MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Burkholderia sp. CCGE1001 chromosome 1

Total Repeats: 13137

< Previous12...15161718192021222324252627Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_015136	T	6	6	4016474	4016479	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13002	NC_015136	GCC	3	9	4016544	4016552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13003	NC_015136	GCCG	2	8	4016556	4016563	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13004	NC_015136	GCA	3	9	4018007	4018015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13005	NC_015136	GAC	2	6	4018543	4018548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13006	NC_015136	CGG	2	6	4018681	4018686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13007	NC_015136	ACTC	2	8	4018870	4018877	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
13008	NC_015136	ACTGTT	2	12	4018912	4018923	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
13009	NC_015136	CTT	2	6	4018925	4018930	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13010	NC_015136	CCG	2	6	4018979	4018984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13011	NC_015136	CGG	2	6	4018999	4019004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13012	NC_015136	TGC	2	6	4019021	4019026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13013	NC_015136	CCG	2	6	4019031	4019036	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13014	NC_015136	ACATT	2	10	4019059	4019068	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
13015	NC_015136	GAA	2	6	4019075	4019080	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13016	NC_015136	GGCCG	2	10	4024267	4024276	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
13017	NC_015136	TTGCG	2	10	4024728	4024737	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
13018	NC_015136	CCGG	2	8	4024771	4024778	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13019	NC_015136	CTG	2	6	4024800	4024805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13020	NC_015136	GCC	2	6	4026377	4026382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13021	NC_015136	AG	4	8	4028332	4028339	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13022	NC_015136	GC	3	6	4030274	4030279	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13023	NC_015136	GCC	2	6	4032735	4032740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13024	NC_015136	GAA	2	6	4032827	4032832	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13025	NC_015136	GT	3	6	4032834	4032839	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13026	NC_015136	CGA	2	6	4032843	4032848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13027	NC_015136	GCG	2	6	4032877	4032882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13028	NC_015136	TGCC	2	8	4032907	4032914	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13029	NC_015136	GGC	2	6	4033317	4033322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13030	NC_015136	A	6	6	4033328	4033333	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13031	NC_015136	TAATA	2	10	4033382	4033391	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
13032	NC_015136	GTT	2	6	4033443	4033448	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13033	NC_015136	CGG	2	6	4033452	4033457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13034	NC_015136	CG	3	6	4033460	4033465	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13035	NC_015136	CTG	2	6	4033480	4033485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13036	NC_015136	TCTG	2	8	4034087	4034094	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
13037	NC_015136	GAG	2	6	4034167	4034172	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13038	NC_015136	AAC	2	6	4034173	4034178	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13039	NC_015136	GC	4	8	4035779	4035786	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13040	NC_015136	AAT	2	6	4036426	4036431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13041	NC_015136	CGA	2	6	4036436	4036441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13042	NC_015136	A	6	6	4036497	4036502	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13043	NC_015136	GGC	2	6	4036541	4036546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13044	NC_015136	GCT	2	6	4036581	4036586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13045	NC_015136	GCC	2	6	4038230	4038235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13046	NC_015136	CG	3	6	4038242	4038247	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13047	NC_015136	GT	3	6	4038372	4038377	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13048	NC_015136	CGC	2	6	4038383	4038388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13049	NC_015136	GCCG	2	8	4038448	4038455	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13050	NC_015136	GCC	2	6	4038539	4038544	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13051	NC_015136	GC	3	6	4040766	4040771	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13052	NC_015136	GT	3	6	4040860	4040865	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13053	NC_015136	TCC	2	6	4040881	4040886	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13054	NC_015136	TCC	2	6	4040892	4040897	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13055	NC_015136	T	7	7	4040933	4040939	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13056	NC_015136	AGG	2	6	4041036	4041041	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13057	NC_015136	CG	3	6	4041483	4041488	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13058	NC_015136	GCA	2	6	4041547	4041552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13059	NC_015136	TCCC	2	8	4042217	4042224	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
13060	NC_015136	ATG	2	6	4043275	4043280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13061	NC_015136	GCACAT	2	12	4044847	4044858	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
13062	NC_015136	TTTCGC	2	12	4045981	4045992	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
13063	NC_015136	CGG	2	6	4045996	4046001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13064	NC_015136	GCCGC	2	10	4046002	4046011	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
13065	NC_015136	CAC	2	6	4046072	4046077	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13066	NC_015136	T	7	7	4046083	4046089	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13067	NC_015136	GCCG	2	8	4047676	4047683	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13068	NC_015136	AC	3	6	4047738	4047743	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13069	NC_015136	GAT	2	6	4050604	4050609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13070	NC_015136	T	8	8	4050622	4050629	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13071	NC_015136	GT	3	6	4050636	4050641	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13072	NC_015136	CGG	2	6	4050666	4050671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13073	NC_015136	T	6	6	4050695	4050700	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13074	NC_015136	TAT	2	6	4050768	4050773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13075	NC_015136	GCGT	2	8	4050780	4050787	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
13076	NC_015136	GAC	2	6	4050788	4050793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13077	NC_015136	TCC	2	6	4051162	4051167	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13078	NC_015136	AAC	2	6	4051250	4051255	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13079	NC_015136	TG	3	6	4051266	4051271	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13080	NC_015136	GCG	2	6	4051283	4051288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13081	NC_015136	CG	3	6	4051300	4051305	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13082	NC_015136	GCG	2	6	4051340	4051345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13083	NC_015136	TAC	2	6	4051448	4051453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13084	NC_015136	CA	3	6	4051479	4051484	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13085	NC_015136	TCG	2	6	4051497	4051502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13086	NC_015136	CACG	2	8	4051503	4051510	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
13087	NC_015136	AGA	2	6	4051534	4051539	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13088	NC_015136	GCG	2	6	4051837	4051842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13089	NC_015136	GT	3	6	4051844	4051849	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13090	NC_015136	GC	3	6	4051868	4051873	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13091	NC_015136	TCT	2	6	4052332	4052337	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13092	NC_015136	ACTC	2	8	4053025	4053032	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
13093	NC_015136	GCC	2	6	4055820	4055825	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13094	NC_015136	CG	3	6	4055832	4055837	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13095	NC_015136	GCC	2	6	4055838	4055843	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13096	NC_015136	GCG	2	6	4055844	4055849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13097	NC_015136	CGT	2	6	4055865	4055870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13098	NC_015136	GCA	2	6	4055879	4055884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13099	NC_015136	CG	3	6	4055893	4055898	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13100	NC_015136	CGG	2	6	4055928	4055933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13101	NC_015136	GC	4	8	4056289	4056296	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13102	NC_015136	GC	4	8	4056302	4056309	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13103	NC_015136	ACAG	2	8	4056318	4056325	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
13104	NC_015136	CTG	2	6	4056338	4056343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13105	NC_015136	GCC	2	6	4056366	4056371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13106	NC_015136	CCT	2	6	4056551	4056556	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13107	NC_015136	GATT	2	8	4056589	4056596	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13108	NC_015136	GCG	2	6	4056610	4056615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13109	NC_015136	GC	3	6	4056631	4056636	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13110	NC_015136	GCAT	2	8	4056715	4056722	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13111	NC_015136	A	6	6	4056737	4056742	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13112	NC_015136	CTG	2	6	4056755	4056760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13113	NC_015136	AGA	2	6	4059581	4059586	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13114	NC_015136	GGC	2	6	4059587	4059592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13115	NC_015136	GCAG	2	8	4059610	4059617	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13116	NC_015136	CG	3	6	4059618	4059623	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13117	NC_015136	CG	3	6	4059628	4059633	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13118	NC_015136	CG	4	8	4059650	4059657	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13119	NC_015136	TGG	2	6	4059659	4059664	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13120	NC_015136	GGTC	2	8	4059673	4059680	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
13121	NC_015136	AAGC	2	8	4059732	4059739	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
13122	NC_015136	TAC	2	6	4059749	4059754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13123	NC_015136	CGG	2	6	4059840	4059845	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13124	NC_015136	CGT	2	6	4060366	4060371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13125	NC_015136	A	6	6	4060392	4060397	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13126	NC_015136	GCC	2	6	4060398	4060403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13127	NC_015136	GGC	2	6	4060419	4060424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13128	NC_015136	GAC	2	6	4062440	4062445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13129	NC_015136	CCG	2	6	4062448	4062453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13130	NC_015136	GCA	2	6	4062460	4062465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13131	NC_015136	GCG	2	6	4062466	4062471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13132	NC_015136	CGG	2	6	4062473	4062478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13133	NC_015136	A	8	8	4063230	4063237	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13134	NC_015136	CG	3	6	4063239	4063244	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13135	NC_015136	ATC	2	6	4063245	4063250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13136	NC_015136	C	6	6	4063347	4063352	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
13137	NC_015136	GAT	2	6	4063375	4063380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

< Previous12...15161718192021222324252627Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.