	2	6	70320	70325	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015921	ATAAA	2	10	70326	70335	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015921	TG	3	6	70350	70355	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_015921	TTG	2	6	70359	70364	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015921	TAA	2	6	72592	72597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015921	AAATA	2	10	72602	72611	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_015921	A	6	6	79319	79324	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015921	A	7	7	79350	79356	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015921	A	9	9	79370	79378	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015921	ATT	2	6	79381	79386	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015921	TAA	2	6	79390	79395	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015921	T	7	7	79407	79413	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_015921	A	6	6	79421	79426	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015921	ATA	2	6	79434	79439	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_015921	TAT	2	6	80828	80833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015921	TAA	2	6	80839	80844	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_015921	AAAAT	2	10	80852	80861	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_015921	TACA	2	8	83827	83834	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
134	NC_015921	ATT	2	6	85628	85633	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_015921	TG	3	6	85683	85688	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015921	AAT	2	6	85690	85695	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_015921	AATACT	2	12	85714	85725	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
138	NC_015921	C	7	7	85729	85735	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
139	NC_015921	AT	3	6	86743	86748	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_015921	ATA	2	6	86792	86797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_015921	ACA	2	6	93928	93933	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_015921	ATA	2	6	93939	93944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_015921	AGCA	2	8	93959	93966	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
144	NC_015921	A	6	6	94020	94025	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_015921	AAT	2	6	94042	94047	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_015921	TGA	2	6	94055	94060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
147	NC_015921	AT	3	6	94061	94066	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_015921	ATT	2	6	94076	94081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_015921	ATA	2	6	94086	94091	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_015921	ATA	2	6	98531	98536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_015921	A	6	6	98546	98551	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_015921	ATA	2	6	98592	98597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_015921	T	8	8	98612	98619	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_015921	A	7	7	98620	98626	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_015921	TAA	2	6	98638	98643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_015921	TAA	2	6	98661	98666	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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158	NC_015921	TAA	2	6	101192	101197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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181	NC_015921	A	9	9	114443	114451	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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279	NC_015921	A	6	6	170830	170835	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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288	NC_015921	AAC	2	6	178539	178544	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
289	NC_015921	ATA	3	9	178571	178579	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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292	NC_015921	TAAT	2	8	182532	182539	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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438	NC_015921	A	6	6	245299	245304	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
439	NC_015921	TGCA	2	8	246850	246857	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
440	NC_015921	A	6	6	246914	246919	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
441	NC_015921	A	6	6	246955	246960	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
442	NC_015921	AGAAA	2	10	247058	247067	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
443	NC_015921	TTAAT	2	10	248663	248672	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
444	NC_015921	CTA	2	6	248678	248683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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446	NC_015921	CAAA	2	8	250841	250848	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
447	NC_015921	A	7	7	250846	250852	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
448	NC_015921	ATTT	2	8	250859	250866	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
449	NC_015921	AAT	2	6	250946	250951	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
450	NC_015921	TAT	3	9	250995	251003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
451	NC_015921	TA	4	8	251628	251635	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
452	NC_015921	TAAAA	2	10	251653	251662	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
453	NC_015921	TTA	2	6	251688	251693	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
454	NC_015921	A	7	7	251710	251716	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
455	NC_015921	TAA	2	6	254848	254853	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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460	NC_015921	GTT	3	9	255007	255015	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
461	NC_015921	AACAA	2	10	262318	262327	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
462	NC_015921	TAA	2	6	262348	262353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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464	NC_015921	A	9	9	262464	262472	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
465	NC_015921	CTA	2	6	262478	262483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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471	NC_015921	A	6	6	268099	268104	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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484	NC_015921	TAA	2	6	275196	275201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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