MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Bifidobacterium longum subsp. longum JCM 1217 chromosome

Total Repeats: 6533

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_015067	AC	3	6	1709102	1709107	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4502	NC_015067	CAT	2	6	1710524	1710529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4503	NC_015067	TCAG	2	8	1710549	1710556	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4504	NC_015067	GCTA	2	8	1710601	1710608	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4505	NC_015067	TCCT	2	8	1713239	1713246	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4506	NC_015067	GAG	2	6	1713320	1713325	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4507	NC_015067	AGG	2	6	1713371	1713376	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4508	NC_015067	ACGC	2	8	1714375	1714382	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4509	NC_015067	GGA	2	6	1714402	1714407	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4510	NC_015067	CCTT	2	8	1716052	1716059	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4511	NC_015067	ATGG	2	8	1718123	1718130	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4512	NC_015067	GCA	2	6	1719543	1719548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4513	NC_015067	GTT	2	6	1719633	1719638	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4514	NC_015067	GTT	2	6	1719657	1719662	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4515	NC_015067	TCC	2	6	1719669	1719674	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4516	NC_015067	GCC	2	6	1719701	1719706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4517	NC_015067	ATAC	2	8	1719707	1719714	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4518	NC_015067	A	6	6	1720069	1720074	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4519	NC_015067	TCC	2	6	1721765	1721770	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4520	NC_015067	GAC	2	6	1721815	1721820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4521	NC_015067	CGCC	2	8	1721883	1721890	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4522	NC_015067	CGG	2	6	1721906	1721911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4523	NC_015067	TGCG	2	8	1721978	1721985	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4524	NC_015067	AGAA	2	8	1722288	1722295	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4525	NC_015067	ATT	2	6	1722387	1722392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4526	NC_015067	CAA	2	6	1722453	1722458	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4527	NC_015067	TTC	2	6	1723154	1723159	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4528	NC_015067	TCA	2	6	1723197	1723202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4529	NC_015067	CCA	2	6	1723205	1723210	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4530	NC_015067	CAC	2	6	1723211	1723216	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4531	NC_015067	GTG	2	6	1723250	1723255	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4532	NC_015067	AGT	2	6	1723970	1723975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4533	NC_015067	G	6	6	1723982	1723987	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4534	NC_015067	GTT	2	6	1729262	1729267	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4535	NC_015067	GTCCT	2	10	1729495	1729504	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
4536	NC_015067	TCA	2	6	1731509	1731514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4537	NC_015067	TGA	2	6	1731518	1731523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4538	NC_015067	AGG	2	6	1731570	1731575	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4539	NC_015067	ACA	2	6	1731639	1731644	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4540	NC_015067	ATT	2	6	1731656	1731661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4541	NC_015067	AGAAGC	2	12	1731667	1731678	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
4542	NC_015067	TTG	2	6	1732135	1732140	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4543	NC_015067	C	7	7	1732157	1732163	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4544	NC_015067	GC	3	6	1732193	1732198	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4545	NC_015067	CA	3	6	1732874	1732879	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4546	NC_015067	CGGG	2	8	1732917	1732924	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4547	NC_015067	CGC	2	6	1732927	1732932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4548	NC_015067	TGCGA	2	10	1734424	1734433	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
4549	NC_015067	CCA	2	6	1734463	1734468	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4550	NC_015067	ACT	2	6	1734470	1734475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4551	NC_015067	AACCG	2	10	1734489	1734498	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
4552	NC_015067	TGA	2	6	1737190	1737195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4553	NC_015067	AAG	2	6	1737233	1737238	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4554	NC_015067	GAC	2	6	1737563	1737568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4555	NC_015067	CCGA	2	8	1737576	1737583	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4556	NC_015067	TGT	2	6	1737601	1737606	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4557	NC_015067	TAT	2	6	1737632	1737637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4558	NC_015067	CTT	3	9	1739313	1739321	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4559	NC_015067	TCAG	2	8	1739339	1739346	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4560	NC_015067	GGA	2	6	1739384	1739389	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4561	NC_015067	CTTGAG	2	12	1741991	1742002	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
4562	NC_015067	GC	3	6	1742670	1742675	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4563	NC_015067	TTC	2	6	1743573	1743578	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4564	NC_015067	ACT	2	6	1745142	1745147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4565	NC_015067	AGG	2	6	1747499	1747504	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4566	NC_015067	AGG	2	6	1748229	1748234	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4567	NC_015067	CCCG	2	8	1749239	1749246	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4568	NC_015067	GTC	2	6	1751085	1751090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4569	NC_015067	GCA	2	6	1751104	1751109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4570	NC_015067	AAT	2	6	1751225	1751230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4571	NC_015067	CA	3	6	1751257	1751262	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4572	NC_015067	TCC	2	6	1751279	1751284	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4573	NC_015067	C	6	6	1751316	1751321	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4574	NC_015067	TCG	2	6	1751700	1751705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4575	NC_015067	ATG	2	6	1751710	1751715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4576	NC_015067	TC	3	6	1751726	1751731	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4577	NC_015067	TTTA	2	8	1751843	1751850	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4578	NC_015067	GAA	2	6	1751926	1751931	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4579	NC_015067	GAT	2	6	1751935	1751940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4580	NC_015067	ATCC	2	8	1753273	1753280	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4581	NC_015067	CAG	2	6	1753318	1753323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4582	NC_015067	TCAC	2	8	1753325	1753332	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4583	NC_015067	ACA	2	6	1753347	1753352	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4584	NC_015067	AGA	2	6	1753353	1753358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4585	NC_015067	AC	4	8	1753359	1753366	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4586	NC_015067	GCG	2	6	1753388	1753393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4587	NC_015067	GCCA	2	8	1753498	1753505	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4588	NC_015067	GCG	2	6	1753514	1753519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4589	NC_015067	CCG	2	6	1753525	1753530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4590	NC_015067	TCCG	2	8	1753655	1753662	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4591	NC_015067	ATT	2	6	1753671	1753676	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4592	NC_015067	AGC	2	6	1753680	1753685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4593	NC_015067	GTT	2	6	1753708	1753713	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4594	NC_015067	TGG	2	6	1753714	1753719	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4595	NC_015067	ACGCT	2	10	1753731	1753740	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
4596	NC_015067	CT	3	6	1753739	1753744	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4597	NC_015067	CAG	2	6	1753776	1753781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4598	NC_015067	GAA	2	6	1753796	1753801	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4599	NC_015067	TCT	2	6	1753815	1753820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4600	NC_015067	AAGG	2	8	1753824	1753831	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4601	NC_015067	CGT	2	6	1753859	1753864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4602	NC_015067	TCAA	2	8	1754081	1754088	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4603	NC_015067	TCT	2	6	1754230	1754235	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4604	NC_015067	AAT	2	6	1754294	1754299	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4605	NC_015067	GGAA	2	8	1754340	1754347	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4606	NC_015067	CAAA	2	8	1756416	1756423	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4607	NC_015067	GAAG	2	8	1756460	1756467	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4608	NC_015067	AAG	2	6	1756552	1756557	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4609	NC_015067	ATT	2	6	1756612	1756617	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4610	NC_015067	ATC	2	6	1756720	1756725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4611	NC_015067	TAA	2	6	1756754	1756759	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4612	NC_015067	AGA	2	6	1756792	1756797	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4613	NC_015067	CT	4	8	1756804	1756811	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4614	NC_015067	TAT	2	6	1758371	1758376	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4615	NC_015067	CCT	2	6	1758377	1758382	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4616	NC_015067	GAA	2	6	1761643	1761648	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4617	NC_015067	A	7	7	1761729	1761735	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4621	NC_015067	ACC	2	6	1765368	1765373	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4622	NC_015067	GCC	2	6	1765488	1765493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4623	NC_015067	TTC	2	6	1765495	1765500	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4624	NC_015067	TCA	2	6	1765584	1765589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4625	NC_015067	TTCT	2	8	1765600	1765607	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4626	NC_015067	GGC	2	6	1765689	1765694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4627	NC_015067	ATT	2	6	1765717	1765722	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4628	NC_015067	GCAT	2	8	1766943	1766950	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4629	NC_015067	GCC	2	6	1766981	1766986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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4631	NC_015067	TCT	2	6	1768593	1768598	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4762	NC_015067	CGG	2	6	1817940	1817945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4763	NC_015067	GCT	2	6	1817977	1817982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4764	NC_015067	GCT	2	6	1817985	1817990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4765	NC_015067	TCT	3	9	1818035	1818043	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4767	NC_015067	GAAC	2	8	1819679	1819686	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4768	NC_015067	CCGT	2	8	1819702	1819709	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4769	NC_015067	CAA	2	6	1819725	1819730	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4777	NC_015067	ACATC	2	10	1826298	1826307	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
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4782	NC_015067	ATCGC	2	10	1826472	1826481	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
4783	NC_015067	ACA	2	6	1826508	1826513	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4884	NC_015067	CAT	2	6	1866452	1866457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4886	NC_015067	GC	3	6	1867868	1867873	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4887	NC_015067	A	6	6	1867898	1867903	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4888	NC_015067	CAA	2	6	1867970	1867975	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4889	NC_015067	TA	3	6	1867982	1867987	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4890	NC_015067	CGGCAC	2	12	1868306	1868317	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
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