MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Borrelia bissettii DN127 plasmid cp32-4

Total Repeats: 76

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015904	TAA	2	6	46	51	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015904	AGG	2	6	3359	3364	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015904	AGG	2	6	3953	3958	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015904	TA	3	6	15174	15179	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015904	TA	3	6	15183	15188	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015904	A	6	6	15194	15199	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015904	CAAT	2	8	16504	16511	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_015904	ATA	2	6	16524	16529	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015904	CTA	2	6	17105	17110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_015904	ATA	2	6	17136	17141	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015904	TAA	3	9	17187	17195	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015904	TAATA	2	10	17654	17663	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015904	TCC	2	6	18695	18700	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_015904	AAT	2	6	18713	18718	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015904	CTT	2	6	18745	18750	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_015904	A	7	7	18766	18772	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015904	CTA	2	6	18792	18797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_015904	TAT	2	6	18820	18825	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015904	T	7	7	18825	18831	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015904	TAA	2	6	18873	18878	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015904	TTAAA	2	10	18906	18915	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015904	TTAAT	2	10	18952	18961	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015904	TAA	2	6	18967	18972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015904	T	7	7	18986	18992	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015904	ATTAT	2	10	19026	19035	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015904	TAA	2	6	19039	19044	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015904	TTA	2	6	19046	19051	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015904	A	6	6	19064	19069	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015904	AGG	2	6	21516	21521	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015904	TAA	2	6	22680	22685	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015904	TA	3	6	22691	22696	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015904	T	6	6	22721	22726	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015904	TTTTA	2	10	22750	22759	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015904	ACAAAT	2	12	22760	22771	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_015904	TCAAT	2	10	22794	22803	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
36	NC_015904	AAT	2	6	22822	22827	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015904	TAA	2	6	22831	22836	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015904	TAA	2	6	22886	22891	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015904	TATT	2	8	22898	22905	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015904	A	6	6	22920	22925	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015904	AAT	2	6	22935	22940	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015904	TA	4	8	22947	22954	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015904	A	6	6	22970	22975	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015904	A	7	7	22989	22995	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015904	T	7	7	23055	23061	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015904	AAG	2	6	23077	23082	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015904	ATT	2	6	23109	23114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015904	AGG	2	6	23126	23131	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015904	A	6	6	24475	24480	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015904	AAAG	2	8	24483	24490	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015904	AAGTAA	2	12	25757	25768	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015904	AG	3	6	25830	25835	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015904	TGCA	2	8	25843	25850	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_015904	GTGG	2	8	25867	25874	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015904	GGT	2	6	25901	25906	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015904	AAGA	2	8	25911	25918	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015904	AT	3	6	25935	25940	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_015904	AATTT	2	10	25955	25964	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015904	GA	3	6	26010	26015	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015904	A	6	6	26099	26104	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015904	TATT	2	8	26108	26115	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015904	GCGTT	2	10	26118	26127	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
63	NC_015904	GA	3	6	26144	26149	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015904	AAT	2	6	26697	26702	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015904	ATAA	2	8	27730	27737	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015904	A	6	6	27766	27771	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015904	GTT	2	6	27778	27783	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015904	T	8	8	27785	27792	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015904	ATT	2	6	27802	27807	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015904	A	6	6	27845	27850	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015904	TTTA	2	8	27878	27885	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015904	TA	3	6	27884	27889	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015904	CT	3	6	27890	27895	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_015904	TAA	2	6	28451	28456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015904	AATA	2	8	28492	28499	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015904	ATT	3	9	28561	28569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.