MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Borrelia bissettii DN127 plasmid cp32-6

Total Repeats: 131

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015905	TAA	2	6	46	51	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015905	AGG	2	6	3359	3364	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015905	TAG	2	6	3528	3533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015905	ATC	2	6	3551	3556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_015905	AGG	2	6	3951	3956	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015905	TAAT	2	8	12435	12442	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015905	T	6	6	13673	13678	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015905	AT	3	6	13805	13810	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015905	TATC	2	8	13834	13841	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_015905	TGA	2	6	13922	13927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015905	TAC	2	6	13976	13981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_015905	TAA	2	6	14020	14025	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015905	AAAC	2	8	14026	14033	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_015905	TAC	2	6	14036	14041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_015905	ATTT	2	8	14042	14049	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015905	AGAAA	2	10	14096	14105	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015905	TGC	2	6	14114	14119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_015905	ATT	2	6	14193	14198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015905	TAA	3	9	14222	14230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015905	AAC	2	6	14256	14261	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_015905	AGG	2	6	14264	14269	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015905	T	6	6	15089	15094	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015905	TA	3	6	15115	15120	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015905	TAAAAA	2	12	15130	15141	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015905	CAAT	2	8	16448	16455	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_015905	ATA	2	6	16468	16473	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015905	CTA	2	6	17049	17054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_015905	ATA	2	6	17080	17085	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015905	TAA	3	9	17131	17139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015905	TCC	2	6	18656	18661	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_015905	TTTA	2	8	18662	18669	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015905	TAA	2	6	18671	18676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015905	TA	3	6	18684	18689	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015905	CTT	2	6	18710	18715	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_015905	A	7	7	18731	18737	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015905	TAT	2	6	18785	18790	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015905	T	7	7	18790	18796	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015905	TAAA	2	8	18806	18813	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015905	TTAAA	2	10	18871	18880	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015905	TTAAT	2	10	18917	18926	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015905	TAA	2	6	18932	18937	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015905	T	8	8	18951	18958	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015905	TAA	2	6	18996	19001	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015905	ATT	2	6	19005	19010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015905	TAAA	2	8	19017	19024	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015905	A	6	6	19029	19034	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015905	AGG	2	6	21473	21478	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015905	TAA	2	6	22695	22700	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015905	TA	3	6	22706	22711	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015905	T	6	6	22736	22741	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015905	TTTTA	2	10	22765	22774	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015905	ACAAAT	2	12	22775	22786	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_015905	TTAT	2	8	22830	22837	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015905	TAA	2	6	22846	22851	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015905	TTA	2	6	22875	22880	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015905	ATTA	2	8	22914	22921	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015905	TAA	2	6	22922	22927	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015905	TA	4	8	22961	22968	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015905	A	6	6	22984	22989	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015905	A	7	7	23003	23009	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015905	TAAG	2	8	23053	23060	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015905	T	6	6	23069	23074	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015905	AAG	2	6	23090	23095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015905	TA	3	6	23116	23121	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015905	TATT	2	8	23126	23133	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015905	TAAA	2	8	23136	23143	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015905	GGA	2	6	23144	23149	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015905	TAG	2	6	23644	23649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015905	CAA	2	6	23653	23658	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_015905	GATG	2	8	23661	23668	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015905	AAT	2	6	23676	23681	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015905	T	6	6	23768	23773	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015905	AGT	2	6	23775	23780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015905	T	6	6	23786	23791	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015905	GCA	2	6	23868	23873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_015905	TAA	2	6	23933	23938	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015905	A	7	7	23963	23969	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015905	AG	3	6	23988	23993	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015905	CA	3	6	24007	24012	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_015905	TGG	2	6	24040	24045	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015905	TAG	2	6	24052	24057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015905	GAGTT	2	10	24082	24091	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015905	GCT	2	6	24156	24161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_015905	A	6	6	24476	24481	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015905	AAAG	2	8	24484	24491	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015905	T	7	7	25586	25592	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015905	AGA	2	6	25598	25603	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015905	AAGTAA	2	12	25757	25768	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015905	A	6	6	25780	25785	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015905	CAAAAA	2	12	25803	25814	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_015905	TA	3	6	25920	25925	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015905	AATTT	2	10	25955	25964	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015905	GA	3	6	26010	26015	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015905	TTAA	2	8	26026	26033	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015905	A	6	6	26099	26104	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015905	ATT	2	6	26110	26115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015905	TAAA	2	8	27221	27228	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015905	A	8	8	27226	27233	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015905	A	7	7	27250	27256	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015905	TAT	2	6	27257	27262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015905	T	8	8	27269	27276	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015905	A	6	6	27310	27315	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015905	T	6	6	27356	27361	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015905	GAA	2	6	27375	27380	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015905	ATT	3	9	27381	27389	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015905	TTGT	2	8	27397	27404	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015905	CTAT	2	8	27412	27419	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
108	NC_015905	TAA	2	6	27435	27440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015905	TAA	2	6	27471	27476	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015905	CAAC	2	8	27526	27533	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_015905	A	6	6	27542	27547	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015905	AAG	2	6	27578	27583	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_015905	A	7	7	27643	27649	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015905	AAG	2	6	27656	27661	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015905	AT	3	6	27675	27680	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015905	GATT	2	8	27714	27721	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015905	AAGG	2	8	27730	27737	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015905	AGA	2	6	27744	27749	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_015905	GAA	2	6	27769	27774	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015905	AGTT	2	8	27780	27787	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015905	T	6	6	27786	27791	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_015905	GATAA	2	10	27814	27823	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015905	A	6	6	27827	27832	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015905	AT	3	6	27875	27880	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015905	ACT	2	6	27896	27901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_015905	AGT	2	6	27922	27927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015905	TAGA	2	8	27965	27972	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_015905	ATA	2	6	27991	27996	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015905	TAA	2	6	28063	28068	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_015905	CTT	2	6	28072	28077	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_015905	CAA	2	6	28087	28092	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.