MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Borrelia bissettii DN127 plasmid lp28-7

Total Repeats: 384

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015918	ACA	2	6	35	40	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_015918	A	6	6	51	56	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015918	ATA	2	6	105	110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015918	ATT	2	6	117	122	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015918	ACA	3	9	123	131	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_015918	TACAAA	2	12	138	149	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_015918	AT	3	6	150	155	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015918	CTT	2	6	227	232	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_015918	T	6	6	251	256	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015918	T	6	6	1443	1448	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015918	A	8	8	1451	1458	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015918	TAA	2	6	1499	1504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015918	ACT	2	6	1519	1524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_015918	ATT	2	6	1544	1549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015918	AGG	2	6	1550	1555	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015918	ATT	2	6	2097	2102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015918	AAT	2	6	2109	2114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015918	CTA	2	6	2128	2133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_015918	A	7	7	2133	2139	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015918	CTT	3	9	2232	2240	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_015918	AAGTA	2	10	2261	2270	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015918	TTTCTT	2	12	2355	2366	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_015918	CAT	2	6	2374	2379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_015918	A	6	6	2440	2445	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015918	AACA	2	8	2475	2482	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_015918	T	6	6	2484	2489	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015918	CA	3	6	2535	2540	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_015918	TTTG	2	8	2650	2657	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015918	TTG	2	6	2677	2682	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015918	AGA	2	6	2698	2703	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015918	T	6	6	2707	2712	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015918	TA	3	6	2934	2939	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015918	ATTAA	2	10	2952	2961	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015918	ATA	2	6	2970	2975	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015918	AAAC	2	8	3016	3023	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_015918	T	6	6	3064	3069	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015918	ACT	3	9	3081	3089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_015918	TAT	2	6	3115	3120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015918	ATATT	2	10	3193	3202	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015918	TAT	2	6	3215	3220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015918	TA	3	6	3223	3228	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015918	AGG	2	6	3238	3243	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015918	CTTT	2	8	4297	4304	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_015918	T	6	6	4302	4307	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015918	TTA	2	6	4563	4568	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015918	A	6	6	4577	4582	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015918	T	7	7	4902	4908	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015918	TCT	2	6	4914	4919	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_015918	TATT	2	8	4985	4992	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015918	TAA	2	6	5001	5006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015918	TAA	2	6	5063	5068	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015918	ATC	2	6	5078	5083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_015918	TTG	2	6	5121	5126	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015918	AT	3	6	5155	5160	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015918	ATA	2	6	5178	5183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015918	GAA	2	6	5195	5200	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015918	TCT	2	6	5503	5508	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_015918	A	6	6	5526	5531	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015918	TAA	2	6	5655	5660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015918	TAA	2	6	5679	5684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015918	ATA	2	6	5687	5692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015918	TA	3	6	5773	5778	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015918	TAA	2	6	5785	5790	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015918	TAA	2	6	5798	5803	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015918	A	7	7	5802	5808	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015918	TTA	2	6	5809	5814	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015918	ATA	2	6	5826	5831	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015918	TCT	2	6	5865	5870	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_015918	TTAA	2	8	5940	5947	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015918	ATT	2	6	5971	5976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015918	T	7	7	5990	5996	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015918	ACT	2	6	6025	6030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_015918	A	8	8	6058	6065	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015918	TAA	2	6	6077	6082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015918	A	6	6	6081	6086	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015918	AAAC	2	8	6105	6112	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_015918	AAG	3	9	6120	6128	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015918	TAA	2	6	6133	6138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015918	AAG	2	6	6141	6146	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015918	AC	3	6	6150	6155	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_015918	AACA	3	12	6538	6549	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_015918	AC	3	6	6578	6583	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_015918	A	7	7	6600	6606	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015918	GAA	2	6	6609	6614	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015918	A	6	6	6626	6631	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015918	GTAT	2	8	6780	6787	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015918	TA	3	6	6796	6801	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015918	AAC	2	6	6850	6855	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_015918	T	6	6	6874	6879	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015918	TAA	2	6	6927	6932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015918	TAATA	2	10	6955	6964	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015918	ATT	2	6	7031	7036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015918	TAT	2	6	7055	7060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015918	AAAAT	2	10	7062	7071	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015918	TAATA	2	10	7079	7088	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015918	ATAA	2	8	7100	7107	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015918	ATA	2	6	7133	7138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015918	TAT	2	6	7208	7213	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015918	TCA	2	6	7247	7252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_015918	A	6	6	7287	7292	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015918	ATA	2	6	7309	7314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015918	GGA	2	6	7364	7369	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015918	AAT	2	6	7385	7390	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015918	TGA	2	6	7438	7443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015918	A	6	6	7459	7464	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015918	T	6	6	7493	7498	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015918	ATTAT	2	10	7505	7514	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015918	T	7	7	7533	7539	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015918	TAA	2	6	7541	7546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015918	TCT	2	6	7852	7857	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_015918	TAA	2	6	7868	7873	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015918	ATAA	2	8	7907	7914	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015918	AGAT	2	8	7927	7934	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015918	GCA	2	6	7948	7953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_015918	TAA	2	6	7980	7985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015918	ATTTAT	2	12	7997	8008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015918	T	6	6	8008	8013	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015918	T	6	6	8053	8058	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_015918	TTA	2	6	8100	8105	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015918	TTA	2	6	8145	8150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015918	TCT	2	6	8193	8198	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_015918	T	10	10	8198	8207	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015918	T	6	6	8212	8217	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015918	A	7	7	8245	8251	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015918	TAT	2	6	8256	8261	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015918	TAAAG	2	10	8325	8334	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015918	ATA	2	6	8339	8344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_015918	AGT	2	6	8357	8362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015918	CA	3	6	8396	8401	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_015918	ATT	2	6	8477	8482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015918	ATAA	2	8	8517	8524	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_015918	C	6	6	8546	8551	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
133	NC_015918	TGA	2	6	8761	8766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015918	A	6	6	8766	8771	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_015918	TTC	2	6	8786	8791	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_015918	TAAT	2	8	8828	8835	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_015918	TA	3	6	8897	8902	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_015918	TAAATT	2	12	8916	8927	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_015918	A	6	6	8951	8956	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_015918	ATAA	2	8	8975	8982	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_015918	TTA	2	6	8992	8997	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_015918	TAT	2	6	9033	9038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_015918	T	7	7	9171	9177	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_015918	ATTTG	2	10	9200	9209	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
145	NC_015918	TA	3	6	9257	9262	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_015918	TACT	2	8	9290	9297	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
147	NC_015918	AT	3	6	9369	9374	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_015918	T	7	7	9416	9422	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_015918	ATTTA	2	10	9441	9450	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_015918	ATT	2	6	9472	9477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_015918	TAAT	2	8	9499	9506	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_015918	TC	3	6	10574	10579	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
153	NC_015918	TAA	2	6	10630	10635	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_015918	TTA	2	6	10643	10648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_015918	ATT	2	6	10660	10665	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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157	NC_015918	ATT	2	6	10705	10710	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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159	NC_015918	TTA	2	6	10786	10791	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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161	NC_015918	TAAA	2	8	10824	10831	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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337	NC_015918	TAAA	2	8	25800	25807	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.