MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Borrelia bissettii DN127 plasmid lp28-3

Total Repeats: 376

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015916	ATA	2	6	106	111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015916	TAT	2	6	155	160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015916	ATA	2	6	207	212	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015916	TAT	2	6	226	231	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015916	ATT	2	6	232	237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015916	ATA	2	6	505	510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015916	ATA	2	6	514	519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015916	ATT	2	6	525	530	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015916	TTAT	2	8	579	586	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015916	TTATAA	2	12	613	624	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015916	ATAC	2	8	629	636	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_015916	AAC	2	6	710	715	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_015916	T	6	6	726	731	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015916	ATT	2	6	738	743	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015916	ATT	2	6	753	758	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015916	ATT	2	6	807	812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015916	TAA	2	6	835	840	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015916	ATT	2	6	857	862	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015916	AAC	2	6	925	930	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_015916	AAAT	2	8	952	959	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015916	ATT	2	6	1065	1070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015916	AAT	2	6	1102	1107	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015916	TAT	2	6	1138	1143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015916	TAAA	2	8	1145	1152	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015916	TTAA	2	8	1158	1165	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015916	T	6	6	1183	1188	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015916	A	6	6	1189	1194	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015916	ATA	2	6	1202	1207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015916	ATT	2	6	1239	1244	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015916	TTA	2	6	1245	1250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015916	ATA	2	6	1264	1269	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015916	A	6	6	2125	2130	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015916	TTA	2	6	2238	2243	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015916	TAA	2	6	2369	2374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015916	ACT	2	6	2379	2384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_015916	TTTAA	2	10	2397	2406	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015916	ATT	2	6	2431	2436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015916	AT	3	6	2441	2446	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015916	TAT	2	6	2466	2471	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015916	ATT	2	6	2554	2559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015916	A	6	6	2613	2618	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015916	ATCA	2	8	2626	2633	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_015916	TA	7	14	2634	2647	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015916	ACATAA	2	12	2665	2676	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_015916	A	6	6	2713	2718	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015916	TAA	2	6	2745	2750	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015916	GTTC	2	8	2791	2798	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_015916	ATG	2	6	2835	2840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015916	GT	3	6	2853	2858	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015916	TTG	2	6	2890	2895	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015916	T	6	6	2902	2907	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015916	AAAT	2	8	2932	2939	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015916	ATC	2	6	2953	2958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_015916	TCTT	2	8	3016	3023	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_015916	ACT	2	6	3133	3138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_015916	AATA	2	8	3139	3146	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015916	ATA	3	9	3192	3200	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015916	AAT	2	6	3225	3230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015916	T	6	6	3238	3243	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015916	A	6	6	3244	3249	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015916	TAAA	2	8	3273	3280	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015916	ATTT	2	8	3281	3288	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015916	TAA	2	6	3304	3309	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015916	ATT	2	6	3310	3315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015916	AT	4	8	3356	3363	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015916	T	6	6	3407	3412	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015916	TA	3	6	3463	3468	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015916	AT	3	6	3475	3480	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015916	T	6	6	3486	3491	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015916	T	7	7	3512	3518	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015916	A	6	6	3524	3529	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015916	AGA	2	6	3540	3545	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015916	TTTTG	2	10	3561	3570	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015916	ATT	2	6	3571	3576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015916	T	7	7	3575	3581	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015916	AATA	2	8	3602	3609	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015916	TAT	2	6	3618	3623	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015916	AT	3	6	3630	3635	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015916	TTA	2	6	3671	3676	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015916	TA	4	8	3713	3720	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015916	TAA	2	6	3743	3748	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015916	CTA	2	6	3845	3850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_015916	A	6	6	3869	3874	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015916	TCT	2	6	3882	3887	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_015916	ATA	2	6	3903	3908	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015916	ACTA	2	8	3934	3941	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_015916	TAA	2	6	3948	3953	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015916	A	6	6	3970	3975	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015916	A	7	7	4317	4323	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015916	TAA	2	6	4324	4329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015916	TAT	3	9	4330	4338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015916	ATT	2	6	4358	4363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015916	T	7	7	4384	4390	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015916	TTTA	2	8	4400	4407	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015916	GCAA	2	8	4413	4420	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
96	NC_015916	AT	3	6	4436	4441	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015916	AT	3	6	4448	4453	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015916	TA	3	6	4461	4466	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015916	TAT	2	6	4541	4546	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015916	TAT	2	6	4564	4569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015916	TAA	2	6	4576	4581	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015916	AAT	2	6	4583	4588	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015916	TTA	2	6	4606	4611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015916	TAA	2	6	4652	4657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015916	T	6	6	4667	4672	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015916	A	6	6	4676	4681	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015916	TTA	2	6	4808	4813	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015916	T	6	6	4821	4826	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015916	TTG	2	6	4839	4844	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015916	ATA	2	6	4863	4868	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015916	A	7	7	4868	4874	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015916	ATT	2	6	4889	4894	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015916	CTT	2	6	4901	4906	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_015916	AAAGA	2	10	4907	4916	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015916	TATT	2	8	4938	4945	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015916	TTA	2	6	4951	4956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015916	ATATT	2	10	4973	4982	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015916	TATT	2	8	4986	4993	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_015916	TTA	2	6	4999	5004	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015916	ATTA	2	8	5013	5020	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015916	AAT	2	6	5027	5032	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_015916	ATTT	2	8	5039	5046	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015916	TTTA	2	8	5078	5085	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015916	AAT	2	6	5122	5127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015916	TTTA	2	8	5136	5143	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015916	TTA	2	6	5373	5378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015916	TTA	3	9	5404	5412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_015916	ATA	2	6	5413	5418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015916	ATAA	2	8	5424	5431	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_015916	T	6	6	5453	5458	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015916	TTC	2	6	5506	5511	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_015916	ATA	2	6	5516	5521	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_015916	AGAA	2	8	5542	5549	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015916	TCT	2	6	5567	5572	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_015916	A	6	6	5573	5578	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015916	CTT	3	9	5863	5871	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_015916	TTATC	2	10	5872	5881	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
138	NC_015916	TA	3	6	5887	5892	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_015916	T	9	9	5909	5917	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_015916	ATT	2	6	5937	5942	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_015916	T	6	6	5941	5946	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_015916	T	7	7	5979	5985	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_015916	ATA	2	6	5996	6001	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_015916	TAAA	2	8	6003	6010	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_015916	ATTT	2	8	6015	6022	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_015916	TAC	3	9	6095	6103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_015916	CAT	2	6	6139	6144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_015916	TAT	2	6	6172	6177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_015916	TAA	2	6	6178	6183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_015916	TTTAAT	2	12	6195	6206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_015916	ACT	2	6	6228	6233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_015916	AT	3	6	6262	6267	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_015916	ATT	2	6	6300	6305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_015916	TTC	2	6	6334	6339	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
155	NC_015916	ATA	2	6	6431	6436	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_015916	AT	3	6	6438	6443	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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158	NC_015916	CTA	2	6	6487	6492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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287	NC_015916	TATT	3	12	18677	18688	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
288	NC_015916	AT	3	6	18694	18699	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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292	NC_015916	TA	3	6	19517	19522	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
293	NC_015916	ATT	2	6	19546	19551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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301	NC_015916	ATTA	2	8	19675	19682	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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366	NC_015916	T	7	7	23395	23401	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
367	NC_015916	A	7	7	24162	24168	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
368	NC_015916	T	6	6	24188	24193	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.