MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Buchnera aphidicola (Cinara tujafilina) chromosome

Total Repeats: 4861

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015662	T	7	7	1939	1945	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015662	TTTATT	2	12	1960	1971	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015662	AT	3	6	1974	1979	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015662	AT	3	6	1985	1990	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015662	AGT	2	6	1999	2004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_015662	ATT	2	6	2005	2010	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015662	T	6	6	2024	2029	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_015662	AT	3	6	2061	2066	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015662	TTA	2	6	2072	2077	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015662	ATTAA	2	10	4518	4527	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015662	T	7	7	4529	4535	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015662	T	6	6	4544	4549	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015662	TAAA	2	8	4557	4564	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015662	ATTT	2	8	4573	4580	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015662	T	6	6	4590	4595	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_015662	T	6	6	4608	4613	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_015662	ATA	2	6	4616	4621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015662	TAT	2	6	5735	5740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015662	GATAA	2	10	5751	5760	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015662	A	8	8	7125	7132	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_015662	AT	3	6	7152	7157	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015662	AT	4	8	7177	7184	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_015662	ATT	2	6	7198	7203	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015662	TAT	2	6	7222	7227	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_015662	TTTAA	2	10	7228	7237	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_015662	T	8	8	7263	7270	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_015662	TTA	2	6	7315	7320	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_015662	ATTTA	2	10	7332	7341	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015662	T	6	6	7342	7347	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015662	TTAAT	2	10	7357	7366	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_015662	TAA	2	6	7370	7375	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015662	ATA	2	6	7379	7384	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015662	TA	4	8	7393	7400	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015662	AT	3	6	7429	7434	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015662	TAAGT	2	10	7437	7446	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015662	TTA	2	6	7452	7457	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015662	TTA	2	6	7468	7473	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015662	TAA	2	6	7637	7642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_015662	T	6	6	7996	8001	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015662	T	7	7	8036	8042	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015662	T	6	6	8057	8062	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015662	TAA	2	6	9724	9729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015662	ATT	2	6	9741	9746	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015662	ATT	2	6	9749	9754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015662	AAT	2	6	9766	9771	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015662	CTT	2	6	9784	9789	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_015662	T	6	6	11191	11196	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015662	AT	3	6	11209	11214	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015662	CCG	2	6	11247	11252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_015662	T	6	6	11341	11346	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015662	ATT	2	6	11356	11361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015662	TAA	2	6	11372	11377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015662	ATT	2	6	11423	11428	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015662	T	8	8	11436	11443	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015662	A	6	6	11444	11449	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015662	ATA	2	6	11459	11464	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015662	AC	3	6	11475	11480	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_015662	AT	3	6	11505	11510	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015662	AT	3	6	11525	11530	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015662	T	6	6	11536	11541	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_015662	ATA	2	6	11542	11547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015662	A	6	6	11556	11561	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_015662	TAA	2	6	11573	11578	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015662	TA	3	6	11897	11902	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015662	ATT	2	6	11932	11937	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015662	TTA	2	6	11941	11946	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_015662	AAATA	2	10	11949	11958	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_015662	A	6	6	11964	11969	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_015662	TAATAT	2	12	11990	12001	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015662	T	7	7	12034	12040	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015662	T	7	7	13717	13723	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_015662	TTAT	2	8	13726	13733	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015662	TAT	2	6	13755	13760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_015662	TATT	2	8	13766	13773	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_015662	TTA	2	6	13775	13780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015662	TTTATT	2	12	13832	13843	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_015662	T	7	7	13864	13870	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015662	T	7	7	13879	13885	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015662	GTA	2	6	13887	13892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015662	A	7	7	13922	13928	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015662	T	6	6	14458	14463	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015662	TA	4	8	14469	14476	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015662	ATA	3	9	14478	14486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_015662	T	6	6	15194	15199	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015662	T	6	6	15202	15207	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_015662	A	6	6	15208	15213	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_015662	AT	3	6	15220	15225	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_015662	TAA	2	6	15259	15264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015662	T	6	6	15268	15273	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_015662	AT	3	6	15278	15283	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015662	TAA	2	6	15296	15301	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015662	AT	4	8	15302	15309	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015662	T	7	7	15340	15346	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_015662	TAT	2	6	15355	15360	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015662	AT	4	8	15359	15366	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015662	T	6	6	15393	15398	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015662	TATTAA	3	18	15403	15420	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015662	ATTT	2	8	15447	15454	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015662	ATA	2	6	15462	15467	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015662	AATT	2	8	15479	15486	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015662	T	6	6	15510	15515	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015662	GTAT	2	8	15539	15546	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015662	T	6	6	15551	15556	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015662	AAAT	2	8	15568	15575	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015662	T	13	13	15598	15610	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015662	TGTA	2	8	16138	16145	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015662	ATA	2	6	16151	16156	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015662	AAT	2	6	16168	16173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015662	A	8	8	16186	16193	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015662	T	9	9	16194	16202	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_015662	A	8	8	16219	16226	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015662	GTCA	2	8	16246	16253	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
113	NC_015662	A	10	10	16258	16267	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015662	A	6	6	16271	16276	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_015662	T	6	6	16282	16287	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_015662	TAT	2	6	16291	16296	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015662	AAAAT	2	10	16300	16309	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015662	ATT	2	6	16327	16332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_015662	A	8	8	16343	16350	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015662	A	6	6	16360	16365	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_015662	ATA	2	6	16369	16374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_015662	T	8	8	16375	16382	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015662	A	6	6	16383	16388	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015662	ATT	4	12	16424	16435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015662	CTA	2	6	16453	16458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_015662	A	10	10	16482	16491	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_015662	AAAG	2	8	16517	16524	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_015662	AT	4	8	17246	17253	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015662	A	8	8	17282	17289	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_015662	TAA	2	6	17298	17303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015662	T	6	6	17331	17336	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_015662	TAAT	2	8	17345	17352	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_015662	TAT	2	6	17356	17361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_015662	T	6	6	17384	17389	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_015662	TA	3	6	17398	17403	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015662	A	6	6	17408	17413	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_015662	T	7	7	17416	17422	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_015662	TTA	2	6	17443	17448	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_015662	TTA	2	6	18354	18359	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_015662	TAAA	2	8	18368	18375	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_015662	T	6	6	18388	18393	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_015662	T	6	6	18408	18413	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_015662	AT	3	6	18420	18425	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_015662	A	8	8	18434	18441	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_015662	TA	3	6	18450	18455	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_015662	TAT	2	6	18457	18462	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_015662	AT	4	8	18468	18475	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_015662	T	9	9	18486	18494	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_015662	TTA	2	6	18500	18505	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_015662	T	12	12	18542	18553	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_015662	T	6	6	18557	18562	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_015662	AAT	2	6	18563	18568	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_015662	GTT	2	6	18579	18584	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
154	NC_015662	TACTAT	2	12	18603	18614	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
155	NC_015662	TA	5	10	18619	18628	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_015662	T	8	8	18640	18647	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_015662	T	7	7	18649	18655	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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159	NC_015662	TA	3	6	18673	18678	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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179	NC_015662	T	6	6	25510	25515	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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181	NC_015662	TA	3	6	25534	25539	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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184	NC_015662	A	6	6	29598	29603	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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191	NC_015662	TA	3	6	30167	30172	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
192	NC_015662	TAA	2	6	30183	30188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
193	NC_015662	ATT	3	9	30690	30698	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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291	NC_015662	TAT	2	6	35414	35419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
292	NC_015662	T	8	8	35429	35436	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
293	NC_015662	T	6	6	35440	35445	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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295	NC_015662	ATTT	2	8	35456	35463	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
296	NC_015662	A	6	6	35492	35497	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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302	NC_015662	A	8	8	35612	35619	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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459	NC_015662	TTA	2	6	50561	50566	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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