MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Borrelia bissettii DN127 chromosome

Total Repeats: 1878

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_015921	A	6	6	703094	703099	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_015921	TA	4	8	703120	703127	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_015921	AT	3	6	704218	704223	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_015921	ATA	2	6	704227	704232	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_015921	A	7	7	708746	708752	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_015921	TTA	2	6	708759	708764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_015921	AG	3	6	708769	708774	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_015921	TTAT	2	8	709223	709230	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_015921	A	7	7	709231	709237	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_015921	TAT	2	6	709254	709259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_015921	CT	3	6	712341	712346	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1512	NC_015921	TTA	2	6	712362	712367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_015921	TAT	2	6	712368	712373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_015921	TTA	2	6	712395	712400	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_015921	T	6	6	712421	712426	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_015921	ATTT	2	8	712455	712462	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_015921	T	6	6	712465	712470	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_015921	TAT	2	6	712510	712515	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_015921	TAGAA	2	10	712523	712532	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_015921	GTT	2	6	712545	712550	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_015921	TTA	2	6	712557	712562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_015921	AGA	2	6	712581	712586	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_015921	TAA	2	6	716241	716246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_015921	T	6	6	716288	716293	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_015921	T	6	6	716306	716311	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_015921	T	9	9	716320	716328	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_015921	GAT	2	6	716368	716373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1528	NC_015921	ATTT	2	8	718648	718655	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_015921	T	6	6	718653	718658	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1530	NC_015921	GGT	2	6	718667	718672	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_015921	TACT	2	8	720598	720605	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1532	NC_015921	TAT	2	6	721707	721712	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1533	NC_015921	TATAA	2	10	721739	721748	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_015921	TAA	2	6	721758	721763	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1535	NC_015921	ATT	2	6	728062	728067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_015921	AG	3	6	728077	728082	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_015921	AGGC	2	8	728110	728117	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1538	NC_015921	TAC	2	6	728147	728152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1539	NC_015921	TAA	2	6	728153	728158	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_015921	GTA	2	6	728159	728164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_015921	TAT	2	6	728672	728677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1542	NC_015921	ATTATA	2	12	728687	728698	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_015921	TAT	2	6	728709	728714	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_015921	TA	3	6	728721	728726	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_015921	TTA	2	6	729281	729286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1546	NC_015921	CTA	2	6	729300	729305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1547	NC_015921	TAT	2	6	731398	731403	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1548	NC_015921	AATT	2	8	731414	731421	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_015921	TGA	2	6	731427	731432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_015921	T	7	7	731460	731466	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_015921	ATG	2	6	731507	731512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_015921	T	6	6	731520	731525	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_015921	T	7	7	731602	731608	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_015921	AGG	2	6	731622	731627	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1555	NC_015921	T	7	7	732850	732856	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_015921	ATT	2	6	732876	732881	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1557	NC_015921	ATT	2	6	736332	736337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_015921	T	6	6	736343	736348	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1559	NC_015921	ATT	2	6	736394	736399	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1560	NC_015921	TGAT	2	8	736402	736409	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1561	NC_015921	TTTTG	2	10	736411	736420	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_015921	AAT	2	6	736465	736470	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_015921	TTA	2	6	736525	736530	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_015921	T	6	6	736592	736597	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_015921	AT	5	10	737736	737745	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_015921	AGT	2	6	737773	737778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1567	NC_015921	GTA	2	6	737977	737982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_015921	ATTAT	2	10	740185	740194	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_015921	T	8	8	740205	740212	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_015921	ATTT	2	8	740235	740242	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_015921	AAT	2	6	740256	740261	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_015921	ATTA	2	8	742412	742419	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_015921	ATT	2	6	742426	742431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_015921	ATTTT	2	10	742446	742455	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1575	NC_015921	ACTA	2	8	742461	742468	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1576	NC_015921	AGC	2	6	742505	742510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1577	NC_015921	GTC	2	6	742528	742533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1578	NC_015921	TTA	2	6	742749	742754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1579	NC_015921	ATG	2	6	742768	742773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1580	NC_015921	TAT	2	6	745713	745718	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1581	NC_015921	AGG	2	6	747570	747575	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1582	NC_015921	TTA	2	6	748342	748347	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1583	NC_015921	T	6	6	748356	748361	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1584	NC_015921	AATA	2	8	748550	748557	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1585	NC_015921	T	7	7	748644	748650	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1586	NC_015921	A	7	7	748657	748663	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1587	NC_015921	AG	3	6	748666	748671	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1588	NC_015921	ATG	2	6	748672	748677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1589	NC_015921	AG	3	6	748730	748735	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1590	NC_015921	T	6	6	749738	749743	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1591	NC_015921	GATA	2	8	749744	749751	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1592	NC_015921	GCA	2	6	751622	751627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1593	NC_015921	T	6	6	751628	751633	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1594	NC_015921	ATT	2	6	751677	751682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1595	NC_015921	TTATTT	2	12	751690	751701	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1596	NC_015921	T	7	7	751713	751719	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1597	NC_015921	ATTTT	2	10	751746	751755	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1598	NC_015921	ATT	2	6	751765	751770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1599	NC_015921	CTT	2	6	751790	751795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1600	NC_015921	ATT	2	6	751800	751805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1601	NC_015921	T	6	6	751825	751830	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1602	NC_015921	AAT	2	6	751845	751850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1603	NC_015921	ATTTT	2	10	751851	751860	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_015921	AATAA	2	10	751864	751873	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_015921	T	6	6	751912	751917	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1606	NC_015921	TAT	2	6	751934	751939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1607	NC_015921	ATT	2	6	751988	751993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_015921	TTG	2	6	752012	752017	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_015921	ATT	2	6	752057	752062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_015921	ATT	2	6	752093	752098	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1611	NC_015921	T	8	8	752139	752146	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_015921	ATTT	2	8	755223	755230	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_015921	T	6	6	755235	755240	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1614	NC_015921	T	7	7	755256	755262	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1615	NC_015921	T	7	7	755269	755275	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1616	NC_015921	TGA	2	6	755331	755336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1617	NC_015921	AATTTT	2	12	755342	755353	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1618	NC_015921	T	6	6	755350	755355	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1619	NC_015921	AAT	2	6	759713	759718	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1620	NC_015921	ATA	2	6	759728	759733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_015921	TAA	2	6	759769	759774	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1622	NC_015921	AAC	2	6	759779	759784	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1623	NC_015921	AAATT	2	10	764279	764288	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1624	NC_015921	ATTA	2	8	767004	767011	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1625	NC_015921	TA	3	6	767015	767020	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1626	NC_015921	AT	4	8	767085	767092	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1627	NC_015921	AC	3	6	768698	768703	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1628	NC_015921	GT	3	6	771927	771932	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1629	NC_015921	TAA	2	6	771939	771944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1630	NC_015921	ATT	2	6	771973	771978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1631	NC_015921	TTAA	2	8	772020	772027	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1632	NC_015921	GGGT	2	8	772042	772049	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
1633	NC_015921	ATTG	2	8	772082	772089	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1634	NC_015921	T	6	6	772126	772131	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1635	NC_015921	TTTA	2	8	772165	772172	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1636	NC_015921	A	6	6	772187	772192	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1637	NC_015921	TTTGT	2	10	773063	773072	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
1638	NC_015921	TATT	2	8	773081	773088	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.