MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Borrelia bissettii DN127 plasmid lp17

Total Repeats: 427

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015915	T	8	8	8	15	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015915	TATT	3	12	47	58	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015915	T	6	6	81	86	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015915	T	6	6	89	94	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015915	TAAC	2	8	128	135	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_015915	ACA	2	6	142	147	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_015915	A	6	6	191	196	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015915	A	6	6	204	209	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015915	TAA	2	6	224	229	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015915	AGG	2	6	232	237	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015915	ATAA	2	8	448	455	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015915	T	7	7	486	492	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015915	AT	4	8	494	501	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015915	A	7	7	510	516	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015915	AAT	2	6	542	547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015915	AATA	2	8	569	576	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015915	CAAAAA	2	12	599	610	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_015915	ATT	2	6	667	672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015915	AAATTT	2	12	680	691	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015915	TAA	2	6	713	718	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015915	AT	3	6	738	743	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015915	TA	3	6	744	749	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015915	TTA	2	6	750	755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015915	ATT	2	6	763	768	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015915	T	6	6	767	772	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015915	ACA	2	6	809	814	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_015915	TTA	2	6	825	830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015915	AAT	2	6	893	898	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015915	AAGC	2	8	915	922	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_015915	ATTT	2	8	1001	1008	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015915	AT	3	6	1049	1054	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015915	A	7	7	1091	1097	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015915	ATT	2	6	1675	1680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015915	TAGC	2	8	1682	1689	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
35	NC_015915	TAT	2	6	1701	1706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015915	TA	3	6	1769	1774	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015915	AAT	2	6	1782	1787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015915	T	8	8	1817	1824	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015915	T	9	9	1826	1834	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015915	AT	5	10	1839	1848	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015915	TA	3	6	1876	1881	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015915	TTC	2	6	1910	1915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_015915	TTA	2	6	2031	2036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015915	A	7	7	2038	2044	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015915	TTA	2	6	2067	2072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015915	TAT	2	6	2094	2099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015915	T	6	6	2099	2104	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015915	ATA	2	6	2115	2120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015915	A	6	6	2126	2131	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015915	TAA	2	6	2234	2239	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015915	TTTAA	2	10	2240	2249	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015915	T	7	7	2252	2258	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015915	AATTAA	2	12	2294	2305	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015915	ATA	2	6	2318	2323	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015915	ATTA	2	8	2579	2586	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015915	CAAA	2	8	2661	2668	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_015915	TTA	2	6	2702	2707	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015915	AATT	2	8	2855	2862	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015915	AATT	2	8	2913	2920	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015915	TTC	2	6	2943	2948	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_015915	TAT	2	6	2973	2978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015915	ATT	2	6	2997	3002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015915	TTA	2	6	3016	3021	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015915	ATAGCT	2	12	3033	3044	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_015915	A	6	6	3086	3091	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015915	AATTA	2	10	3123	3132	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015915	TATC	2	8	3136	3143	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_015915	ACA	2	6	3178	3183	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_015915	AAT	2	6	3193	3198	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015915	TATCAT	7	42	3266	3307	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_015915	TATCAT	2	12	3326	3337	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_015915	TATCAT	2	12	3344	3355	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_015915	TATCAT	4	24	3362	3385	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_015915	TATCTT	4	24	3386	3409	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_015915	T	8	8	3415	3422	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015915	T	6	6	3457	3462	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015915	A	6	6	3478	3483	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015915	A	7	7	3491	3497	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015915	AT	3	6	3512	3517	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015915	T	9	9	3544	3552	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015915	TAAAC	2	10	3645	3654	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
82	NC_015915	TTAAT	2	10	3688	3697	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015915	CTT	2	6	3714	3719	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_015915	TTAAAT	2	12	3757	3768	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015915	AT	3	6	3767	3772	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015915	ACTT	2	8	3782	3789	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_015915	AGTT	2	8	4142	4149	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015915	AT	3	6	4201	4206	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015915	CTC	2	6	4223	4228	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_015915	AAAT	2	8	4246	4253	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015915	TTA	2	6	4286	4291	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015915	A	8	8	4339	4346	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015915	AAATT	2	10	4350	4359	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015915	A	6	6	4360	4365	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015915	TAA	2	6	4567	4572	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015915	A	6	6	4588	4593	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015915	TA	3	6	4594	4599	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015915	A	6	6	4619	4624	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015915	TA	3	6	4625	4630	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015915	AAG	2	6	4636	4641	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015915	TAA	2	6	4966	4971	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015915	TCT	2	6	4973	4978	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_015915	TAT	2	6	4984	4989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015915	TAA	2	6	5003	5008	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015915	A	6	6	5016	5021	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015915	T	6	6	5043	5048	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015915	CAAA	2	8	5065	5072	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
108	NC_015915	ACC	2	6	5116	5121	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
109	NC_015915	CAAA	2	8	5134	5141	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
110	NC_015915	TTA	2	6	5154	5159	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015915	A	7	7	5183	5189	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015915	CAT	2	6	5202	5207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_015915	TAA	2	6	5230	5235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015915	A	7	7	5234	5240	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015915	T	6	6	5243	5248	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015915	CAAAAC	2	12	5295	5306	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_015915	TATT	2	8	5312	5319	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015915	T	6	6	5377	5382	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_015915	ATT	2	6	5388	5393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015915	ATT	2	6	5409	5414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015915	ATT	3	9	5419	5427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_015915	ATT	3	9	5438	5446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015915	AATTAA	2	12	5450	5461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015915	TATT	2	8	5462	5469	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015915	TAA	2	6	6363	6368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015915	T	6	6	6382	6387	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015915	TTC	2	6	6403	6408	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_015915	T	8	8	6411	6418	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015915	ATA	3	9	6479	6487	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_015915	AT	3	6	6492	6497	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015915	ATATA	2	10	6508	6517	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_015915	AAT	2	6	6533	6538	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_015915	GAA	2	6	6551	6556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015915	ATAGTA	2	12	6610	6621	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
135	NC_015915	A	6	6	6666	6671	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015915	AATA	2	8	6693	6700	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_015915	GTT	2	6	6702	6707	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_015915	ACA	2	6	6764	6769	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_015915	A	6	6	6793	6798	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_015915	AAT	2	6	6801	6806	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_015915	TAA	2	6	6812	6817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_015915	T	6	6	6830	6835	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_015915	AGT	3	9	6848	6856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
144	NC_015915	A	7	7	6857	6863	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_015915	CTA	2	6	6896	6901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_015915	TAT	2	6	6907	6912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_015915	TA	3	6	6934	6939	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_015915	AT	3	6	6943	6948	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_015915	ATT	2	6	6975	6980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_015915	TAA	2	6	7009	7014	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_015915	T	7	7	7029	7035	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_015915	AAG	2	6	7041	7046	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
153	NC_015915	T	6	6	8070	8075	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_015915	ATT	3	9	8112	8120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_015915	TTC	2	6	8124	8129	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
156	NC_015915	TAAA	2	8	8136	8143	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_015915	AAAT	2	8	8148	8155	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_015915	AT	5	10	8175	8184	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_015915	TTAT	2	8	8258	8265	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_015915	A	6	6	8276	8281	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_015915	AAT	2	6	8284	8289	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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163	NC_015915	TAG	2	6	8322	8327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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165	NC_015915	T	6	6	8475	8480	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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167	NC_015915	TCC	2	6	8552	8557	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
168	NC_015915	TTG	2	6	8666	8671	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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170	NC_015915	CTTT	2	8	8730	8737	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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172	NC_015915	TAA	2	6	8759	8764	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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175	NC_015915	TGA	2	6	9170	9175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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180	NC_015915	TGA	2	6	9239	9244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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193	NC_015915	A	6	6	9793	9798	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
194	NC_015915	AT	3	6	9840	9845	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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196	NC_015915	AC	3	6	10061	10066	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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289	NC_015915	ATA	2	6	18319	18324	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
290	NC_015915	T	6	6	18382	18387	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
291	NC_015915	AAG	2	6	18442	18447	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
292	NC_015915	A	6	6	18450	18455	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
293	NC_015915	TAT	2	6	18456	18461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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296	NC_015915	TAAA	2	8	18504	18511	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
297	NC_015915	AATT	2	8	18519	18526	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
298	NC_015915	AAAT	2	8	18545	18552	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
299	NC_015915	TA	3	6	18582	18587	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
300	NC_015915	AAGA	2	8	18605	18612	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
301	NC_015915	A	7	7	18621	18627	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
302	NC_015915	TTA	2	6	18639	18644	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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306	NC_015915	GTT	2	6	18795	18800	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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346	NC_015915	TAA	2	6	22266	22271	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.